ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 2

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016230GA65375471150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
2NC_016230CTT4926936110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_016230TA7114511581450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_016230TA6119812091250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_016230TGC415471559130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
6NC_016230GAAA3180418141175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
7NC_016230CCTCC322382252150 %20 %0 %80 %6 %Non-Coding
8NC_016230TATCTC3401640321716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
9NC_016230TA6446244721150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_016230TAAG3469847091250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
11NC_016230CTC447464757120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
12NC_016230AAAAAG3619362091783.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
13NC_016230AT8645164661650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
14NC_016230AACT3667966901250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
15NC_016230GAC4670467141133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
16NC_016230AT8702570401650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_016230TA6748074901150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_016230TC678897900120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
19NC_016230TCT479447954110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
20NC_016230TAC4840884191233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
21NC_016230GA6919192021250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
22NC_016230CCT494869496110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
23NC_016230TA6964696561150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_016230CTAT310565105751125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
25NC_016230TA810804108181550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_016230ATCC311278112891225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
27NC_016230CTA512641126541433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
28NC_016230TAG413193132031133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
29NC_016230TAG413341133551533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
30NC_016230TAAC313795138051150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
31NC_016230TA615598156101350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_016230TCTT31572615737120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
33NC_016230AG615904159141150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
34NC_016230CTT41639416404110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
35NC_016230GGA416593166041233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
36NC_016230AG616657166681250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
37NC_016230TA817512175261550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
38NC_016230AAG418307183171166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
39NC_016230AGAA318422184331275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
40NC_016230TGTC31932019331120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
41NC_016230CTT42336123373130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
42NC_016230AAAG323514235241175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016230CTT42392523937130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
44NC_016230TC62453924550120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
45NC_016230TCT42481624826110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
46NC_016230TTTG32540325413110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
47NC_016230GAA526215262291566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
48NC_016230GGACC326911269241420 %0 %40 %40 %7 %Non-Coding
49NC_016230CCTA328032280431225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
50NC_016230G122950729518120 %0 %100 %0 %8 %Non-Coding
51NC_016230GTCA329591296031325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
52NC_016230CAAT330763307731150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
53NC_016230TTC43190331915130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
54NC_016230CTTT33204932059110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
55NC_016230TTCT33304533056120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
56NC_016230GGGC33442334434120 %0 %75 %25 %8 %Non-Coding
57NC_016230TCT43453434544110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
58NC_016230CTTT33480434815120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
59NC_016230GA835317353311550 %0 %50 %0 %6 %Non-Coding
60NC_016230AT635763357741250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_016230CT73644136454140 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
62NC_016230TC73649036502130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
63NC_016230TC63653636546110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
64NC_016230AGAA340435404461275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
65NC_016230CTT44055140562120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
66NC_016230CAC441753417631133.33 %0 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
67NC_016230TC64189741907110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
68NC_016230TA643319433291150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
69NC_016230TA744540445521350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_016230TC74547445486130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
71NC_016230GAAT347390474001150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
72NC_016230TCT44798447995120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
73NC_016230TA1048164481821950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
74NC_016230CTT44931449324110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
75NC_016230AAGG349478494891250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
76NC_016230AAAG349657496671175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
77NC_016230TGC44984549855110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
78NC_016230AAG449995500071366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
79NC_016230TAT450092501021133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016230TA751638516511450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
81NC_016230AGA451967519771166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
82NC_016230CACC352818528281125 %0 %0 %75 %9 %Non-Coding
83NC_016230AAGT354541545511150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
84NC_016230TA655180551911250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_016230TCTT35599456005120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
86NC_016230ATT456370563801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
87NC_016230AG656646566561150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
88NC_016230GAA457279572901266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
89NC_016230GTCT35785857868110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
90NC_016230CA658306583171250 %0 %0 %50 %8 %Non-Coding
91NC_016230CTCTT35865458667140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
92NC_016230AGA459547595591366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
93NC_016230CAACG359570595831440 %0 %20 %40 %7 %Non-Coding
94NC_016230TC66083960849110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
95NC_016230TCTT36097360984120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
96NC_016230GCAAA361726617391460 %0 %20 %20 %7 %Non-Coding
97NC_016230AG661816618261150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
98NC_016230TGAA361854618641150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
99NC_016230TTTTTC36233062347180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
100NC_016230CTT46271862728110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
101NC_016230CTT46283362843110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
102NC_016230TTTA362864628741125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
103NC_016230TC76292762939130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
104NC_016230TTCT36377963789110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
105NC_016230TGAA364048640581150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
106NC_016230GA664120641301150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
107NC_016230AAG464516645271266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
108NC_016230AG664775647851150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
109NC_016230CTA464831648411133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
110NC_016230AAGC364909649191150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
111NC_016230ACA466462664731266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
112NC_016230TAG467839678501233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
113NC_016230ACT467892679031233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
114NC_016230AAAG368181681911175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
115NC_016230AATCA368706687201560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
116NC_016230AAAG368845688561275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
117NC_016230ATCTA368926689391440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
118NC_016230GCC46920669216110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
119NC_016230CTTT57209772116200 %75 %0 %25 %10 %Non-Coding
120NC_016230CTA573677736901433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
121NC_016230GT77486274874130 %50 %50 %0 %7 %Non-Coding
122NC_016230TA675645756551150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
123NC_016230AGGAA375843758561460 %0 %40 %0 %7 %Non-Coding
124NC_016230TATT377265772761225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
125NC_016230GAG477498775091233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
126NC_016230TCCC37803478046130 %25 %0 %75 %7 %Non-Coding
127NC_016230CCA478081780921233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
128NC_016230TTTC37821778227110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
129NC_016230CTATTA379065790811733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
130NC_016230ACT480195802051133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
131NC_016230AAGC381883818931150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
132NC_016230A12825388254912100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
133NC_016230TTAAA383278832921560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
134NC_016230ATTT583296833152025 %75 %0 %0 %10 %Non-Coding
135NC_016230TTAT384679846891125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
136NC_016230AAC485401854121266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
137NC_016230TA686690867001150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
138NC_016230TA687018870291250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
139NC_016230GA689497895071150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
140NC_016230AG691844918551250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
141NC_016230TA892715927291550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
142NC_016230GATC393304933141125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
143NC_016230AGA493983939951366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
144NC_016230AAGA395936959481375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
145NC_016230TA797185971971350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
146NC_016230TTTC39767797687110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
147NC_016230CT69811698127120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
148NC_016230TA61001991002091150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
149NC_016230CTT4100344100355120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
150NC_016230AGG41018861018971233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
151NC_016230CTG4102221102232120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
152NC_016230GAAA31024941025041175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
153NC_016230GGAA31030451030551150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
154NC_016230TAC61038361038541933.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
155NC_016230TCAG31046281046401325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
156NC_016230CTT4105840105850110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
157NC_016230GAAA31058671058781275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
158NC_016230CTAT31062531062651325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
159NC_016230GTTA31068191068291125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
160NC_016230TA61073381073491250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
161NC_016230AACC31078231078331150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
162NC_016230AAAG31085571085671175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
163NC_016230GAAAA31088631088761480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
164NC_016230AAAAG31089221089351480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
165NC_016230TC8109990110004150 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
166NC_016230CTTT4111146111160150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
167NC_016230TCTT3112673112684120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
168NC_016230GAA41147991148091166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
169NC_016230GGAT31152221152331225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
170NC_016230GAA41158141158251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
171NC_016230AAGA51161711161891975 %0 %25 %0 %10 %Non-Coding
172NC_016230CAAC31163131163241250 %0 %0 %50 %8 %Non-Coding
173NC_016230ACTT31173121173231225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
174NC_016230TTAT31181271181381225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
175NC_016230TA91186591186761850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
176NC_016230CTT4119075119086120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
177NC_016230TTCT3119609119619110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
178NC_016230AGT41200271200381233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
179NC_016230GAA41202151202261266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
180NC_016230CAGA31203681203781150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
181NC_016230TTA41204511204611133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
182NC_016230CAAG31207731207841250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
183NC_016230AAG41211891212001266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
184NC_016230TTTC3121279121289110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
185NC_016230AG71221761221881350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
186NC_016230TA61226951227051150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
187NC_016230TA61228741228841150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
188NC_016230CTGT3124158124168110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
189NC_016230TACC31244631244731125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
190NC_016230AGAA31256871256971175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
191NC_016230TTAG31265521265631225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
192NC_016230CTAA31266741266851250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
193NC_016230AAG41267711267811166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
194NC_016230GAAA31269681269781175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
195NC_016230CCG4128627128638120 %0 %33.33 %66.67 %8 %Non-Coding
196NC_016230TTGT3129494129505120 %75 %25 %0 %0 %Non-Coding
197NC_016230AGAA41310151310301675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
198NC_016230CT6132144132155120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
199NC_016230CTTT3132244132254110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
200NC_016230TC6133426133437120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
201NC_016230TC6133772133782110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
202NC_016230TTTC3134027134037110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
203NC_016230GA61342621342721150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
204NC_016230CCCT3134841134851110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
205NC_016230GA61348811348911150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
206NC_016230TCATA31357631357771540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
207NC_016230TCTT3138890138900110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
208NC_016230GAA51392311392441466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
209NC_016230AGA51394331394461466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
210NC_016230CT6140273140283110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
211NC_016230TCT5140461140474140 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
212NC_016230ATAG31416731416831150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
213NC_016230CCTA31424441424541125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
214NC_016230CTT4142710142721120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
215NC_016230CCCT3143704143715120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
216NC_016230AAAG31438991439101275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
217NC_016230ATCC31446141446241125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
218NC_016230TCCT3144683144693110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
219NC_016230CTT4144817144827110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
220NC_016230GAG41455441455541133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
221NC_016230TA61459291459401250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
222NC_016230CTT4146082146094130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
223NC_016230CT7146401146415150 %50 %0 %50 %6 %Non-Coding
224NC_016230CTTA31467791467901225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
225NC_016230CCT4147260147271120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
226NC_016230TC7148039148051130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
227NC_016230GAAA31486721486831275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
228NC_016230TA61500661500761150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
229NC_016230GAAAT31520471520611560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
230NC_016230CTT4152852152862110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
231NC_016230CTTT3153112153123120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
232NC_016230CTT4153569153580120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
233NC_016230GA61536951537051150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
234NC_016230CTTT3153820153831120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
235NC_016230TA61542161542261150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
236NC_016230CGAA31553441553541150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
237NC_016230CCAC31556471556571125 %0 %0 %75 %9 %Non-Coding
238NC_016230AACCT31558161558291440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding