ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 12

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016226	GAAA	3	141	152	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016226	AGAA	3	2638	2648	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016226	TCTT	3	5285	5296	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016226	CATA	3	6002	6012	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016226	CGAA	3	6316	6328	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016226	ATTC	3	7511	7521	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016226	TAAA	3	9422	9433	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016226	TAAT	3	10492	10503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016226	CTTT	3	11439	11449	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016226	ACCT	3	15419	15430	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016226	TTAG	3	16674	16685	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016226	CTTT	3	21576	21587	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016226	TTTC	3	21589	21599	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016226	TGAA	3	22144	22154	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016226	CTTT	4	22283	22298	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016226	CTTT	3	22506	22517	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016226	ATTC	3	22857	22869	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016226	AAAG	3	24736	24748	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016226	CAAG	4	24790	24805	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016226	CTTT	3	25864	25874	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016226	TTCT	3	26132	26142	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016226	AGCG	3	26211	26221	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016226	CTTT	3	27707	27717	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016226	TGAA	3	29390	29400	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016226	TCTT	3	30144	30155	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016226	TGAA	3	31790	31800	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016226	CTTT	4	35009	35025	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
28	NC_016226	TCTT	3	35101	35112	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016226	TGAA	3	35944	35954	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016226	TTAG	3	36747	36757	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016226	TCTT	3	39487	39498	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016226	CTTT	3	39593	39603	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016226	CTTT	4	41727	41742	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016226	AAAG	3	42153	42163	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016226	TTTC	3	42815	42826	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016226	CGAG	3	45488	45500	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016226	TGAA	3	45522	45532	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016226	TTTC	3	45874	45884	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016226	TGAA	3	46082	46092	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016226	ATTA	3	46279	46290	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016226	ATTA	4	46340	46355	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016226	AAAG	4	46547	46561	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016226	ATTA	4	46796	46812	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016226	AAAG	3	46899	46910	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016226	AAAG	3	47316	47327	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016226	AAAG	5	47353	47373	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016226	GAAA	3	47397	47407	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016226	TTCT	3	47663	47675	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016226	GATC	3	48358	48368	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016226	AAGA	4	48824	48838	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016226	TCTT	4	49840	49855	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016226	TCTT	3	50180	50190	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016226	TAGC	3	50342	50353	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016226	AAGG	3	50520	50530	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016226	GAAA	3	54923	54934	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016226	AAAG	3	58187	58197	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016226	TCTT	3	58666	58678	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016226	TGAA	3	59048	59058	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016226	AAAG	3	60246	60257	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016226	AACT	3	60562	60573	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016226	CTTT	3	62423	62433	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016226	AGAA	3	62650	62662	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016226	TGAA	3	63101	63111	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016226	GAAA	3	63492	63503	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016226	AAAG	3	63669	63680	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016226	CTTA	3	63770	63782	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016226	CTTA	3	64297	64307	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016226	GAAA	3	67519	67529	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016226	CTTC	3	68061	68072	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016226	TGAA	3	68759	68769	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016226	ATAA	3	69080	69091	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016226	GAAA	3	69457	69467	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016226	GGCT	3	70502	70512	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016226	ATTC	3	71513	71523	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016226	TTCT	3	71579	71589	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016226	AAAG	3	72183	72194	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016226	CAAA	3	73322	73332	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016226	AATT	3	74369	74380	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016226	ATTA	4	74537	74552	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016226	ACTT	3	74958	74969	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016226	TGAA	3	79401	79411	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016226	CTTG	3	81005	81016	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016226	ATTA	4	81408	81423	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016226	AAAT	4	81424	81439	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_016226	ATTA	4	82894	82909	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016226	AAAG	4	83158	83173	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016226	GTAA	3	83232	83243	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016226	CTTT	3	84633	84643	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016226	CAAG	3	84994	85005	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016226	TGAA	3	87130	87140	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016226	TGAA	3	87289	87299	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016226	CTTT	3	87996	88006	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016226	AAAG	3	88428	88439	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016226	TGAA	3	88924	88934	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016226	AGAA	3	91080	91091	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016226	TGAA	3	91253	91263	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016226	AAAG	3	91416	91428	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016226	AATT	3	92014	92025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016226	CTTT	7	92121	92148	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
100	NC_016226	AAAG	3	92267	92277	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016226	TGAA	3	92364	92374	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016226	TGAA	3	92607	92617	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016226	TGAA	3	95033	95043	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016226	AAAG	3	98979	98990	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016226	TGAA	3	99615	99625	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016226	TGAA	3	99781	99791	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016226	CAAA	3	101053	101065	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016226	AAGA	3	101249	101260	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016226	AGAA	3	103151	103162	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016226	AGAA	3	104340	104351	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016226	TCTT	3	104883	104894	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016226	ACAG	3	105069	105080	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016226	CAAA	3	106573	106585	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016226	AAAG	4	107003	107018	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016226	CCTT	4	108502	108516	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016226	AAGG	3	108967	108977	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016226	CTTT	3	111114	111126	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016226	ACCT	3	113272	113282	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016226	CTTT	3	113368	113379	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016226	CTCC	3	113404	113415	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016226	TTAA	4	115140	115155	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016226	CATA	4	118027	118041	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016226	CAAA	3	118266	118277	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016226	GAAA	3	120113	120125	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding

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Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 12