ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 12

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016226	GAAA	3	141	152	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016226	CTG	4	1467	1478	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016226	CAA	4	1491	1501	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016226	AGAA	3	2638	2648	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016226	TA	8	3022	3036	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016226	GA	6	4978	4988	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016226	TCTT	3	5285	5296	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016226	CATA	3	6002	6012	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016226	CGAA	3	6316	6328	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016226	TTTAG	3	7189	7202	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016226	ATTC	3	7511	7521	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016226	CGAAA	3	8095	8110	16	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016226	AGA	4	8808	8818	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016226	TAAA	3	9422	9433	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016226	GAT	4	9534	9545	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016226	TAAT	3	10492	10503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016226	AGA	4	10602	10613	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016226	CGGTA	3	10744	10758	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016226	CTTT	3	11439	11449	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016226	AATTGT	3	11556	11574	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016226	TAT	4	11590	11601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016226	GA	6	13827	13837	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016226	AT	6	14852	14862	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016226	ACCT	3	15419	15430	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016226	TA	6	15529	15540	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016226	TTAG	3	16674	16685	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016226	AGA	4	18299	18310	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016226	TTCTT	3	19371	19384	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016226	CTT	5	20252	20266	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016226	AG	7	21331	21343	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016226	GA	6	21387	21397	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016226	CTTT	3	21576	21587	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016226	TTTC	3	21589	21599	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016226	TA	6	21810	21821	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016226	CG	7	21822	21835	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016226	GAG	4	21932	21943	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016226	TGAA	3	22144	22154	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016226	CTTT	4	22283	22298	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016226	AT	6	22325	22335	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016226	CTT	4	22427	22437	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016226	CT	6	22487	22497	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016226	CTTT	3	22506	22517	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016226	CAAAG	3	22642	22655	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016226	AG	6	22671	22681	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016226	CTTTTT	3	22760	22778	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
46	NC_016226	ATTC	3	22857	22869	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016226	AAAG	3	24736	24748	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016226	CAAG	4	24790	24805	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016226	GAA	4	25252	25263	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016226	CTTT	3	25864	25874	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016226	GT	6	25975	25986	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016226	TTCT	3	26132	26142	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016226	AGCG	3	26211	26221	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016226	AG	6	26244	26254	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016226	ATAGA	5	26507	26530	24	60 %	20 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
56	NC_016226	CTTT	3	27707	27717	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016226	TGAA	3	29390	29400	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016226	AGGAG	3	29527	29541	15	40 %	0 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016226	AG	6	29826	29837	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016226	TCTT	3	30144	30155	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016226	GAG	4	31611	31622	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016226	TGAA	3	31790	31800	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016226	AGAAGG	3	31816	31832	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016226	CG	6	32601	32612	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016226	TCT	5	32932	32946	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016226	TAAGGG	3	33406	33423	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_016226	CTT	4	33901	33911	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016226	CTTT	4	35009	35025	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016226	TCTT	3	35101	35112	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016226	AAG	4	35135	35145	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016226	AT	6	35321	35332	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016226	AG	6	35635	35645	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016226	GAG	4	35861	35872	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016226	TGAA	3	35944	35954	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016226	AAAGA	3	36471	36484	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016226	CG	6	36656	36667	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016226	TTAG	3	36747	36757	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016226	TAGAAA	3	36809	36827	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016226	AGC	4	36955	36966	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016226	AT	6	37083	37094	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016226	TCTT	3	39487	39498	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016226	CTTT	3	39593	39603	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016226	TTC	4	39605	39615	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016226	CTT	4	40252	40262	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016226	CTTTT	3	40561	40575	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016226	CTTT	4	41727	41742	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016226	GA	6	41791	41801	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016226	AAAG	3	42153	42163	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016226	GAAAA	3	42404	42418	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016226	TTTC	3	42815	42826	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016226	CTTTTT	3	43432	43450	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
92	NC_016226	TTTTC	3	43504	43518	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016226	GCAAA	3	43670	43683	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016226	GCA	4	44465	44476	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016226	AAG	4	44734	44746	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016226	CGAG	3	45488	45500	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016226	TGAA	3	45522	45532	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016226	AG	7	45676	45688	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016226	TTTC	3	45874	45884	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016226	TGAA	3	46082	46092	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016226	GAGGA	3	46153	46168	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016226	ATTA	3	46279	46290	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016226	ATTA	4	46340	46355	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016226	ATTAA	3	46426	46439	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016226	AAAG	4	46547	46561	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016226	TTA	4	46595	46607	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016226	ATTA	4	46796	46812	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_016226	AAAG	3	46899	46910	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016226	AAAG	3	47316	47327	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016226	AAAG	5	47353	47373	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016226	GAAA	3	47397	47407	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016226	TA	6	47543	47554	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016226	TTCT	3	47663	47675	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016226	AG	6	47705	47715	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016226	GATC	3	48358	48368	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016226	AAGA	4	48824	48838	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016226	AAG	4	48900	48911	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016226	AG	6	49243	49253	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016226	CT	7	49576	49590	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
120	NC_016226	TCC	4	49616	49627	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016226	TCTT	4	49840	49855	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016226	TCTT	3	50180	50190	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016226	TAGC	3	50342	50353	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016226	AAGG	3	50520	50530	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016226	AAG	4	50583	50594	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016226	AAG	5	50818	50833	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_016226	AAGTC	3	50982	50995	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016226	GA	8	52331	52345	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016226	ATG	4	53167	53177	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016226	TG	6	53910	53923	14	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016226	GAAA	3	54923	54934	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016226	TCTTT	3	55560	55574	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016226	TA	6	56305	56316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016226	CG	6	56639	56650	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016226	GAG	4	57194	57205	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016226	AGG	4	57257	57267	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016226	CT	7	57544	57556	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016226	AAAG	3	58187	58197	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016226	AGA	4	58571	58583	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016226	TCTT	3	58666	58678	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016226	TGAA	3	59048	59058	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016226	GA	8	59089	59103	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016226	GA	7	59122	59134	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
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283	NC_016226	GTAAA	3	103235	103248	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
284	NC_016226	TC	7	103824	103836	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
285	NC_016226	AT	6	104305	104315	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
286	NC_016226	AGAA	3	104340	104351	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016226	TCTT	3	104883	104894	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
288	NC_016226	ACAG	3	105069	105080	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
289	NC_016226	CT	7	105111	105123	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
290	NC_016226	TC	7	105335	105347	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
291	NC_016226	TC	6	105737	105747	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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295	NC_016226	AAAAG	3	107359	107373	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
296	NC_016226	CT	6	107470	107480	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
297	NC_016226	CCTT	4	108502	108516	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
298	NC_016226	AAGG	3	108967	108977	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
299	NC_016226	AAG	4	110219	110229	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
300	NC_016226	CTTT	3	111114	111126	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
301	NC_016226	GAA	4	111508	111519	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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306	NC_016226	CTTT	3	113368	113379	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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312	NC_016226	CTTTT	3	115758	115772	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
313	NC_016226	AT	8	116555	116569	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
314	NC_016226	CATA	4	118027	118041	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
315	NC_016226	CAAA	3	118266	118277	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
316	NC_016226	AG	6	118865	118875	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
317	NC_016226	GAAA	3	120113	120125	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
318	NC_016226	TA	9	120473	120490	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 12