ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 13

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016232	TTCC	3	510	521	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016232	AG	6	834	845	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016232	TCAA	3	1150	1161	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016232	GAA	4	1654	1666	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016232	TA	6	1966	1976	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016232	TC	6	2255	2265	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016232	TGT	4	2664	2674	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016232	GATTA	3	2963	2977	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016232	GAAA	3	3672	3682	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016232	TA	6	5345	5356	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016232	TC	7	5495	5508	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016232	ATA	4	5718	5729	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016232	GAG	4	6727	6738	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016232	AAG	4	6906	6917	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016232	CTTT	3	6947	6957	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016232	AAG	4	7008	7019	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016232	TGAA	3	8290	8301	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016232	AG	6	8650	8661	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016232	CT	6	10302	10312	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016232	GTCA	3	11459	11471	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016232	AAG	4	11847	11857	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016232	CT	6	12760	12770	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016232	AG	6	13390	13400	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016232	TCTT	3	13567	13578	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016232	TAG	4	14048	14059	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016232	TCT	4	14075	14086	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016232	TGC	4	14817	14828	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016232	TA	7	15617	15629	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016232	TA	7	15930	15942	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016232	AG	6	15967	15978	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016232	CTGT	3	15989	15999	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016232	AAG	4	16194	16206	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016232	AG	6	16380	16390	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016232	GGTC	3	16663	16673	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016232	TA	6	16817	16828	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016232	CTATA	3	17712	17726	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016232	GCCCT	3	19304	19317	14	0 %	20 %	20 %	60 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016232	CTTT	3	19570	19581	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016232	TA	6	19692	19702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016232	AT	7	21199	21211	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016232	TA	10	22652	22673	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016232	TTACA	4	23030	23050	21	40 %	40 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016232	TA	7	23091	23104	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016232	CTT	4	25237	25247	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016232	AAAG	3	26008	26019	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016232	TTGG	3	26126	26138	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016232	CTTT	4	26197	26212	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016232	TA	6	26990	27000	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016232	GAGAC	3	27340	27355	16	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016232	GAA	4	27710	27721	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016232	ATTA	3	27810	27821	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016232	TAA	4	29049	29060	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016232	GCAT	3	29239	29250	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016232	AGA	4	29660	29671	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016232	CTTA	3	30826	30838	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016232	GCA	6	31497	31513	17	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
57	NC_016232	GGAA	3	32220	32231	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016232	AAG	4	33812	33823	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016232	CTT	4	33950	33960	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016232	AT	6	35561	35572	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016232	TCGTC	3	35616	35629	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016232	AAG	5	36099	36112	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016232	CTTT	3	36892	36904	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016232	CGTT	3	37286	37297	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016232	TTTC	3	38403	38413	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016232	TTCG	3	38546	38556	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016232	CT	6	39378	39388	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016232	TAAG	3	40024	40034	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016232	TCT	4	40408	40418	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016232	CT	7	40504	40516	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016232	AAG	4	41448	41459	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016232	TA	6	42033	42044	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016232	GAA	4	42046	42056	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016232	TTAT	3	42640	42651	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016232	CTA	4	42948	42959	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016232	TC	6	43264	43274	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016232	GAA	4	43401	43413	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016232	GA	7	43460	43472	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016232	AAAG	3	43526	43537	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016232	TTAC	3	44709	44720	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016232	CT	6	44935	44945	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016232	TC	6	46308	46318	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016232	CT	6	46981	46991	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016232	TTG	5	47602	47616	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016232	TA	6	48114	48125	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016232	CTTT	3	48338	48349	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016232	CTT	4	49838	49849	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016232	AAG	4	50888	50898	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016232	TCT	4	52241	52253	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016232	CTT	4	52301	52311	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016232	TA	6	53002	53012	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016232	TTTC	3	53861	53871	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016232	TC	6	54200	54210	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016232	TCAG	3	54213	54224	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016232	TCT	4	54574	54584	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016232	CT	6	55891	55901	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016232	CCAG	4	55936	55950	15	25 %	0 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016232	GCTC	3	56578	56588	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016232	CT	6	56805	56816	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016232	TCT	4	58795	58805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016232	CATAG	3	59660	59673	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016232	TAGT	3	59990	60000	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016232	AGT	4	60231	60242	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016232	TCGA	3	60247	60258	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016232	GCTT	3	60577	60587	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016232	CTT	4	61843	61854	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016232	CTA	5	62608	62622	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016232	TTA	4	63003	63014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016232	GAA	4	63152	63163	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016232	GA	6	64405	64415	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016232	AGT	4	64646	64656	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016232	GA	7	66587	66599	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016232	AAAT	3	66740	66752	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016232	ATTC	3	66958	66969	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016232	TTGA	3	67895	67906	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016232	CT	8	68189	68203	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016232	CTT	4	68569	68580	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016232	AAAG	3	68965	68976	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016232	GAAA	3	69002	69013	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016232	TCCA	3	70520	70530	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016232	TCTT	3	71234	71245	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016232	CCCCT	3	71314	71328	15	0 %	20 %	0 %	80 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016232	AAGA	3	71489	71499	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016232	TA	6	72566	72576	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016232	TTTC	3	72727	72738	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016232	CTT	4	73070	73080	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016232	TA	6	73243	73253	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016232	TTAG	3	74106	74117	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016232	CTTTA	3	74812	74826	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
130	NC_016232	AAG	4	74999	75010	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016232	AG	7	75440	75453	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016232	TG	6	76277	76287	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016232	ATGC	3	77262	77272	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016232	AT	6	77543	77554	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016232	AG	6	78307	78318	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016232	TATT	3	78544	78555	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016232	CTTT	3	79128	79138	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016232	TA	8	79300	79314	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016232	CTTT	3	79490	79501	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016232	CG	6	79537	79548	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016232	GA	7	79775	79787	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016232	TGAA	3	79946	79956	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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150	NC_016232	AT	6	84553	84563	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_016232	CTTA	4	84894	84909	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
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160	NC_016232	AGGA	3	91253	91264	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
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162	NC_016232	CTT	4	92097	92109	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
163	NC_016232	CTTT	3	92493	92503	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
164	NC_016232	TTAT	3	93365	93376	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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167	NC_016232	CT	6	93915	93926	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
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171	NC_016232	CTT	4	95887	95897	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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184	NC_016232	AAGAG	3	99977	99991	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
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234	NC_016232	TAAG	3	117318	117329	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_016232	AAG	4	118598	118608	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
236	NC_016232	GAAA	3	119135	119145	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 13