ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 94

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016239	TCTT	4	2511	2525	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016239	AG	6	3318	3328	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016239	AGA	4	3349	3359	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016239	GAGAG	3	3957	3972	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016239	TCT	4	4335	4345	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016239	AAAGG	3	4904	4918	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016239	ACA	4	5193	5204	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016239	AGA	4	5561	5572	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016239	AG	7	6167	6179	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016239	CTTG	3	6629	6640	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016239	GAG	4	8508	8520	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016239	AAAAG	3	9376	9391	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016239	TGAA	3	9714	9724	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016239	TAG	5	10869	10882	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016239	CCTT	3	11018	11028	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016239	TA	6	11785	11796	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016239	TAC	4	11818	11828	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016239	TTC	4	11837	11847	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016239	CCTT	3	12141	12153	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016239	CCTT	3	12562	12572	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016239	AAAG	3	12824	12835	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016239	AAG	4	12929	12940	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016239	AAAG	3	13445	13455	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016239	AGA	4	14735	14747	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016239	AAGA	3	16352	16363	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016239	AT	7	17534	17546	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016239	TC	6	18085	18095	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016239	TA	7	18797	18812	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016239	TTAGG	3	19995	20009	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016239	TC	7	20493	20505	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016239	GCCT	3	21008	21019	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016239	AT	7	21360	21373	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016239	AGT	4	22164	22175	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016239	AAT	4	22366	22378	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016239	CAGA	3	22448	22458	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016239	AGAA	3	23513	23525	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016239	TA	7	23989	24001	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016239	CTT	4	24146	24156	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016239	TAT	4	24874	24885	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016239	TTCG	3	25696	25707	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016239	CAAAG	3	26127	26140	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016239	TA	6	26158	26169	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016239	TTTG	3	27322	27332	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016239	CTTTT	3	27444	27459	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016239	AAGTCA	3	27481	27499	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
46	NC_016239	CG	6	27716	27727	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016239	TTCTCC	3	28345	28361	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
48	NC_016239	GAG	4	28547	28557	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016239	GCAAA	3	28660	28673	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016239	TGAA	3	28933	28943	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016239	AGAC	3	29558	29568	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016239	CTT	4	31657	31667	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016239	GTCT	3	31747	31757	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016239	CCTCTC	3	32607	32625	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016239	AAAG	3	33390	33400	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016239	TACT	3	33446	33456	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016239	CTTT	3	33483	33494	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016239	TA	6	33835	33846	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016239	AG	6	35215	35225	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016239	CTT	4	35720	35731	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016239	CGAT	3	35942	35953	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016239	GAG	4	36827	36838	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016239	TGAA	3	36889	36899	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016239	GA	8	37197	37211	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016239	GAGAGT	3	37219	37235	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_016239	CTT	4	37758	37770	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016239	GAA	4	38082	38092	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016239	AAG	4	38102	38112	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016239	GAA	5	38175	38189	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016239	TCT	4	39235	39245	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016239	AG	6	39352	39363	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016239	TAA	4	39513	39523	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016239	AGA	4	40060	40070	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016239	CGAA	3	40510	40520	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016239	TC	6	40592	40603	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016239	CT	10	41081	41099	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
77	NC_016239	AC	6	41137	41147	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016239	AG	6	41478	41488	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016239	TGCA	3	41823	41834	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016239	TCT	5	42647	42660	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016239	TA	8	43727	43741	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016239	AT	6	44389	44400	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016239	TTTG	3	44695	44707	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016239	GA	6	44764	44775	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016239	AAAG	3	44878	44889	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016239	TGC	4	45429	45440	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016239	AAG	4	47289	47301	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016239	CT	6	49718	49729	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016239	GAA	4	50184	50195	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016239	AT	7	51696	51711	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016239	TA	6	51902	51912	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016239	AACAT	3	52055	52068	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016239	GAA	4	52201	52212	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016239	AAAGA	3	52423	52438	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_016239	CT	6	52932	52943	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016239	TCA	4	53388	53398	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016239	TA	6	53646	53658	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016239	ATCG	3	54468	54478	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016239	CT	6	55583	55594	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016239	CT	6	55911	55922	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016239	AGT	4	55970	55981	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016239	CTTT	4	57047	57062	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016239	TCGA	3	57659	57670	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016239	CTT	4	58089	58100	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016239	TC	7	58701	58713	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016239	CTT	4	58970	58981	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016239	AG	6	59412	59422	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016239	CTT	4	59689	59699	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016239	ATCCG	3	59723	59736	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016239	CTTT	3	59761	59771	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016239	CTT	4	60081	60093	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016239	GCCC	3	60430	60440	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016239	AGA	5	60485	60499	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016239	CTC	4	61454	61465	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016239	CCTT	3	61775	61787	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016239	TC	6	62874	62884	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016239	TC	7	63785	63797	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016239	AT	6	64112	64123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016239	GA	6	64176	64186	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016239	AT	8	64752	64767	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_016239	TCCT	3	65003	65014	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016239	AAG	5	65124	65137	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016239	CTTGC	3	65360	65374	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016239	ATAAGA	3	65750	65767	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
125	NC_016239	AAG	4	65794	65805	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016239	GGAA	3	66212	66223	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016239	ATT	4	67290	67300	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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