ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 44

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016237	AGC	4	163	174	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016237	CT	6	444	454	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016237	TA	6	970	981	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016237	TTC	4	1374	1384	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016237	GAG	4	1815	1826	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016237	AAAG	3	2096	2107	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016237	TC	6	2629	2639	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016237	AAAAGA	3	2754	2771	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016237	AAGA	3	2907	2918	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016237	T	12	3112	3123	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016237	CTTT	3	3698	3708	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016237	ATAG	3	5153	5163	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016237	CTTT	4	5177	5191	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016237	GA	7	6245	6257	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016237	TCT	4	6328	6338	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016237	GA	6	6895	6905	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016237	GA	7	7734	7746	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016237	GA	6	7802	7812	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016237	TAG	4	8021	8031	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016237	AGA	4	8441	8452	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016237	TGT	4	8827	8837	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016237	AGA	4	8934	8944	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016237	TCT	4	9473	9483	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016237	CG	6	10250	10261	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016237	TTGT	3	12098	12108	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016237	AGAA	3	12336	12347	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016237	CTT	5	12507	12520	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016237	CTT	4	13460	13471	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016237	TTTA	3	14610	14621	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016237	GA	7	14773	14785	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016237	AG	6	14831	14841	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016237	AG	7	14964	14976	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016237	CT	6	15210	15220	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016237	AG	6	15520	15530	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016237	CTT	4	16640	16651	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016237	TCT	4	16681	16692	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016237	CTT	4	17018	17029	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016237	GA	6	17428	17438	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016237	TCT	4	19041	19052	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016237	GAAA	3	19790	19801	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016237	GA	6	20115	20125	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016237	GAAAG	3	20139	20153	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016237	GA	6	20653	20663	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016237	TTC	4	20728	20739	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016237	TC	6	20962	20972	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016237	CTT	4	20997	21007	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016237	CCTT	3	21372	21383	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016237	CTT	4	21514	21524	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016237	ATAG	3	21734	21744	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016237	CTT	4	22075	22086	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016237	CTT	4	22159	22169	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016237	CTT	4	22618	22628	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016237	CTT	4	23398	23409	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016237	TCT	4	23457	23468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016237	CTT	4	23515	23525	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016237	ACAG	3	24130	24141	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016237	CTT	4	24695	24706	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016237	GA	6	24991	25001	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016237	AT	6	25846	25857	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016237	GAG	4	26508	26518	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016237	CAAGGA	3	27125	27143	19	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
62	NC_016237	CTT	4	27538	27549	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016237	AT	6	27798	27809	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016237	CTT	4	28653	28664	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016237	GGTA	3	28689	28700	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016237	TCT	4	29305	29315	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016237	AG	6	29379	29390	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016237	TCTT	3	29631	29642	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016237	CTT	4	30434	30444	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016237	TA	6	31016	31026	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016237	CTT	4	31522	31532	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016237	TCT	4	31539	31550	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016237	CTT	4	31804	31814	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016237	AGAA	3	32321	32332	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016237	CTT	6	34136	34153	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
76	NC_016237	GA	6	34186	34196	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016237	GA	6	35709	35719	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016237	CCTT	3	36043	36053	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016237	AG	6	36394	36404	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016237	AG	6	36428	36438	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016237	CTT	4	37555	37567	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016237	AG	6	37697	37707	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016237	TAT	4	37932	37942	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016237	GGA	4	38500	38511	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016237	AAGA	3	38839	38851	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016237	AAGA	4	39226	39240	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016237	AG	6	39646	39656	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016237	GTCA	3	39815	39826	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016237	AGAA	4	40340	40355	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016237	CTG	4	40592	40603	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016237	TTTTCT	3	40787	40803	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
92	NC_016237	TTCT	3	41125	41135	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016237	CTT	4	41229	41239	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016237	AT	6	42321	42332	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016237	CT	6	42364	42374	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016237	TCT	4	42607	42618	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016237	CTT	4	42966	42977	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016237	CTT	4	43554	43565	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016237	CT	7	45445	45457	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016237	CTT	5	45650	45663	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016237	AAAG	3	46383	46394	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016237	TTC	4	46567	46578	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016237	TTTTC	3	46580	46594	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016237	AG	7	47022	47034	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016237	AT	6	47195	47206	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016237	TTC	4	47502	47513	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016237	TTTC	3	48335	48346	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016237	AT	6	49045	49056	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016237	TCT	4	49127	49138	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016237	AAAG	3	50049	50060	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016237	TGAC	3	50600	50610	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016237	AAG	4	50890	50901	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016237	GAAAG	3	51441	51454	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016237	GAA	4	51614	51625	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016237	TTCT	3	52365	52376	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016237	GA	6	53327	53337	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016237	TTC	4	53634	53645	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016237	CTT	5	54362	54377	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016237	AAGGAA	3	54752	54769	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
120	NC_016237	TTCT	3	55007	55018	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016237	AG	7	55773	55785	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016237	CTTTT	3	56196	56209	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016237	TTTC	3	58265	58276	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016237	CTTT	3	58827	58839	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016237	TC	6	59296	59306	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016237	CTT	4	59885	59896	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016237	AAAG	3	59953	59965	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016237	TA	8	60988	61002	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016237	CAT	4	61046	61057	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016237	AAAG	3	61245	61256	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016237	TTAC	3	61265	61276	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016237	TAG	5	61403	61417	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016237	TGC	4	62036	62046	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016237	GCT	4	63130	63141	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016237	AAAG	3	63914	63925	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016237	CT	6	65851	65861	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016237	ATCT	3	65923	65935	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016237	GA	6	66332	66343	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016237	TA	7	66846	66858	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016237	GA	7	67239	67252	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016237	TTGT	3	67701	67712	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 44