ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 16

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016231	AG	6	514	525	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016231	AG	6	1581	1591	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016231	CTAC	3	1754	1765	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016231	GTA	4	2009	2020	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016231	TTTC	3	2951	2961	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016231	TCT	4	3584	3596	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016231	CT	6	4004	4015	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016231	TA	8	4826	4841	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016231	GCAT	3	4875	4885	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016231	TC	6	5838	5848	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016231	TA	7	6613	6626	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016231	TTTG	3	6782	6793	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016231	GAA	4	7324	7334	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016231	GCG	4	7700	7710	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016231	TCT	4	8578	8588	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016231	AG	6	9006	9016	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016231	TGAA	3	9031	9041	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016231	AG	6	9106	9116	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016231	TA	6	9212	9223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016231	TAAA	3	10129	10139	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016231	CTTA	3	12587	12597	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016231	ACAAG	3	13009	13023	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016231	CCT	4	13322	13333	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016231	TC	6	13414	13424	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016231	AGA	4	14371	14382	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016231	AAG	5	16001	16016	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016231	GA	6	19892	19902	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016231	GAAC	3	20594	20605	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016231	CGAG	3	21126	21138	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016231	TCT	4	21900	21911	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016231	CTTT	3	22448	22459	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016231	TTTG	3	23356	23366	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016231	CTT	4	23818	23828	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016231	CTT	4	24215	24226	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016231	TCT	4	24271	24283	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016231	TCT	4	24664	24674	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016231	ACC	4	24741	24752	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016231	AAAAG	3	25364	25377	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016231	TA	6	26586	26596	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016231	CTAC	3	27049	27060	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016231	CT	6	27157	27167	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016231	TA	6	27346	27357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016231	AGAA	3	27725	27736	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016231	TCC	4	28192	28203	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016231	GAA	5	28433	28447	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016231	GAA	4	28475	28485	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016231	CT	7	28629	28641	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016231	TTC	4	28983	28993	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016231	TC	6	29262	29272	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016231	CTT	4	29802	29813	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016231	TC	6	29948	29958	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016231	TCT	4	30131	30141	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016231	AT	6	30292	30303	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016231	GA	7	30396	30408	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016231	AGC	4	30578	30589	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016231	TA	6	31074	31085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016231	TC	7	31482	31494	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016231	CTTT	3	31756	31767	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016231	AT	6	31877	31888	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016231	AAG	4	32070	32081	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016231	AAGA	3	32502	32514	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016231	TGA	4	32717	32727	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016231	TTTTCT	3	33181	33199	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
64	NC_016231	CAA	4	33516	33526	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016231	TAGG	3	33911	33922	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016231	AG	6	33925	33935	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016231	TGAA	3	34097	34107	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016231	TCT	5	35215	35228	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016231	CAAG	3	35276	35288	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016231	GAAG	3	35564	35575	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016231	AGGA	3	36032	36042	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016231	TTTG	3	36223	36233	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016231	CTTT	3	36562	36572	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016231	AG	6	37361	37371	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016231	AG	6	37945	37955	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016231	TCT	4	38033	38043	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016231	CT	6	38107	38118	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016231	A	13	38576	38588	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016231	TC	6	38600	38610	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016231	CTT	4	39032	39043	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016231	TA	7	40449	40461	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016231	TA	6	41682	41693	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016231	TAGC	4	42064	42078	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016231	CTTT	3	42172	42183	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016231	GCTT	3	43020	43031	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016231	TA	7	43705	43718	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016231	TTAG	3	43817	43827	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016231	AGA	4	44240	44252	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016231	TA	6	44551	44562	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016231	GCATTA	3	46198	46214	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
91	NC_016231	GA	7	47133	47145	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016231	CGAG	3	47258	47270	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016231	TGAA	3	47292	47302	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016231	GCTTT	3	47779	47792	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016231	TCTT	3	47916	47927	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016231	AGA	4	48154	48164	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016231	GGA	4	48466	48477	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016231	GGAA	3	48578	48589	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016231	CAAG	3	48594	48606	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016231	GAG	4	48789	48800	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016231	GA	6	48918	48928	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016231	GTT	4	49580	49591	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016231	TCT	4	49627	49637	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016231	AG	6	49730	49740	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016231	TTTC	3	50048	50059	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016231	AG	6	51480	51490	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016231	ACCT	3	52156	52167	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016231	AAG	4	52364	52375	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016231	CTT	4	52767	52778	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016231	TTTC	3	52808	52819	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016231	AGAAGG	3	54025	54041	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
112	NC_016231	TGAA	3	54057	54067	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016231	TCT	4	54974	54984	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016231	TC	6	55482	55492	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016231	TTGTCT	3	56223	56240	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016231	TCTT	4	56376	56391	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016231	CTT	4	56573	56583	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016231	AAAG	4	57051	57065	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016231	TC	6	57431	57443	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016231	CCTC	3	59273	59283	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016231	AT	6	59700	59711	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016231	AT	6	60166	60177	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016231	TTTC	3	60918	60928	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016231	AT	6	61555	61566	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016231	TA	10	62122	62140	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
126	NC_016231	AG	6	63179	63189	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016231	TTTGCT	3	63601	63619	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
128	NC_016231	ATTTT	3	63636	63650	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016231	GA	6	63785	63795	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016231	CT	6	64202	64212	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016231	TC	6	64840	64850	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016231	TCT	4	64906	64916	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016231	TCCT	3	66174	66185	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016231	TC	6	66207	66217	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016231	AG	6	67718	67728	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016231	CTC	4	68206	68217	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016231	CCT	4	68264	68274	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016231	AAAC	3	69055	69066	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016231	GCAAA	3	69713	69727	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016231	TCT	4	70567	70578	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016231	TTTCT	3	72792	72806	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016231	AAGA	3	72878	72889	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_016231	TTTAA	3	116412	116427	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
200	NC_016231	GGAA	3	116566	116577	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 16