ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 70

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016240	GA	6	805	815	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016240	ATGT	3	4409	4420	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016240	CT	6	4525	4535	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016240	AGA	4	4693	4704	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016240	AG	6	5829	5839	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016240	AG	6	5934	5944	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016240	TA	6	6500	6510	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016240	AAAG	3	7509	7520	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016240	TATT	3	8064	8075	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016240	TA	6	8451	8461	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016240	TATAA	3	9228	9242	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016240	AAGG	3	9257	9268	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016240	AAAG	3	10213	10223	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016240	GAAA	3	11284	11294	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016240	TTA	4	11437	11449	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016240	TA	7	11877	11891	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016240	AGC	4	12050	12060	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016240	GT	6	12604	12614	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016240	TTTC	3	13153	13163	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016240	AAGA	3	14366	14377	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016240	CTT	4	14961	14973	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016240	AT	6	14974	14985	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016240	CTC	4	15907	15918	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016240	AAAGA	3	16077	16091	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016240	AGA	5	16260	16273	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016240	AGAA	3	16295	16306	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016240	TAAC	3	16506	16516	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016240	CTTA	3	17041	17052	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016240	CT	6	17147	17158	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016240	TCT	4	18537	18548	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016240	AAAC	3	19373	19384	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016240	CT	6	19578	19589	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016240	TCTT	3	19653	19663	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016240	GA	7	21097	21109	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016240	CG	6	21134	21145	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016240	TGAA	3	21461	21471	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016240	GA	8	22096	22110	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016240	GAGG	3	22492	22503	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016240	AGA	4	22972	22982	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016240	GAA	4	24921	24932	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016240	AAG	4	25225	25236	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016240	AGA	4	25902	25912	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016240	AT	6	25972	25983	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016240	TC	6	26233	26243	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016240	CT	6	26287	26297	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016240	GAA	4	26710	26720	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016240	AGA	4	27330	27341	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016240	GAAA	3	27487	27499	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016240	TA	6	27717	27728	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016240	GA	6	27783	27793	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016240	CCTT	3	28659	28670	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016240	TCA	4	29511	29521	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016240	TGGG	3	29661	29671	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016240	AGATAA	3	29961	29977	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016240	CTT	4	30381	30392	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016240	TAGA	3	30663	30673	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016240	AG	8	30804	30818	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016240	ACCT	3	33366	33377	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016240	TA	6	34565	34576	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016240	TA	6	35455	35465	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016240	TA	6	36333	36344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016240	TCT	4	36482	36493	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016240	AAAG	3	36535	36545	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016240	CT	7	36553	36565	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016240	AAG	4	36689	36700	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016240	TCT	4	36988	36999	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016240	AG	6	37213	37224	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016240	AAG	4	37386	37397	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016240	CTTT	3	37501	37511	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016240	TA	7	37674	37687	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016240	CCAAC	3	38093	38107	15	40 %	0 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016240	AG	6	38716	38726	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016240	TAG	4	38782	38792	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016240	TTAA	3	38802	38812	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016240	TTGT	3	39363	39373	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016240	TTCT	3	40447	40458	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016240	CTGA	3	40646	40657	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016240	TA	7	40732	40744	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016240	TTC	4	40901	40912	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016240	CA	6	41148	41158	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016240	GA	6	41254	41265	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016240	TA	6	41343	41354	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016240	AATT	3	41774	41785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016240	TCT	4	44007	44018	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016240	CCATAA	3	44599	44615	17	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
86	NC_016240	CT	6	44957	44967	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016240	CTA	4	45062	45072	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016240	AGAA	3	45945	45956	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016240	AAAGA	3	47052	47066	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016240	TCTG	3	47461	47472	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016240	AT	7	48024	48037	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016240	TCT	4	48136	48148	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016240	ACAT	3	49409	49420	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016240	AG	6	49830	49840	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016240	TA	6	50245	50255	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016240	TA	6	51475	51485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016240	CTT	5	54620	54635	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016240	TACC	3	54636	54646	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016240	CGAA	3	55044	55054	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016240	ATT	4	55094	55104	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016240	GAGAA	3	55595	55608	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016240	AG	7	55704	55716	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016240	TA	6	56120	56131	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016240	AGA	4	56129	56139	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016240	TTC	4	56220	56230	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016240	AGA	4	56829	56839	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016240	TGAT	3	57088	57098	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016240	AAG	4	57558	57569	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016240	CAA	4	58310	58320	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016240	CTT	5	59442	59455	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016240	TCT	5	60161	60174	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016240	AAAG	3	61197	61208	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016240	TGT	4	61396	61407	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016240	CTT	5	61592	61606	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016240	AAAGA	3	62340	62353	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016240	TA	6	62416	62427	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016240	TTC	4	62455	62466	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016240	GA	6	62592	62602	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016240	GAAA	3	63619	63629	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016240	GCG	4	63719	63729	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016240	GCT	5	64093	64107	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016240	TTC	4	64297	64308	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016240	GGGT	3	64509	64519	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016240	AT	6	65308	65319	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016240	AAAAG	3	65357	65371	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016240	AT	6	65560	65571	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016240	AGA	4	66048	66058	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016240	AAG	4	66061	66071	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016240	AGC	4	66123	66134	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016240	CTT	4	67022	67033	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016240	GA	6	67277	67287	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016240	TCT	5	67592	67605	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016240	AT	6	68019	68030	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016240	AGC	4	68486	68497	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016240	TC	6	70473	70483	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016240	TC	6	70551	70561	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016240	TTTG	3	71466	71476	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016240	TTCTT	3	71803	71817	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016240	TC	6	72193	72203	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016240	ACCT	3	72296	72307	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016240	AT	6	72728	72741	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016240	TTCT	3	73415	73426	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016240	AAAG	3	73990	74000	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016240	CTT	4	74467	74478	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
145	NC_016240	AATT	3	75430	75441	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016240	CCAAT	3	75467	75480	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016240	AGA	4	75573	75583	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016240	CCT	4	75739	75750	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016240	CG	7	75943	75955	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
150	NC_016240	AGT	4	76290	76302	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
151	NC_016240	TAGG	3	76779	76789	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016240	CTT	4	77236	77246	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016240	GA	6	78201	78211	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_016240	TCTTT	3	78308	78322	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 70