ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 3

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016221AAAG37547641175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
2NC_016221CAAG4235323681650 %0 %25 %25 %6 %Non-Coding
3NC_016221TCTT336613672120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
4NC_016221ATCG3704670571225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
5NC_016221CTTT385838593110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
6NC_016221TTGT31164611657120 %75 %25 %0 %0 %Non-Coding
7NC_016221AAGA312525125351175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016221ACCT313641136521225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
9NC_016221AAAG315866158771275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
10NC_016221AAGA317000170101175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
11NC_016221CTTT31806218073120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_016221TTTC32006120072120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
13NC_016221TTCT32132621337120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
14NC_016221AATT322934229451250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_016221CTTT42299123007170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
16NC_016221GAAA323425234351175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
17NC_016221GAAA324735247471375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
18NC_016221TTTC32495024961120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
19NC_016221CTTT42628026295160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
20NC_016221CAAG327295273061250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
21NC_016221CTTT42940629420150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
22NC_016221GTCT32986229872110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
23NC_016221ACGA332191322021250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
24NC_016221CTTT33252432534110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
25NC_016221CTTT33369533707130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
26NC_016221TTCT33462734637110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
27NC_016221CTGT33516935179110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
28NC_016221TCCT33643436445120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
29NC_016221TCTT33860038610110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
30NC_016221AAGT339000390111250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
31NC_016221CCTC34061040621120 %25 %0 %75 %0 %Non-Coding
32NC_016221CTTT34088740899130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
33NC_016221TAAG343095431051150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
34NC_016221TCTT44347643492170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
35NC_016221ACTC343901439131325 %25 %0 %50 %7 %Non-Coding
36NC_016221CTTT34488744897110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
37NC_016221GCAA346340463511250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
38NC_016221CTTT34912849139120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
39NC_016221CACT349457494691325 %25 %0 %50 %7 %Non-Coding
40NC_016221AGAA350037500481275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
41NC_016221AGAC354517545271150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
42NC_016221ATTG356462564721125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
43NC_016221CCTC35735057361120 %25 %0 %75 %8 %Non-Coding
44NC_016221TCTT45800758023170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
45NC_016221CTTT35966559675110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
46NC_016221AAGA360978609891275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
47NC_016221AAGA361214612251275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
48NC_016221GAAA363275632871375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
49NC_016221CTTT36336863380130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
50NC_016221GCTT36461064621120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
51NC_016221TGCT36469464705120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
52NC_016221AAAG366038660491275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
53NC_016221GAAA368922689331275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
54NC_016221AAAG371122711331275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
55NC_016221GGAA373582735941350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
56NC_016221AAAG375299753101275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
57NC_016221GAAA376837768481275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
58NC_016221GCTT37692776938120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
59NC_016221GAAA377055770661275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
60NC_016221AGAA379535795451175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
61NC_016221GAAA479561795761675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
62NC_016221AGAA380026800371275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
63NC_016221AAGA380615806261275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
64NC_016221CTTT38380183812120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
65NC_016221TTAG385470854801125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
66NC_016221ACTT386091861021225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
67NC_016221AGGT387528875391225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
68NC_016221CCTT39122191232120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
69NC_016221TTAG396781967911125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
70NC_016221TCTT49770297717160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
71NC_016221TCCT39863698648130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
72NC_016221TTCT39940199412120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
73NC_016221TTTG39944399455130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
74NC_016221TGCT3100179100189110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
75NC_016221CTTT4101552101567160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
76NC_016221CTTT4102649102664160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
77NC_016221GGTA31027961028071225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
78NC_016221AAAG51036011036212175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
79NC_016221AAGA31056141056241175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
80NC_016221AAAG31068301068411275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
81NC_016221GAGG31070881070991225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
82NC_016221CTTT4109991110007170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
83NC_016221AAGT31115191115291150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
84NC_016221GAAA31150851150951175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
85NC_016221CTTT3115393115403110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
86NC_016221CTTT3115440115450110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
87NC_016221TTTC3116643116654120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
88NC_016221TTTC3116942116954130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
89NC_016221AAAG31171651171751175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
90NC_016221TTTG3117941117951110 %75 %25 %0 %9 %35796720
91NC_016221TAGC31183771183871125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
92NC_016221CGAG31192871192991325 %0 %50 %25 %7 %Non-Coding
93NC_016221ATGT31196201196301125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
94NC_016221TCGT4122832122847160 %50 %25 %25 %6 %Non-Coding
95NC_016221TTCC3123692123703120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
96NC_016221CCTC3124020124032130 %25 %0 %75 %7 %Non-Coding
97NC_016221TGAA31273211273311150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
98NC_016221GAAA31284701284801175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
99NC_016221TCTT4128832128846150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
100NC_016221TTCT3130332130342110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
101NC_016221CCTT3130383130394120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
102NC_016221TGAA31339911340011150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
103NC_016221TGAA31340861340961150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
104NC_016221TTTC3136199136210120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
105NC_016221CTTT3138505138516120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
106NC_016221TGTT3139905139916120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
107NC_016221TAAG31408451408561250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
108NC_016221GTCT4143670143684150 %50 %25 %25 %6 %Non-Coding
109NC_016221TTTC3143697143707110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
110NC_016221AAAG31475801475911275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
111NC_016221TCCT3149041149052120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding