ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 23

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016225	AATT	3	322	333	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016225	CT	8	394	410	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016225	ATTA	4	490	505	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016225	CGAGAA	4	878	901	24	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016225	ACTT	3	911	922	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016225	AT	6	1407	1418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016225	GAA	4	1421	1433	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016225	GA	6	1747	1757	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016225	GA	8	1902	1916	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016225	CG	8	2634	2649	16	0 %	0 %	50 %	50 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016225	GA	6	2828	2838	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016225	AAGAA	4	4343	4362	20	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_016225	TTTTA	3	5175	5188	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	35796721
14	NC_016225	TGAA	3	5354	5364	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016225	GA	7	5445	5457	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016225	AG	6	5579	5589	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016225	AGA	4	5822	5832	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016225	AGAGG	20	6184	6283	100	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016225	AG	6	6352	6362	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016225	CTTG	3	6958	6969	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016225	ATATTA	3	7123	7141	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_016225	ATATTA	3	7203	7221	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_016225	ATTA	4	7361	7376	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016225	AAAT	4	7377	7392	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016225	GGA	4	7683	7694	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016225	GA	8	8166	8180	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016225	GAGAGT	3	8188	8204	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_016225	CTT	4	8727	8739	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016225	ATTA	4	8847	8862	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016225	AAAG	4	9111	9126	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016225	GTAA	3	9185	9196	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016225	TCT	4	9602	9613	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016225	TA	6	10237	10248	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016225	AT	6	10466	10476	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016225	CTTT	3	10586	10596	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016225	TC	6	10696	10707	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016225	AAG	4	10928	10938	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016225	CAAG	3	10947	10958	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016225	AGA	4	11332	11344	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016225	AAAGCA	3	11367	11383	17	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
41	NC_016225	GAA	4	11605	11615	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016225	GAG	4	12236	12247	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016225	TGAA	3	13083	13093	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016225	TGAA	3	13242	13252	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016225	AGA	4	13692	13704	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016225	AG	6	13789	13799	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016225	CTTT	3	13949	13959	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016225	AAAG	3	14381	14392	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016225	AAGGAG	3	14413	14429	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_016225	GA	8	14475	14489	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016225	TGAA	3	14877	14887	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016225	TC	9	15584	15600	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
53	NC_016225	CTT	4	15949	15961	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016225	AT	6	15962	15973	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016225	AGG	4	16305	16316	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016225	GAAAA	3	16432	16445	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016225	GAA	4	17003	17013	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016225	AGAA	3	17033	17044	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016225	TGAA	3	17206	17216	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016225	AAAG	3	17369	17381	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016225	CT	6	17476	17486	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016225	CT	6	17491	17501	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016225	CTT	4	17624	17636	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016225	AATT	3	17967	17978	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016225	CTTT	7	18074	18101	28	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
66	NC_016225	TA	6	18176	18187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016225	AAAG	3	18220	18230	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016225	TGAA	3	18317	18327	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016225	GA	6	18437	18447	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016225	GAG	4	18532	18543	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016225	TGAA	3	18560	18570	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016225	CTT	4	19746	19756	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016225	CT	6	19932	19942	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016225	GAG	4	20470	20481	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016225	GA	8	20654	20668	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016225	GAG	4	20852	20862	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016225	TGAA	3	20986	20996	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016225	GGA	4	21244	21255	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016225	GA	6	23403	23413	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016225	GAGGA	3	23643	23658	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016225	GCA	4	24397	24407	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016225	AAAG	3	24932	24943	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016225	AGAAGG	3	25456	25472	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016225	TGAA	3	25568	25578	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016225	GGA	4	25698	25709	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016225	TGAA	3	25734	25744	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016225	GA	8	25868	25882	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016225	GAAAA	3	26272	26286	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016225	CT	6	26338	26348	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016225	CT	6	26353	26363	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016225	TC	11	26495	26514	20	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
92	NC_016225	TC	7	26528	26540	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016225	CAAA	3	27006	27018	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016225	AAGA	3	27202	27213	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016225	CT	6	27237	27247	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016225	TC	7	27780	27792	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016225	GAAAG	3	28298	28311	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016225	TC	8	28419	28433	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016225	AGAA	3	29104	29115	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016225	GA	6	29150	29161	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016225	GTAAA	3	29188	29201	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016225	TC	7	29777	29789	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016225	AT	6	30258	30268	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016225	AGAA	3	30293	30304	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016225	TCTT	3	30836	30847	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016225	ACAG	3	31022	31033	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016225	CT	7	31064	31076	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016225	CCT	4	31568	31578	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016225	CTT	4	32781	32793	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016225	TCT	4	32820	32830	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016225	ACA	4	33173	33183	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016225	AAG	6	34258	34276	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
113	NC_016225	AAAG	4	34847	34862	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016225	AG	6	34861	34872	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016225	GTA	5	36254	36267	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016225	AGA	4	37015	37027	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_016225	TCTT	3	37345	37355	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016225	GAC	4	38996	39006	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016225	GATA	3	39165	39176	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016225	TGC	4	39979	39990	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016225	GTCTT	3	41234	41247	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016225	CT	6	41557	41568	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016225	TAT	4	42453	42463	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016225	GC	6	42583	42593	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016225	AGA	4	42736	42746	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016225	AT	7	43422	43434	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016225	TA	6	43539	43550	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016225	CTT	4	43695	43706	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016225	TCT	4	44382	44393	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016225	GAA	4	44724	44734	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016225	GTA	4	45307	45318	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016225	TTC	4	46587	46597	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016225	TC	7	47229	47241	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016225	AAAG	3	48602	48612	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016225	AGA	5	49122	49136	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016225	TA	6	50329	50340	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016225	AGA	4	51293	51304	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016225	CGAG	3	52459	52470	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016225	TGAA	3	54096	54106	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016225	CTTT	3	54749	54760	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016225	TTTC	3	54762	54772	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016225	TA	6	54983	54994	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016225	CG	7	54995	55008	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
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149	NC_016225	CT	6	55660	55670	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016225	CTTT	3	55679	55690	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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156	NC_016225	CAAG	4	57963	57978	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
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161	NC_016225	AGCG	3	59384	59394	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
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273	NC_016225	TA	6	100877	100889	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
274	NC_016225	CTTC	3	101233	101244	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
275	NC_016225	TGAA	3	101931	101941	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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277	NC_016225	GGA	4	102026	102037	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
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279	NC_016225	ATAA	3	102252	102263	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016225	GAAA	3	102629	102639	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
281	NC_016225	AGA	4	103159	103170	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
282	NC_016225	AT	7	103245	103257	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
283	NC_016225	TA	6	103299	103310	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
284	NC_016225	CTT	4	103319	103329	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
285	NC_016225	GGCT	3	103674	103684	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
286	NC_016225	ATTC	3	104685	104695	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
287	NC_016225	TTCT	3	104751	104761	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
288	NC_016225	AAAG	3	105355	105366	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
289	NC_016225	AG	6	106076	106087	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
290	NC_016225	CAAA	3	106494	106504	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 23