ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 48

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016245	AAAG	3	1233	1243	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016245	AAG	4	1622	1632	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016245	AGA	4	2354	2365	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016245	TA	11	4069	4090	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016245	ACTTG	3	4186	4199	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016245	AT	6	4293	4303	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016245	TCTT	4	4407	4422	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016245	TAAG	3	5387	5397	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016245	TA	6	5608	5618	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016245	CTTT	3	6430	6441	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016245	AGT	4	6786	6797	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016245	TA	6	7215	7226	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016245	TAAG	4	7656	7671	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016245	TA	6	8266	8276	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016245	GGCT	3	8530	8540	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016245	TA	6	8819	8829	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016245	CTA	4	9412	9423	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016245	GCTT	3	9746	9756	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016245	GCA	4	10436	10447	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016245	AGA	4	11774	11785	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016245	ATCT	3	11862	11872	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016245	ATC	4	12395	12405	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016245	TAA	4	12564	12574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016245	TAC	4	12755	12766	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016245	CTTT	4	13159	13173	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016245	GAA	4	13456	13467	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016245	CAG	4	13729	13740	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016245	AAG	4	15148	15159	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016245	GA	6	15674	15684	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016245	GGAAA	3	15697	15711	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016245	GAG	4	15803	15814	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016245	CAG	4	16272	16283	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016245	TTC	4	17668	17680	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016245	CTTT	4	17993	18007	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016245	AT	6	18202	18212	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016245	AACC	3	18701	18711	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016245	AGA	4	19529	19539	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016245	TTC	4	19629	19639	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016245	CTT	4	21079	21091	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016245	TTTAA	3	23087	23100	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016245	GAAAA	3	24048	24061	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016245	TA	7	24170	24183	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016245	CTT	4	24438	24448	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016245	GCC	4	24771	24781	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016245	AT	8	25175	25189	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016245	GAAA	3	25463	25474	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016245	AAAG	3	26944	26954	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016245	AT	6	27910	27920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016245	GTTG	3	28289	28299	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016245	ACTT	3	28412	28423	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016245	AG	6	28573	28583	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016245	TA	6	28926	28937	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016245	CTTT	3	28960	28972	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016245	AG	6	29619	29629	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016245	TAAG	3	29785	29797	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016245	GAA	4	30019	30030	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016245	AT	6	30575	30585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016245	AGGA	3	30626	30637	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016245	TA	6	32086	32097	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016245	AAG	4	32652	32662	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016245	AT	7	32749	32762	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016245	TACT	3	33183	33194	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016245	TTCT	3	33933	33943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016245	GA	7	34047	34059	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016245	AG	7	34605	34617	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016245	GAG	4	34662	34673	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016245	AAG	4	34844	34855	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016245	AGA	4	35493	35503	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016245	AAAGAA	3	35523	35540	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
70	NC_016245	TC	6	35586	35598	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016245	CT	6	35741	35751	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016245	AAGAA	3	35811	35825	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016245	AAGA	4	35827	35842	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016245	AG	7	36892	36904	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016245	AAGA	3	37022	37033	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016245	AGAC	3	37097	37108	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016245	AGAC	4	37189	37203	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016245	AGA	4	37207	37218	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016245	AGC	4	37770	37781	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016245	AGAA	3	37907	37918	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016245	GAAA	3	37961	37972	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016245	CAAA	3	38020	38030	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016245	CT	7	38130	38142	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016245	GCTT	3	38442	38453	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016245	CT	6	38512	38522	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016245	AGA	4	38681	38692	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016245	GA	6	38961	38971	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016245	CTT	4	39680	39690	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016245	ATAG	3	39898	39908	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016245	TA	6	40085	40096	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016245	CCTT	3	40367	40378	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016245	GAT	4	40565	40576	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016245	CCT	4	40893	40903	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016245	TTTC	3	41890	41901	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016245	CTTT	3	41983	41993	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016245	CT	6	42054	42064	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016245	TC	6	42107	42117	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016245	TC	6	42165	42175	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016245	TCCT	3	42294	42305	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016245	GAA	4	42749	42760	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016245	CT	6	43091	43101	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016245	TTTC	3	44211	44222	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016245	TGAA	3	44766	44776	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016245	CATTC	3	45154	45167	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016245	AT	6	46153	46164	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016245	TCT	4	46396	46406	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016245	AAAGA	3	46745	46759	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016245	AGA	4	46827	46838	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016245	GGA	4	48147	48158	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016245	AT	6	48209	48220	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016245	TA	9	48573	48590	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_016245	AAG	4	49339	49350	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016245	GAA	4	49383	49393	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016245	AGC	4	49399	49410	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016245	AAGAA	3	50187	50202	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016245	AGA	5	50602	50616	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016245	AGC	4	50677	50688	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016245	TC	7	51425	51437	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016245	TC	7	51745	51757	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016245	AT	6	52004	52015	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016245	CTTT	3	52266	52277	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016245	AAGG	3	52656	52666	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016245	CT	6	53039	53049	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016245	TCT	4	53109	53120	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016245	TTC	4	53298	53310	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016245	AAG	4	53440	53451	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016245	AAG	4	53530	53541	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016245	GAA	4	54648	54659	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016245	CT	7	55029	55041	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016245	CTT	4	55877	55889	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016245	AAT	4	56729	56739	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016245	AAAG	3	57430	57441	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016245	ACT	4	58615	58626	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016245	AG	6	59343	59354	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016245	ATTC	3	59494	59505	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016245	GA	6	59876	59887	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016245	CAA	4	60085	60096	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016245	ATTT	3	60981	60992	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016245	GA	6	61577	61588	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016245	AGC	4	61798	61809	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016245	AG	6	63356	63366	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016245	CAG	4	63475	63487	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
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178	NC_016245	GTCT	3	86546	86556	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
179	NC_016245	TTG	4	88165	88176	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
180	NC_016245	CTA	4	88946	88958	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
181	NC_016245	TA	6	89488	89499	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 48