ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 11

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016227	TGAA	3	1227	1237	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016227	CTTT	4	4446	4462	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016227	TCTT	3	4538	4549	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016227	TGAA	3	5381	5391	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016227	TTAG	3	6184	6194	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016227	TCTT	3	8924	8935	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016227	CTTT	3	9030	9040	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016227	CTTT	4	11164	11179	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016227	AAAG	3	11590	11600	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016227	TTTC	3	12252	12263	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016227	CGAG	3	14925	14937	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016227	TGAA	3	14959	14969	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016227	TTTC	3	15311	15321	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016227	TGAA	3	15519	15529	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016227	ATTA	3	15716	15727	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016227	ATTA	4	15777	15792	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016227	AAAG	4	15984	15998	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016227	ATTA	4	16233	16249	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016227	AAAG	3	16336	16347	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016227	AAAG	3	16753	16764	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016227	AAAG	5	16790	16810	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016227	GAAA	3	16834	16844	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016227	TTCT	3	17100	17112	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016227	GATC	3	17795	17805	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016227	AAGA	4	18261	18275	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016227	TCTT	4	19277	19292	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016227	TCTT	3	19617	19627	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016227	TAGC	3	19779	19790	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016227	AAGG	3	19957	19967	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016227	GAAA	3	24360	24371	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016227	AAAG	3	27624	27634	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016227	TCTT	3	28103	28115	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016227	TGAA	3	28485	28495	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016227	AAAG	3	29683	29694	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016227	AACT	3	29999	30010	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016227	CTTT	3	31860	31870	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016227	AGAA	3	32087	32099	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016227	TGAA	3	32538	32548	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016227	GAAA	3	32929	32940	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016227	AAAG	3	33106	33117	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016227	CTTA	3	33207	33219	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016227	CTTA	3	33734	33744	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016227	GAAA	3	36956	36966	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016227	CTTC	3	37498	37509	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016227	TGAA	3	38196	38206	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016227	ATAA	3	38517	38528	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016227	GAAA	3	38894	38904	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016227	GGCT	3	39939	39949	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016227	ATTC	3	40950	40960	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016227	TTCT	3	41016	41026	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016227	AAAG	3	41620	41631	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016227	CAAA	3	42759	42769	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016227	AATT	3	43806	43817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016227	ATTA	4	43974	43989	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016227	ACTT	3	44395	44406	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016227	TGAA	3	48838	48848	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016227	CTTG	3	50442	50453	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016227	ATTA	4	50845	50860	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016227	AAAT	4	50861	50876	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016227	ATTA	4	52331	52346	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016227	AAAG	4	52595	52610	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016227	GTAA	3	52669	52680	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016227	CTTT	3	54070	54080	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016227	CAAG	3	54431	54442	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016227	TGAA	3	56567	56577	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016227	TGAA	3	56726	56736	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016227	CTTT	3	57433	57443	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016227	AAAG	3	57865	57876	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016227	TGAA	3	58361	58371	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016227	AGAA	3	60517	60528	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016227	TGAA	3	60690	60700	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016227	AAAG	3	60853	60865	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016227	AATT	3	61451	61462	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016227	CTTT	7	61558	61585	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
75	NC_016227	AAAG	3	61704	61714	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016227	TGAA	3	61801	61811	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016227	TGAA	3	62044	62054	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016227	TGAA	3	64470	64480	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016227	AAAG	3	68416	68427	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016227	TGAA	3	69052	69062	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016227	TGAA	3	69218	69228	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016227	CAAA	3	70490	70502	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016227	AAGA	3	70686	70697	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016227	AGAA	3	72588	72599	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016227	AGAA	3	73777	73788	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016227	TCTT	3	74320	74331	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016227	ACAG	3	74506	74517	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016227	AAAG	4	78331	78346	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016227	TCTT	3	80829	80839	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016227	GATA	3	82649	82660	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016227	CGAG	3	86595	86607	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016227	TTTA	3	88411	88421	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016227	ATCC	3	96374	96385	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016227	ACTT	3	97729	97740	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016227	CTTT	3	99993	100003	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016227	GAAA	3	104491	104502	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016227	AGGA	3	106945	106956	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016227	TATT	3	107106	107117	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016227	GATT	3	113900	113911	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016227	CCTT	3	114118	114128	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016227	CTTT	3	114500	114511	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016227	ACTT	3	115266	115276	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016227	AAAG	3	119910	119920	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016227	GTCA	3	121160	121171	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016227	AGAA	4	121322	121337	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016227	AAGA	4	123478	123492	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016227	TCTT	3	123873	123884	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

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Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 11