ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 48

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016245	TA	11	4069	4090	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016245	AT	6	4293	4303	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016245	TA	6	5608	5618	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016245	TA	6	7215	7226	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016245	TA	6	8266	8276	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016245	TA	6	8819	8829	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016245	GA	6	15674	15684	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016245	AT	6	18202	18212	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016245	TA	7	24170	24183	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016245	AT	8	25175	25189	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016245	AT	6	27910	27920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016245	AG	6	28573	28583	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016245	TA	6	28926	28937	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016245	AG	6	29619	29629	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016245	AT	6	30575	30585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016245	TA	6	32086	32097	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016245	AT	7	32749	32762	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016245	GA	7	34047	34059	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016245	AG	7	34605	34617	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016245	TC	6	35586	35598	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016245	CT	6	35741	35751	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016245	AG	7	36892	36904	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016245	CT	7	38130	38142	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016245	CT	6	38512	38522	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016245	GA	6	38961	38971	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016245	TA	6	40085	40096	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016245	CT	6	42054	42064	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016245	TC	6	42107	42117	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016245	TC	6	42165	42175	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016245	CT	6	43091	43101	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016245	AT	6	46153	46164	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016245	AT	6	48209	48220	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016245	TA	9	48573	48590	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016245	TC	7	51425	51437	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016245	TC	7	51745	51757	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016245	AT	6	52004	52015	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016245	CT	6	53039	53049	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016245	CT	7	55029	55041	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016245	AG	6	59343	59354	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016245	GA	6	59876	59887	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016245	GA	6	61577	61588	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016245	AG	6	63356	63366	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016245	CT	6	64458	64469	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016245	TA	6	68206	68216	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016245	GT	6	71562	71572	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016245	GA	6	71997	72007	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016245	AT	6	72805	72816	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016245	GA	7	73243	73256	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016245	CT	6	74051	74061	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016245	CA	7	74112	74125	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016245	AG	6	75753	75763	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016245	AT	6	76283	76294	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016245	TA	7	80529	80541	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016245	TA	6	85526	85537	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016245	TA	6	89488	89499	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 48