ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016224	GAG	4	63	74	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016224	TCC	4	769	779	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016224	AGA	4	3551	3561	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016224	AGA	4	4882	4892	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016224	AGA	4	5164	5174	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016224	CTT	5	6197	6210	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016224	CTC	4	8013	8024	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016224	TCT	5	8461	8474	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016224	CTC	4	9167	9178	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016224	CTT	4	11879	11891	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016224	ACG	4	12128	12139	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016224	AAG	4	14086	14098	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016224	TTA	4	15332	15342	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016224	GAA	4	15712	15722	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016224	AAG	4	16172	16185	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016224	CTT	4	18424	18434	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016224	CAA	4	19382	19392	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016224	GTA	4	20355	20366	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016224	TTC	4	22874	22886	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016224	TAG	4	29197	29207	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016224	CTG	4	30665	30676	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016224	CAA	4	30689	30699	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016224	TCT	4	34271	34282	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016224	GAA	4	35874	35884	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016224	TAA	4	36191	36201	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016224	CTA	5	37250	37263	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016224	TCT	4	38315	38325	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016224	GAA	4	39917	39929	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016224	GAG	4	41895	41906	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016224	TTC	4	42922	42934	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016224	CTA	4	44999	45009	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016224	GTT	4	46701	46712	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016224	TCT	4	46716	46728	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016224	GAG	6	46815	46831	17	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016224	CTT	4	47064	47074	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016224	AGA	4	48184	48195	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016224	GTA	4	50583	50594	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016224	AGG	4	50655	50666	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016224	AGC	4	51731	51742	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016224	AGA	4	53269	53279	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016224	CCT	4	55328	55338	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016224	GAA	4	55380	55391	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016224	CTT	5	55927	55940	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016224	CTT	5	58302	58316	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 115