ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 11

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016227	GAG	4	1048	1059	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016227	TGAA	3	1227	1237	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016227	AGAAGG	3	1253	1269	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_016227	CG	6	2038	2049	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016227	TCT	5	2369	2383	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016227	TAAGGG	3	2843	2860	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_016227	CTT	4	3338	3348	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016227	CTTT	4	4446	4462	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016227	TCTT	3	4538	4549	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016227	AAG	4	4572	4582	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016227	AT	6	4758	4769	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016227	AG	6	5072	5082	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016227	GAG	4	5298	5309	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016227	TGAA	3	5381	5391	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016227	AAAGA	3	5908	5921	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016227	CG	6	6093	6104	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016227	TTAG	3	6184	6194	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016227	TAGAAA	3	6246	6264	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016227	AGC	4	6392	6403	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016227	AT	6	6520	6531	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016227	TCTT	3	8924	8935	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016227	CTTT	3	9030	9040	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016227	TTC	4	9042	9052	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016227	CTT	4	9689	9699	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016227	CTTTT	3	9998	10012	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016227	CTTT	4	11164	11179	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016227	GA	6	11228	11238	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016227	AAAG	3	11590	11600	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016227	GAAAA	3	11841	11855	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016227	TTTC	3	12252	12263	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016227	CTTTTT	3	12869	12887	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
32	NC_016227	TTTTC	3	12941	12955	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016227	GCAAA	3	13107	13120	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016227	GCA	4	13902	13913	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016227	AAG	4	14171	14183	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016227	CGAG	3	14925	14937	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016227	TGAA	3	14959	14969	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016227	AG	7	15113	15125	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016227	TTTC	3	15311	15321	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016227	TGAA	3	15519	15529	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016227	GAGGA	3	15590	15605	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016227	ATTA	3	15716	15727	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016227	ATTA	4	15777	15792	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016227	ATTAA	3	15863	15876	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016227	AAAG	4	15984	15998	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016227	TTA	4	16032	16044	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016227	ATTA	4	16233	16249	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_016227	AAAG	3	16336	16347	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016227	AAAG	3	16753	16764	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016227	AAAG	5	16790	16810	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016227	GAAA	3	16834	16844	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016227	TA	6	16980	16991	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016227	TTCT	3	17100	17112	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016227	AG	6	17142	17152	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016227	GATC	3	17795	17805	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016227	AAGA	4	18261	18275	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016227	AAG	4	18337	18348	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016227	AG	6	18680	18690	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016227	CT	7	19013	19027	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016227	TCC	4	19053	19064	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016227	TCTT	4	19277	19292	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016227	TCTT	3	19617	19627	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016227	TAGC	3	19779	19790	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016227	AAGG	3	19957	19967	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016227	AAG	4	20020	20031	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016227	AAG	5	20255	20270	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016227	AAGTC	3	20419	20432	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016227	GA	8	21768	21782	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016227	ATG	4	22604	22614	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016227	TG	6	23347	23360	14	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016227	GAAA	3	24360	24371	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016227	TCTTT	3	24997	25011	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016227	TA	6	25742	25753	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016227	CG	6	26076	26087	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016227	GAG	4	26631	26642	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016227	AGG	4	26694	26704	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016227	CT	7	26981	26993	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016227	AAAG	3	27624	27634	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016227	AGA	4	28008	28020	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016227	TCTT	3	28103	28115	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016227	TGAA	3	28485	28495	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016227	GA	8	28526	28540	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016227	GA	7	28559	28571	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016227	AAAG	3	29683	29694	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016227	CT	7	29701	29713	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016227	TA	6	29786	29796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016227	CG	6	29797	29808	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016227	AACT	3	29999	30010	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016227	TCTTT	3	31071	31086	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016227	CG	6	31709	31720	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016227	CTTT	3	31860	31870	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016227	AAAAG	3	32031	32045	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016227	AGAA	3	32087	32099	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016227	TGAA	3	32538	32548	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016227	GA	7	32614	32626	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016227	AAG	4	32691	32701	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016227	GAAA	3	32929	32940	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016227	AAAG	3	33106	33117	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016227	CTTA	3	33207	33219	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016227	AAG	4	33464	33475	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016227	CTTA	3	33734	33744	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016227	AAGAA	4	34361	34379	19	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016227	AG	6	35425	35435	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016227	GAAA	3	36956	36966	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016227	TA	6	37142	37154	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016227	CTTC	3	37498	37509	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016227	TGAA	3	38196	38206	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016227	GGA	4	38233	38244	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016227	GGA	4	38291	38302	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016227	AG	7	38355	38367	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016227	ATAA	3	38517	38528	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016227	GAAA	3	38894	38904	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016227	AGA	4	39424	39435	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016227	AT	7	39510	39522	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016227	TA	6	39564	39575	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016227	CTT	4	39584	39594	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016227	GGCT	3	39939	39949	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016227	ATTC	3	40950	40960	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016227	TTCT	3	41016	41026	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016227	AAAG	3	41620	41631	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016227	AG	6	42341	42352	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016227	CAAA	3	42759	42769	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016227	AATT	3	43806	43817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016227	CT	8	43878	43894	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
125	NC_016227	ATTA	4	43974	43989	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016227	CGAGAA	4	44362	44385	24	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016227	ACTT	3	44395	44406	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016227	AT	6	44891	44902	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016227	GAA	4	44905	44917	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016227	GA	6	45231	45241	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016227	GA	8	45386	45400	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016227	CG	8	46118	46133	16	0 %	0 %	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016227	GA	6	46312	46322	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016227	AAGAA	4	47827	47846	20	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
135	NC_016227	TTTTA	3	48659	48672	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	35796722
136	NC_016227	TGAA	3	48838	48848	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016227	GA	7	48929	48941	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016227	AG	6	49063	49073	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016227	AGA	4	49306	49316	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016227	AGAGG	20	49668	49767	100	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016227	AG	6	49836	49846	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016227	CTTG	3	50442	50453	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016227	ATATTA	3	50607	50625	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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283	NC_016227	CCTT	3	114118	114128	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
284	NC_016227	TAG	4	114167	114177	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
285	NC_016227	CTTT	3	114500	114511	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016227	ACTT	3	115266	115276	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
287	NC_016227	AG	7	115379	115391	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
288	NC_016227	AG	6	118247	118257	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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290	NC_016227	CG	7	118758	118771	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
291	NC_016227	TC	7	119052	119064	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
292	NC_016227	AAAG	3	119910	119920	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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307	NC_016227	CT	6	124083	124094	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
308	NC_016227	CTT	4	124642	124652	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 11