ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 20

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016234	CTTT	3	1126	1136	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016234	CTTT	3	1628	1638	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016234	AAAG	3	1815	1825	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016234	CTAG	3	2082	2092	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016234	TTCTTT	3	2593	2611	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
6	NC_016234	TCTA	3	2884	2895	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016234	TACC	3	3550	3560	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016234	TTCT	3	4343	4353	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016234	ATGA	3	4972	4983	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016234	CTT	4	5020	5031	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016234	ATCG	3	5752	5762	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016234	CGG	4	6614	6625	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016234	GAAAA	3	6904	6917	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016234	CTA	4	7463	7474	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016234	TA	8	7830	7844	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016234	CAG	4	8103	8114	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016234	GAA	4	10796	10806	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016234	AAGGAG	3	11682	11698	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016234	GAGG	3	11795	11806	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016234	TA	6	13526	13536	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016234	TCTT	3	14975	14986	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016234	AGA	4	15462	15472	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016234	CTTT	4	16482	16496	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016234	TTAA	3	17032	17042	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016234	GTCT	3	17129	17139	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016234	CT	6	18149	18161	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016234	GA	6	18830	18840	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016234	GA	7	18913	18925	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016234	TGAA	3	19301	19311	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016234	TTC	4	20687	20698	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016234	AGAA	3	20784	20795	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016234	TGT	4	20820	20831	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016234	TA	6	21644	21654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016234	AAGA	3	22098	22109	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016234	AAG	4	22633	22643	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016234	TCC	4	22952	22962	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016234	GA	6	23090	23100	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016234	CTAG	3	23155	23166	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016234	AAAG	3	23225	23235	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016234	GA	6	23343	23353	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016234	TAGA	5	24190	24208	19	50 %	25 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_016234	GCAA	3	24789	24800	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016234	TGTC	3	25199	25210	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016234	TAA	4	27172	27183	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016234	CTTTT	3	27284	27298	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016234	GCT	4	27541	27552	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016234	GA	7	27794	27806	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016234	AAGA	3	27988	27999	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016234	AAC	4	28961	28973	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016234	AAG	4	29906	29916	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016234	GAAA	3	30344	30355	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016234	CTAA	3	30373	30383	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016234	AACAAA	3	30389	30407	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
54	NC_016234	CTAA	3	30503	30514	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016234	TAC	4	31628	31640	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016234	TCT	4	31690	31700	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016234	ATC	4	31917	31927	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016234	AT	6	32356	32369	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016234	CTT	4	32886	32896	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016234	AAAG	3	33476	33486	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016234	CTT	4	33746	33756	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016234	TTAG	3	33922	33932	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016234	CAAG	3	33972	33982	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016234	GTA	4	34245	34256	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016234	TA	6	34688	34698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016234	TTCT	3	35427	35438	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016234	TTCT	3	35739	35750	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016234	TTC	4	36925	36936	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016234	TAGA	3	37386	37396	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016234	TAA	4	37940	37951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016234	TG	6	40349	40359	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016234	CT	6	40462	40474	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016234	AAGA	3	41841	41853	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016234	TAC	5	41860	41874	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016234	TA	6	42173	42183	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016234	TA	6	42558	42568	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016234	CTT	4	43158	43168	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016234	TA	6	43187	43198	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016234	TAC	4	44368	44378	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016234	AAAAG	3	45579	45594	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016234	AAAAG	3	45620	45635	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016234	TAA	4	46108	46120	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016234	AT	6	46307	46317	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016234	ACT	6	46979	46997	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
85	NC_016234	CTT	4	47417	47428	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016234	TC	6	47530	47540	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016234	GAA	4	49273	49284	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016234	GGAGA	3	49574	49588	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016234	AG	6	50178	50189	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016234	CTA	4	50542	50552	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016234	GCAT	3	51594	51604	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016234	GGAA	3	51870	51881	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016234	TA	7	54111	54124	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016234	AAGA	3	54216	54226	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016234	GGAAA	3	54236	54249	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016234	TCGC	3	56347	56358	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016234	TTAA	3	56419	56429	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016234	GA	6	56445	56455	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016234	AGA	4	57288	57298	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016234	TA	10	57801	57820	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
101	NC_016234	AAGA	3	58340	58350	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016234	TTTG	3	58466	58477	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016234	CTT	4	59924	59935	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016234	CCT	4	61086	61096	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016234	AT	8	61153	61167	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016234	GCTT	3	63146	63156	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016234	AAAT	3	64311	64323	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016234	TTAT	3	66045	66055	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016234	GAA	4	67879	67890	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016234	AGT	5	67952	67966	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016234	TAAAG	3	68183	68196	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016234	TGAC	3	68749	68761	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016234	GA	6	68853	68864	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016234	CTT	4	68990	69001	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016234	AG	6	69670	69681	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016234	AT	7	70096	70108	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016234	AGA	4	70753	70765	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016234	TATT	3	71117	71128	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016234	AGAA	3	71203	71214	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016234	GA	6	72191	72202	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016234	AGCC	3	72713	72725	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016234	TC	7	72726	72738	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016234	AAAG	3	72889	72900	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016234	TGG	4	73882	73893	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016234	TTTTCT	3	74114	74131	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
126	NC_016234	AGCA	3	75030	75040	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016234	GA	7	75446	75458	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016234	AGTG	3	75597	75608	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016234	CT	6	75644	75655	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016234	AACC	3	76671	76681	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016234	CA	6	78256	78266	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016234	TAG	4	79002	79012	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016234	CTA	4	79143	79153	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016234	TA	6	79268	79279	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016234	TAG	4	79328	79339	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016234	CGT	4	79610	79620	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016234	TAGC	3	79970	79981	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016234	TA	6	80365	80376	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016234	TC	6	80781	80791	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016234	CTT	4	81024	81035	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016234	GCTT	3	82580	82590	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 20