ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 24

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016241	AGCT	3	339	349	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016241	CTT	4	1606	1617	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016241	TTCC	3	1838	1849	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016241	TTC	4	2067	2078	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016241	CT	6	2423	2434	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016241	TTAC	3	2646	2656	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016241	CTG	4	2658	2669	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016241	AT	7	2756	2768	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016241	TCTCC	3	3573	3587	15	0 %	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016241	TC	7	3663	3675	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016241	GA	6	4090	4100	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016241	AGG	4	4121	4132	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016241	TC	6	4352	4362	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016241	CTTT	3	5258	5269	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016241	ACT	4	6541	6553	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016241	AT	6	7763	7774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016241	AT	7	7926	7939	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016241	TTTC	3	7946	7956	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016241	CGA	4	10165	10176	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016241	AAAG	3	11579	11589	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016241	AGAAT	4	11695	11714	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_016241	GT	6	11775	11785	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016241	TTC	4	12165	12176	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016241	CTT	4	12769	12779	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016241	GAAA	3	14807	14818	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016241	AAAG	3	15418	15428	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016241	TC	7	16144	16156	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016241	CTT	4	16877	16887	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016241	AGGAG	3	17532	17545	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016241	CTT	4	17910	17921	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016241	TTCT	3	18221	18231	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016241	CTTT	4	18416	18431	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016241	CTT	4	18466	18477	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016241	TA	9	19706	19722	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016241	ACTT	4	19867	19882	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016241	GACT	3	20925	20937	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016241	CTT	4	21501	21511	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016241	ACT	4	21865	21876	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016241	CGAG	4	22475	22491	17	25 %	0 %	50 %	25 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016241	CTA	4	22925	22936	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016241	AAG	4	23861	23873	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016241	GTA	4	24718	24729	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016241	TA	6	25338	25348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016241	AGAA	3	25465	25475	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016241	CA	7	25701	25713	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016241	AG	6	25867	25877	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016241	GT	6	26667	26678	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016241	AGA	4	26800	26810	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016241	CTT	4	27856	27866	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016241	GTCT	3	27927	27937	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016241	AG	7	29238	29250	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016241	TAA	4	30036	30046	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016241	TAC	4	30470	30480	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016241	GATTAA	3	30550	30568	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
55	NC_016241	CTT	4	30942	30954	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016241	TA	6	31574	31584	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016241	GGCA	3	31657	31667	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016241	TTAT	3	31827	31839	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016241	AAGT	3	31917	31929	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016241	CTA	5	32124	32138	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016241	ATTC	3	32290	32300	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016241	CTTT	3	33545	33555	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016241	TC	6	34099	34109	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016241	CCGT	3	34260	34270	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016241	TCT	4	35326	35337	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016241	TAG	4	35466	35477	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016241	TCT	4	35952	35962	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016241	ATTT	3	36023	36034	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016241	ACCT	3	36874	36884	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016241	CT	6	36911	36921	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016241	CT	6	37900	37911	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016241	TAGA	3	38197	38207	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016241	CTT	4	38361	38372	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016241	AGA	4	40106	40118	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016241	CTTG	3	40647	40657	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016241	ATTC	3	42344	42356	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016241	TA	6	42361	42371	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016241	TTA	4	42401	42412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016241	TAGG	3	45248	45259	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016241	GTCT	3	45830	45841	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016241	TGAC	3	46076	46086	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016241	TA	8	47607	47623	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_016241	AT	6	48630	48641	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016241	AAAG	3	48666	48677	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016241	GCTT	3	48982	48992	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016241	CTT	4	49082	49092	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016241	AGA	4	49714	49724	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016241	AT	6	50984	50995	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016241	AAG	4	51030	51041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016241	CTAA	3	51071	51082	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016241	TTGC	3	51762	51773	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016241	AAGA	3	52435	52445	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016241	AGTC	3	52636	52648	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016241	CTAT	3	52910	52920	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016241	CTCTT	3	53361	53374	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016241	CTT	4	53386	53397	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016241	AAGC	3	55166	55177	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016241	CTT	4	55393	55404	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016241	TAC	4	57112	57123	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016241	AAGA	3	57598	57609	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016241	CAAC	3	57712	57722	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016241	TCT	4	58884	58894	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016241	TC	6	59465	59475	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016241	TC	7	59554	59566	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016241	AAGT	3	60732	60743	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016241	GCAA	4	62614	62628	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016241	CTT	4	62927	62938	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016241	TTTTCT	3	63968	63985	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
109	NC_016241	CTT	4	64281	64292	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016241	GA	7	64792	64804	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016241	TTA	4	64880	64890	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016241	CTTT	3	67002	67014	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016241	ATAA	3	67289	67299	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016241	TGG	4	67418	67430	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016241	CCTT	3	67585	67596	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016241	CTT	4	68139	68151	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016241	GA	7	69687	69699	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016241	GA	7	70525	70537	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016241	TGC	4	72787	72798	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016241	TCA	4	73245	73256	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016241	AAAG	3	74043	74053	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016241	GAAA	3	74360	74371	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016241	CT	7	74626	74638	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016241	GCT	5	75921	75935	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016241	TCAG	3	76060	76070	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016241	AT	6	76171	76182	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016241	TTTC	3	76273	76284	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016241	GTAA	3	76841	76851	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016241	AAAGA	3	78822	78836	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016241	TTTA	3	80171	80182	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016241	AG	6	83456	83467	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016241	AAAGA	3	83877	83891	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016241	CTTT	3	84587	84597	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016241	AAAG	3	84764	84774	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016241	GCTTT	3	85234	85248	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016241	AAAG	3	86588	86598	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016241	TTCT	3	87794	87806	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016241	AAG	4	88255	88266	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016241	AACT	4	88617	88631	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016241	AT	6	89176	89186	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016241	ATC	4	89273	89283	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016241	TTCT	4	90506	90521	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016241	GAAA	3	90607	90619	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016241	TA	7	93146	93158	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016241	CTAA	3	93903	93914	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016241	ATTA	3	94006	94017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016241	AGT	4	94778	94790	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_016241	AG	6	94953	94963	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016241	TCC	4	94998	95008	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016241	TA	7	95219	95232	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016241	AAAGC	3	96079	96092	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
152	NC_016241	TA	6	96446	96457	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
153	NC_016241	CTTG	3	96946	96957	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
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155	NC_016241	TAGT	3	99126	99137	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_016241	CCCT	3	100591	100602	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
157	NC_016241	TTCT	3	100866	100878	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
158	NC_016241	TA	6	101057	101067	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_016241	ATTA	3	101315	101326	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016241	CTTT	3	101331	101342	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
161	NC_016241	ATTC	3	102171	102181	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
162	NC_016241	TAAA	3	102407	102418	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016241	TCCT	4	104797	104812	16	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016241	GAT	4	104994	105005	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
165	NC_016241	AAAG	3	106074	106084	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
166	NC_016241	AG	6	106216	106226	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 24