ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 23

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016225	AATT	3	322	333	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016225	ATTA	4	490	505	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016225	ACTT	3	911	922	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016225	TGAA	3	5354	5364	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016225	CTTG	3	6958	6969	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016225	ATTA	4	7361	7376	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016225	AAAT	4	7377	7392	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016225	ATTA	4	8847	8862	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016225	AAAG	4	9111	9126	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016225	GTAA	3	9185	9196	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016225	CTTT	3	10586	10596	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016225	CAAG	3	10947	10958	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016225	TGAA	3	13083	13093	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016225	TGAA	3	13242	13252	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016225	CTTT	3	13949	13959	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016225	AAAG	3	14381	14392	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016225	TGAA	3	14877	14887	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016225	AGAA	3	17033	17044	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016225	TGAA	3	17206	17216	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016225	AAAG	3	17369	17381	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016225	AATT	3	17967	17978	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016225	CTTT	7	18074	18101	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
23	NC_016225	AAAG	3	18220	18230	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016225	TGAA	3	18317	18327	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016225	TGAA	3	18560	18570	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016225	TGAA	3	20986	20996	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016225	AAAG	3	24932	24943	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016225	TGAA	3	25568	25578	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016225	TGAA	3	25734	25744	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016225	CAAA	3	27006	27018	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016225	AAGA	3	27202	27213	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016225	AGAA	3	29104	29115	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016225	AGAA	3	30293	30304	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016225	TCTT	3	30836	30847	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016225	ACAG	3	31022	31033	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016225	AAAG	4	34847	34862	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016225	TCTT	3	37345	37355	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016225	GATA	3	39165	39176	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016225	AAAG	3	48602	48612	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016225	CGAG	3	52459	52470	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016225	TGAA	3	54096	54106	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016225	CTTT	3	54749	54760	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016225	TTTC	3	54762	54772	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016225	TGAA	3	55317	55327	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016225	CTTT	4	55456	55471	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016225	CTTT	3	55679	55690	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016225	ATTC	3	56030	56042	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016225	AAAG	3	57909	57921	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016225	CAAG	4	57963	57978	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016225	CTTT	3	59037	59047	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016225	TTCT	3	59305	59315	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016225	AGCG	3	59384	59394	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016225	CTTT	3	60880	60890	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016225	TGAA	3	62563	62573	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016225	TCTT	3	63317	63328	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016225	TGAA	3	64962	64972	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016225	CTTT	4	68181	68197	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
58	NC_016225	TCTT	3	68273	68284	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016225	TGAA	3	69116	69126	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016225	TTAG	3	69919	69929	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016225	TCTT	3	72659	72670	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016225	CTTT	3	72765	72775	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016225	CTTT	4	74899	74914	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016225	AAAG	3	75325	75335	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016225	TTTC	3	75987	75998	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016225	CGAG	3	78660	78672	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016225	TGAA	3	78694	78704	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016225	TTTC	3	79046	79056	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016225	TGAA	3	79254	79264	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016225	ATTA	3	79451	79462	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016225	ATTA	4	79512	79527	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016225	AAAG	4	79719	79733	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016225	ATTA	4	79968	79984	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_016225	AAAG	3	80071	80082	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016225	AAAG	3	80488	80499	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016225	AAAG	5	80525	80545	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016225	GAAA	3	80569	80579	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016225	TTCT	3	80835	80847	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016225	GATC	3	81530	81540	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016225	AAGA	4	81996	82010	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016225	TCTT	4	83012	83027	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016225	TCTT	3	83352	83362	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016225	TAGC	3	83514	83525	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016225	AAGG	3	83692	83702	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016225	GAAA	3	88095	88106	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016225	AAAG	3	91359	91369	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016225	TCTT	3	91838	91850	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016225	TGAA	3	92220	92230	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016225	AAAG	3	93418	93429	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016225	AACT	3	93734	93745	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016225	CTTT	3	95595	95605	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016225	AGAA	3	95822	95834	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016225	TGAA	3	96273	96283	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016225	GAAA	3	96664	96675	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016225	AAAG	3	96841	96852	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016225	CTTA	3	96942	96954	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016225	CTTA	3	97469	97479	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016225	GAAA	3	100691	100701	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016225	CTTC	3	101233	101244	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016225	TGAA	3	101931	101941	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016225	ATAA	3	102252	102263	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016225	GAAA	3	102629	102639	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016225	GGCT	3	103674	103684	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016225	ATTC	3	104685	104695	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016225	TTCT	3	104751	104761	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016225	AAAG	3	105355	105366	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016225	CAAA	3	106494	106504	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

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