ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 57

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016229	AAG	4	782	793	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016229	TA	6	2217	2228	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016229	TGAA	3	2927	2937	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016229	AGAGGA	3	3083	3099	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016229	ACTT	3	3651	3661	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016229	GAG	5	4065	4079	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016229	CTTCT	3	4931	4944	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016229	TGAA	3	5111	5121	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016229	GGA	4	5148	5159	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016229	CTTT	3	5801	5812	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016229	TTAT	3	5890	5901	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016229	ATAGT	3	6279	6292	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016229	CAGG	3	6822	6833	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016229	GGA	4	7360	7370	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016229	CTT	4	7716	7728	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016229	CTT	4	7753	7764	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016229	CTT	4	7777	7787	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016229	TTG	5	8047	8061	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016229	AAG	4	9351	9362	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016229	GAAAG	3	9735	9749	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_016229	TTTG	3	10282	10294	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016229	GTTT	3	10599	10610	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016229	TC	6	10795	10805	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016229	AAG	6	10932	10948	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_016229	GGAA	3	11246	11256	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016229	TC	6	11592	11602	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016229	CTT	4	11769	11780	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016229	GAG	4	13025	13036	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016229	TGAA	3	13443	13453	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016229	CTTT	3	13808	13819	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016229	GA	7	14940	14952	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016229	AG	6	15282	15292	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016229	TTTG	3	15707	15719	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016229	TC	6	15934	15945	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016229	AGA	4	16527	16537	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016229	TTCTT	3	17729	17742	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016229	GGT	4	18183	18195	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016229	CTTT	3	18694	18704	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016229	CTTA	3	18799	18810	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016229	TCG	4	19382	19392	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016229	AT	6	19445	19456	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016229	TACT	3	20184	20195	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016229	AG	6	20633	20643	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016229	TCTTT	3	20871	20886	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016229	TCT	4	22065	22075	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016229	GATT	3	22559	22570	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016229	AGTT	3	23257	23267	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016229	TGA	4	24237	24247	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016229	AG	6	25707	25717	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016229	GA	6	28420	28430	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016229	AG	6	29002	29012	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016229	AGA	4	30376	30387	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016229	CTT	4	30990	31001	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016229	GGA	4	31499	31510	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016229	GAG	6	31533	31551	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
56	NC_016229	ATG	4	31761	31772	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016229	TCTT	3	31858	31869	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016229	TTTGCT	3	32122	32140	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
59	NC_016229	GA	6	32526	32536	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016229	GA	6	32654	32664	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016229	TTC	4	33178	33189	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016229	CTTT	3	33327	33337	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016229	GAA	4	33360	33372	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016229	GGA	4	33527	33538	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016229	GA	7	33599	33611	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016229	CT	6	33809	33819	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016229	AAAG	5	34756	34775	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_016229	AAAG	3	35430	35440	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016229	AAG	4	38033	38044	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016229	AGCCC	3	38127	38140	14	20 %	0 %	20 %	60 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016229	CT	6	38930	38940	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016229	ACA	4	39858	39868	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016229	AAG	4	40135	40145	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016229	TCGA	3	40399	40410	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016229	CT	6	40571	40581	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016229	TA	6	40775	40785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016229	AAG	4	43042	43052	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016229	AGAA	3	43870	43880	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016229	GAA	4	43992	44003	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016229	CTT	5	44668	44682	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016229	AAG	4	45414	45425	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016229	CTTTA	3	45633	45646	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016229	CT	6	45936	45947	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016229	TAA	4	46990	47002	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016229	CTA	5	47097	47111	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016229	TTAGA	3	47227	47240	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016229	AG	6	47687	47698	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016229	AT	7	48448	48460	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016229	AT	6	48463	48474	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016229	TGT	4	49131	49141	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016229	TTTC	3	49403	49414	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016229	GAA	4	49949	49961	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016229	GTA	4	50331	50342	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016229	AAAG	3	50729	50741	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016229	CTTA	4	51032	51047	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016229	AGC	4	52163	52175	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016229	TCT	4	52331	52342	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016229	TA	6	52967	52978	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016229	CT	6	53825	53836	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016229	CTT	4	55122	55132	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016229	TTC	4	55305	55317	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016229	AATTT	3	55387	55401	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016229	ACCT	4	56837	56851	15	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016229	TC	6	57656	57666	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016229	AAAG	4	58669	58685	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_016229	AAAG	3	59038	59049	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016229	GGAA	3	59117	59128	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016229	AG	6	59607	59618	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016229	AGA	4	59815	59826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016229	CAA	4	60272	60282	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016229	AAC	4	60909	60919	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016229	GAAA	3	61192	61204	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016229	AAG	4	62301	62312	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016229	TTATC	3	63568	63582	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016229	GCA	4	66066	66077	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016229	CCTTT	3	67409	67423	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016229	TAC	4	67611	67622	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016229	AGA	4	68967	68979	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016229	AAAGT	3	69448	69462	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016229	ACT	4	70623	70633	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016229	TA	7	71528	71540	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016229	CTA	4	72078	72088	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016229	TA	6	72638	72648	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016229	GA	6	73652	73663	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016229	GAC	4	74578	74588	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016229	CTTC	3	74605	74615	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016229	TA	6	75265	75275	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016229	AG	6	76029	76039	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016229	GA	7	76073	76085	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016229	AAAG	3	76174	76184	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016229	GA	6	76201	76212	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016229	GAA	4	78113	78125	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016229	GA	6	78510	78520	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016229	TAG	5	78732	78745	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016229	TC	6	78869	78880	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016229	TA	6	80151	80161	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016229	GACT	3	80404	80414	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016229	TTCT	3	80625	80636	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016229	CT	6	80678	80689	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016229	AAAG	4	80913	80928	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
141	NC_016229	A	14	81155	81168	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016229	TA	8	81765	81779	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016229	CTT	4	82420	82432	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016229	CTTT	3	82728	82738	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016229	TA	6	84255	84265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016229	AT	6	84499	84510	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 57