ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 56

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016238	GAA	4	34	44	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016238	TC	6	70	80	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016238	AAGAAA	3	149	166	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_016238	CTTT	3	240	251	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016238	CT	6	564	575	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016238	GAA	4	686	698	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016238	CT	6	2141	2152	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	35796723
8	NC_016238	AAGAGA	4	2417	2439	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016238	CAAG	3	3429	3440	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016238	TC	6	3719	3729	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016238	CT	6	3876	3886	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016238	CTTT	7	3996	4023	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
13	NC_016238	AAAG	3	4498	4509	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016238	AG	6	5050	5060	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016238	AAAG	3	5183	5198	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016238	TGAA	3	5745	5755	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016238	GA	6	5844	5854	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016238	TGAA	3	6229	6239	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016238	CCT	4	7067	7077	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016238	TCGGA	3	7530	7543	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016238	TCGT	3	8178	8188	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016238	CCT	4	8311	8322	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016238	CTTC	3	8664	8675	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016238	GAG	4	9739	9749	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016238	GA	6	9822	9832	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016238	GAA	4	10807	10818	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016238	GA	6	11585	11596	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016238	TGAA	3	11847	11857	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016238	GAAGGA	3	11918	11934	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_016238	AGA	4	12123	12135	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016238	TGCC	4	12149	12163	15	0 %	25 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016238	TACT	3	14842	14852	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016238	CTT	4	15189	15199	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016238	ACA	4	15952	15963	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016238	TTG	4	16641	16652	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016238	TCCT	3	18022	18032	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016238	CTT	4	18227	18238	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016238	CGG	4	19504	19515	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016238	TTC	4	20458	20469	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016238	TAAAG	3	20778	20791	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016238	CTTT	3	21470	21481	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016238	AGA	4	21972	21982	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016238	AAGC	3	22168	22180	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016238	CATA	3	22632	22644	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016238	AG	7	23558	23570	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016238	TA	7	24577	24589	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016238	TCTT	3	25090	25101	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016238	TC	6	26264	26274	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016238	AT	6	26335	26346	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016238	CTG	4	27604	27615	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016238	TTATAG	3	27629	27645	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_016238	CTA	4	27909	27919	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016238	TACC	4	28401	28416	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016238	AAGT	3	28866	28877	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016238	TGTA	3	30232	30242	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016238	ACT	4	30418	30428	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016238	CCTCT	3	30633	30647	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016238	AGA	4	31325	31335	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016238	CTTT	3	33058	33068	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016238	TTCTG	4	33085	33104	20	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
61	NC_016238	CT	6	33339	33349	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016238	ACCT	4	33687	33702	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016238	TATC	3	33990	34000	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016238	CTTA	3	34016	34028	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016238	GCTC	3	36478	36489	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016238	AT	6	36816	36826	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016238	AGG	4	37271	37281	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016238	AGA	4	37615	37625	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016238	CTTA	4	37672	37688	17	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
70	NC_016238	TCTT	3	39246	39257	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016238	TCTT	4	39544	39560	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
72	NC_016238	GAAA	3	40181	40192	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016238	GCCC	3	40299	40309	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016238	TA	6	40440	40450	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016238	GCTT	4	41008	41022	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016238	TTTA	3	41059	41070	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016238	AGTA	3	41110	41120	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016238	AAG	4	41362	41373	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016238	GAA	4	41505	41516	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016238	CG	6	45665	45676	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016238	TA	6	45682	45692	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016238	TTCT	3	45975	45986	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016238	CTTT	4	46254	46269	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016238	CTAGTA	3	46920	46937	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016238	AAG	4	48863	48874	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016238	CTT	4	49770	49780	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016238	TTG	4	50107	50118	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016238	TA	6	50293	50304	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016238	AAG	4	50977	50988	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016238	CT	6	51485	51496	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016238	TA	6	51664	51677	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016238	AAAG	3	52084	52095	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016238	TACT	3	52706	52716	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016238	ATG	4	53800	53810	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016238	CTCA	3	53919	53930	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016238	TAGT	3	54060	54071	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016238	TCGC	3	54116	54127	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016238	TTC	4	54381	54391	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016238	CA	6	55027	55037	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016238	GCTT	3	55212	55224	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016238	CTT	4	55235	55246	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016238	GAAA	3	55404	55414	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016238	AACT	3	55932	55942	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016238	AAGA	3	56404	56415	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016238	GA	6	57276	57286	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016238	AGC	4	58119	58129	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016238	AAGT	3	59136	59146	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016238	GCC	4	59604	59614	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016238	AATA	3	59672	59683	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016238	GAAT	3	59996	60007	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016238	TG	6	61821	61831	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016238	TATC	3	63217	63227	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016238	AAGT	3	63410	63420	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016238	TTC	4	63436	63447	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016238	TCT	5	64193	64207	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016238	AGA	4	64768	64779	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016238	GAA	4	64811	64822	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016238	CGTTG	3	64859	64872	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016238	CCTT	3	65767	65778	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016238	AAGA	3	66413	66424	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016238	GAAA	3	66844	66855	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016238	CTTT	3	68433	68443	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016238	CTT	4	68451	68462	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016238	AAG	4	68791	68801	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016238	CGAG	3	70448	70459	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016238	GAAA	3	70825	70835	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016238	AT	6	70891	70901	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016238	TA	6	70979	70989	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016238	AGC	5	71526	71539	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016238	TAAG	3	71918	71929	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016238	AG	6	72772	72782	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016238	CACTT	3	73149	73163	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016238	TTTA	3	73175	73185	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016238	AGA	4	73256	73268	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016238	GCT	4	73427	73438	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016238	CCT	4	73610	73621	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016238	GAA	4	73785	73796	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016238	TA	6	75426	75436	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016238	AT	6	75563	75575	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016238	CTTT	3	75818	75829	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016238	AAAAG	3	76478	76493	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016238	TCGA	3	77980	77990	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016238	TGA	4	79009	79019	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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145	NC_016238	AGA	4	79939	79951	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_016238	CT	6	80155	80165	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016238	TCAA	3	82123	82133	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016238	ACT	4	84595	84605	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016238	GACT	3	84623	84633	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016238	GA	7	85565	85577	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 56