ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 64

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016222	AGA	4	781	791	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016222	AAAAG	3	815	828	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016222	CTA	4	956	968	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016222	CAAT	3	1645	1655	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016222	TCTT	3	3116	3127	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016222	TTCC	3	3207	3218	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016222	TC	7	3236	3248	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016222	CT	7	3266	3280	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016222	TGAA	3	3865	3875	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016222	TCTTT	3	3886	3899	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016222	TCTT	3	3942	3953	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016222	TC	7	4231	4243	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016222	AAAG	3	4594	4605	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016222	CTT	4	6290	6301	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016222	AAGT	3	6441	6451	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016222	GAG	4	6747	6757	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016222	GAGGA	3	6811	6826	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016222	TA	6	7475	7485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016222	TTTC	4	8034	8048	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016222	CTT	4	8988	8998	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016222	CTTT	3	9333	9345	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016222	TGAA	3	10439	10449	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016222	TCTT	3	11108	11119	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016222	GAA	4	11602	11613	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016222	TAGAAA	3	12059	12077	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_016222	AGC	4	12205	12216	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016222	GAG	4	12457	12468	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016222	AAGGAG	3	12956	12972	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016222	GGA	4	13017	13028	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016222	AT	6	13862	13872	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016222	AGGG	3	13950	13960	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016222	AGGAG	3	14831	14845	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016222	TTC	4	15433	15443	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016222	CCTTCT	3	15941	15957	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
35	NC_016222	TC	7	15984	15996	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016222	CCCTT	3	16632	16645	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016222	ATTCT	3	17301	17314	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016222	GA	6	18443	18453	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016222	TC	6	18559	18569	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016222	TA	6	18603	18613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016222	TTC	4	19591	19602	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016222	TA	6	19869	19879	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016222	GGCT	3	20156	20166	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016222	TCA	4	21239	21249	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016222	CT	6	21477	21487	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016222	AT	7	24537	24550	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016222	AGA	4	24606	24618	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016222	CT	6	25191	25201	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016222	AT	6	26409	26420	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016222	CCT	4	26474	26484	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016222	TCTCCT	3	26727	26743	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
52	NC_016222	CG	6	27477	27488	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016222	TC	6	27891	27901	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016222	TC	6	28398	28408	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016222	CCT	4	28629	28639	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016222	CG	6	29646	29657	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016222	GAG	4	30407	30418	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016222	GAA	4	30497	30509	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016222	AGGAA	3	31616	31630	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016222	CATC	3	31681	31691	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016222	CTT	4	31796	31806	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016222	ACTG	3	31899	31909	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016222	GCTA	3	32899	32909	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016222	TTC	4	33796	33807	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016222	CT	7	33960	33972	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016222	CT	6	33998	34008	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016222	AAAAAG	3	34154	34172	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_016222	TC	7	34795	34807	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016222	TATCTC	3	34952	34968	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
70	NC_016222	AAAG	3	35530	35541	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016222	ATTC	3	35831	35841	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016222	TCTT	3	36788	36799	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016222	CTT	4	38565	38575	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016222	AGA	4	38802	38812	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016222	AG	6	38858	38868	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016222	CTT	4	38934	38944	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016222	GCT	4	39146	39157	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016222	GA	6	39368	39378	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016222	TTCA	3	39768	39779	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016222	ACTGG	3	39790	39803	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016222	AAGG	3	40700	40710	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016222	CT	7	40946	40959	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016222	CTTT	3	41355	41366	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016222	TA	6	41738	41748	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016222	TTAT	3	42290	42301	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016222	TA	8	42812	42827	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016222	CTT	4	43182	43193	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016222	AC	6	43361	43372	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016222	AGT	4	43984	43995	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016222	CTA	4	44115	44126	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016222	CTA	4	45496	45507	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016222	TA	6	45779	45789	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016222	ACTT	4	46131	46146	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016222	TC	6	46166	46176	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016222	ATAC	3	46602	46613	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016222	CTTG	3	47143	47153	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016222	TCTCCT	3	47573	47589	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016222	TC	7	48022	48034	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016222	TAG	5	48613	48626	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016222	CTA	4	49326	49337	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016222	GAA	4	49538	49548	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016222	TG	7	51217	51229	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016222	TA	7	51477	51489	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016222	AAGAC	3	51929	51943	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016222	AATTG	3	52077	52090	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016222	CAG	4	53012	53022	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016222	CTA	4	53191	53202	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016222	TCT	6	53337	53354	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
109	NC_016222	CTTT	3	53969	53979	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016222	TTTG	3	54056	54066	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016222	AAG	4	54451	54461	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016222	GCAA	4	55141	55155	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016222	TA	7	55254	55266	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016222	TGAA	3	56992	57002	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016222	CTTA	3	57728	57738	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016222	TCTT	3	58398	58409	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016222	GAA	4	58915	58925	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016222	ATAG	3	59096	59106	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016222	CTTT	3	59123	59134	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016222	AT	6	59602	59613	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016222	TGC	4	59639	59650	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016222	CTTTT	3	60203	60217	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016222	TGAAGG	3	60299	60317	19	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
124	NC_016222	TAG	4	60824	60835	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016222	TA	9	61721	61737	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_016222	AGTG	3	62001	62013	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016222	TA	6	62196	62206	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016222	AG	6	62559	62569	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016222	AT	6	63316	63326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016222	AAGA	3	63900	63911	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016222	GATTAA	3	65737	65755	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
132	NC_016222	TA	6	66228	66238	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016222	AC	6	67813	67824	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016222	CTT	4	68977	68987	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016222	TA	6	69293	69303	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016222	TCT	4	70656	70666	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016222	TTA	4	71601	71611	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016222	AG	6	71862	71873	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016222	CA	6	73636	73646	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016222	TGC	4	75013	75023	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016222	TGT	4	75207	75217	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016222	TTTG	3	75670	75680	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016222	GTCT	3	75799	75809	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016222	GTA	4	75810	75820	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016222	TTCT	3	76550	76562	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
146	NC_016222	CTGT	3	76989	76999	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016222	GGTT	3	77285	77295	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016222	TA	6	77507	77517	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016222	GAAA	3	77698	77708	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016222	ATG	4	78007	78018	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016222	GTTA	3	78175	78185	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016222	CTT	4	78416	78427	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
153	NC_016222	GA	6	79637	79647	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_016222	TGG	4	80397	80411	15	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
155	NC_016222	ACTT	3	80904	80915	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
156	NC_016222	AT	6	81364	81374	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016222	TTTG	3	81541	81553	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
158	NC_016222	TCT	4	81618	81628	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 64