ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 16

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016231	AG	6	514	525	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016231	AG	6	1581	1591	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016231	CT	6	4004	4015	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016231	TA	8	4826	4841	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016231	TC	6	5838	5848	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016231	TA	7	6613	6626	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016231	AG	6	9006	9016	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016231	AG	6	9106	9116	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016231	TA	6	9212	9223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016231	TC	6	13414	13424	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016231	GA	6	19892	19902	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016231	TA	6	26586	26596	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016231	CT	6	27157	27167	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016231	TA	6	27346	27357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016231	CT	7	28629	28641	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016231	TC	6	29262	29272	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016231	TC	6	29948	29958	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016231	AT	6	30292	30303	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016231	GA	7	30396	30408	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016231	TA	6	31074	31085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016231	TC	7	31482	31494	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016231	AT	6	31877	31888	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016231	AG	6	33925	33935	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016231	AG	6	37361	37371	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016231	AG	6	37945	37955	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016231	CT	6	38107	38118	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016231	TC	6	38600	38610	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016231	TA	7	40449	40461	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016231	TA	6	41682	41693	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016231	TA	7	43705	43718	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016231	TA	6	44551	44562	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016231	GA	7	47133	47145	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016231	GA	6	48918	48928	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016231	AG	6	49730	49740	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016231	AG	6	51480	51490	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016231	TC	6	55482	55492	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016231	TC	6	57431	57443	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016231	AT	6	59700	59711	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016231	AT	6	60166	60177	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016231	AT	6	61555	61566	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016231	TA	10	62122	62140	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_016231	AG	6	63179	63189	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016231	GA	6	63785	63795	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016231	CT	6	64202	64212	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016231	TC	6	64840	64850	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016231	TC	6	66207	66217	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016231	AG	6	67718	67728	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016231	TA	9	76371	76387	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_016231	TA	7	77361	77377	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_016231	TA	6	77796	77807	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016231	TA	6	78525	78536	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016231	AT	6	80793	80804	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016231	AG	6	89080	89091	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016231	CA	6	90331	90341	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016231	TC	7	95128	95140	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016231	TA	6	98024	98034	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016231	TA	6	98354	98365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016231	TA	6	99134	99144	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016231	TA	6	100352	100362	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016231	GT	6	103355	103366	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016231	AG	6	104392	104403	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016231	AG	6	105940	105950	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016231	AG	6	112728	112738	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016231	GA	6	112944	112954	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 16