ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 6

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016223	GAAA	3	2018	2028	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016223	CTTA	3	2600	2611	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016223	CTT	4	4230	4241	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016223	GA	6	4512	4522	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016223	CAGC	3	5274	5286	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016223	CT	6	5900	5910	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016223	TCT	4	6186	6196	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016223	AG	6	7134	7145	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016223	GAAA	3	7842	7853	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016223	TTC	4	8706	8717	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016223	AG	6	8750	8760	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016223	TGAA	3	9041	9051	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016223	ATTC	3	9967	9977	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016223	CTAG	3	10526	10537	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016223	TCT	4	11318	11328	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016223	AACTT	3	11346	11359	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016223	CTT	4	11552	11562	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016223	TACT	3	13470	13480	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016223	T	12	14410	14421	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016223	CTT	4	15858	15869	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016223	AAG	4	17229	17239	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016223	TC	6	18503	18513	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016223	ACTT	3	18617	18627	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016223	TA	6	18896	18907	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016223	GA	6	19246	19256	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016223	TTTC	3	19317	19327	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016223	TGC	4	20614	20624	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016223	TTC	4	21067	21079	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016223	TAGT	3	21617	21627	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016223	ATA	4	22160	22170	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016223	GAAA	3	23845	23855	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016223	TC	6	24004	24015	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016223	CT	6	24173	24183	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016223	CTT	4	25550	25562	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016223	TCTT	3	26138	26149	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016223	TTTG	3	26275	26286	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016223	TCT	4	27677	27688	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016223	CTTTT	3	29466	29479	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016223	AGTAG	4	30187	30206	20	40 %	20 %	40 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016223	TTTC	3	30930	30941	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016223	AAAG	3	31527	31538	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016223	TTC	4	31759	31770	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016223	CT	6	33122	33132	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016223	CA	7	33198	33210	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016223	TC	6	33648	33658	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016223	TC	7	35161	35173	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016223	TATCTC	3	35318	35334	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
48	NC_016223	AAAG	3	35896	35907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016223	ATTC	3	36197	36207	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016223	TCTT	3	37154	37165	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016223	A	14	38425	38438	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016223	TAGG	3	38527	38537	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016223	CCGC	3	38653	38664	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016223	AAGA	3	38990	39000	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016223	GGTT	3	39048	39058	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016223	CTT	4	39672	39683	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016223	AT	6	39737	39747	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016223	ACTTT	3	39956	39969	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016223	TCT	4	40168	40179	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016223	GAT	4	40189	40200	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016223	CTA	4	41869	41881	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016223	AGGA	3	42309	42320	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016223	TA	7	43235	43247	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016223	AACC	3	43314	43325	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016223	AAG	4	43558	43570	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016223	TCA	4	43686	43697	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016223	TA	6	43957	43967	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016223	TA	6	45412	45422	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016223	TA	7	45454	45466	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016223	CTA	4	46045	46055	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016223	AAAG	4	46172	46186	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016223	TAGG	3	47322	47332	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016223	AG	6	47703	47714	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016223	CT	6	48161	48171	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016223	AAGA	3	48215	48226	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016223	CTA	4	48229	48239	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016223	CTA	4	48289	48299	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016223	GGCT	3	49274	49284	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016223	TA	8	49987	50001	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016223	TA	6	50175	50185	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016223	ACTA	3	50381	50393	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016223	TC	6	50841	50852	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016223	ATCT	3	50863	50874	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016223	TA	7	52174	52187	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016223	CTT	4	52654	52666	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016223	CTG	4	52787	52799	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016223	AAGA	3	55192	55202	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016223	TA	6	55509	55520	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016223	TA	8	56253	56268	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016223	TA	6	59100	59112	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016223	CTT	5	60040	60053	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016223	GAA	4	60404	60415	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016223	AGCG	3	60574	60584	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016223	AGG	4	60753	60763	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016223	AG	6	60995	61006	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016223	TTAA	3	61750	61760	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016223	AGC	4	62882	62893	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016223	GAA	4	64162	64173	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016223	TAGC	3	66509	66519	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016223	CTA	4	66621	66632	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016223	TA	6	70142	70152	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016223	CTT	4	70879	70890	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016223	TAT	4	71304	71314	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016223	CGGG	3	72525	72535	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016223	TA	6	73289	73299	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016223	AAGT	3	73515	73526	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016223	ATG	4	74048	74058	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016223	TA	6	74218	74229	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016223	CTTG	3	74439	74449	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016223	TTC	4	74965	74976	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016223	AAGA	3	78555	78566	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016223	TA	6	80546	80558	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016223	ACCT	3	83196	83208	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016223	GAA	4	83330	83341	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016223	CGAAA	3	83943	83957	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
116	NC_016223	GTT	4	85022	85033	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016223	AAGA	3	85179	85190	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016223	CTTTC	3	87734	87749	16	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016223	CTTT	3	87818	87828	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016223	GAAA	3	87918	87928	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016223	TA	6	88275	88286	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016223	TTG	4	88696	88706	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016223	TTCT	3	89510	89521	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016223	GAAC	3	89577	89587	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016223	AAAG	3	90011	90023	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016223	CTT	4	90707	90718	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016223	AAAG	3	91790	91801	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016223	TAG	4	92409	92420	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016223	CTT	4	95561	95572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016223	ATC	4	96265	96277	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016223	ACTT	3	96933	96944	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016223	TA	6	99264	99274	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016223	AGTA	4	99274	99289	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_016223	GAAA	4	100999	101014	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
135	NC_016223	GTTGG	3	101836	101850	15	0 %	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016223	TC	6	102331	102342	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016223	AT	6	102854	102864	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016223	CTTA	3	103071	103082	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016223	TCCT	3	104844	104855	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016223	CTCTA	4	105517	105536	20	20 %	40 %	0 %	40 %	5 %	Non-Coding
141	NC_016223	TCT	4	105685	105696	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016223	AAG	5	105881	105895	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016223	AAG	4	106373	106384	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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145	NC_016223	CATT	3	106747	106757	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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150	NC_016223	AGGA	3	111864	111874	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_016223	CAA	4	112744	112754	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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155	NC_016223	TA	8	116698	116713	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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157	NC_016223	TTC	4	116936	116946	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
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160	NC_016223	AGGA	3	118092	118103	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
161	NC_016223	GA	6	118316	118326	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
162	NC_016223	GA	6	118784	118794	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
163	NC_016223	TCTT	3	118890	118902	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
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196	NC_016223	TTTC	3	130786	130797	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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216	NC_016223	CAAG	3	141779	141789	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
217	NC_016223	AG	6	141917	141927	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 6