ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016224	GAG	4	63	74	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016224	TCC	4	769	779	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016224	AGAA	3	958	969	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016224	TC	6	1361	1372	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016224	TTTG	3	1874	1885	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016224	TGTCT	4	2866	2884	19	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
7	NC_016224	CT	6	3277	3287	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016224	TA	7	3529	3542	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016224	AGA	4	3551	3561	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016224	CT	6	4432	4442	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016224	TGCTT	3	4573	4587	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016224	AGA	4	4882	4892	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016224	AGA	4	5164	5174	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016224	TCCCTC	3	5443	5460	18	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
15	NC_016224	CTT	5	6197	6210	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016224	GAGGT	3	6710	6723	14	20 %	20 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016224	CTC	4	8013	8024	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016224	TCT	5	8461	8474	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016224	CTC	4	9167	9178	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016224	TTGG	3	9672	9682	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016224	AAGA	3	10212	10223	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016224	ACTT	3	11071	11081	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016224	CTT	4	11879	11891	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016224	AAAG	3	12059	12069	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016224	ACG	4	12128	12139	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016224	TCTTT	3	12581	12594	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016224	CTTT	4	13207	13222	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016224	AAG	4	14086	14098	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016224	TA	6	14245	14256	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016224	TTA	4	15332	15342	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016224	ACTT	3	15354	15365	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016224	GAA	4	15712	15722	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016224	AAG	4	16172	16185	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016224	TC	6	17206	17216	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016224	CAGG	3	17424	17435	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016224	CTTG	3	17851	17862	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016224	CTT	4	18424	18434	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016224	CAA	4	19382	19392	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016224	TA	6	19554	19565	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016224	GTA	4	20355	20366	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016224	CT	6	21799	21809	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016224	GA	7	22240	22252	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016224	AGAA	7	22378	22405	28	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
44	NC_016224	TTC	4	22874	22886	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016224	CT	7	23266	23278	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016224	TTAA	4	23537	23552	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016224	CTTTT	3	24155	24169	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016224	AT	8	24952	24966	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016224	CATA	4	26424	26438	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016224	CAAA	3	26663	26674	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016224	AG	6	27262	27272	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016224	GAAA	3	28510	28522	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016224	TA	9	28870	28887	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_016224	TAG	4	29197	29207	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016224	GAAA	3	29339	29350	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016224	CTG	4	30665	30676	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016224	CAA	4	30689	30699	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016224	AGAA	3	31836	31846	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016224	TA	8	32220	32234	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016224	TCTT	3	33786	33797	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016224	TA	6	34089	34099	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016224	TCT	4	34271	34282	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016224	TA	7	34870	34882	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016224	GAA	4	35874	35884	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016224	TAA	4	36191	36201	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016224	CTA	5	37250	37263	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016224	TA	6	37600	37610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016224	TCT	4	38315	38325	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016224	GAAA	3	38987	38997	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016224	GAA	4	39917	39929	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016224	TA	6	40847	40857	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016224	C	14	41427	41440	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016224	GAG	4	41895	41906	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016224	AAAT	3	41944	41955	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016224	CT	6	42567	42578	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016224	TTC	4	42922	42934	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016224	AGAA	3	43634	43644	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016224	GGCAAA	3	43933	43950	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016224	AGTCT	3	44764	44777	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016224	CTA	4	44999	45009	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016224	TCTT	3	45193	45204	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016224	GTT	4	46701	46712	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016224	TCT	4	46716	46728	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016224	GAG	6	46815	46831	17	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016224	GCTT	3	46845	46855	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016224	CTT	4	47064	47074	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016224	AG	7	47854	47866	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016224	AGA	4	48184	48195	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016224	TA	6	48670	48680	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016224	AGAA	3	48940	48951	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016224	AATT	3	49040	49051	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016224	TAAC	3	49337	49348	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016224	TCTT	3	50465	50476	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016224	GTA	4	50583	50594	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016224	AGG	4	50655	50666	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016224	AGC	4	51731	51742	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016224	TA	6	52408	52418	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016224	AGA	4	53269	53279	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016224	TA	9	54280	54296	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
100	NC_016224	TC	7	54741	54753	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016224	TC	7	55077	55091	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016224	CCT	4	55328	55338	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016224	GAA	4	55380	55391	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016224	CTT	5	55927	55940	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016224	AAGC	3	56136	56147	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016224	CTAT	3	56994	57005	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016224	GA	7	57884	57896	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016224	CTT	5	58302	58316	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016224	AG	6	58700	58710	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

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