ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 3

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016221	GA	7	3363	3375	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016221	CT	7	4211	4223	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016221	CT	6	5120	5130	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016221	TC	6	5959	5971	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016221	TA	6	9115	9126	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016221	AT	6	9202	9213	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016221	CT	6	10343	10353	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016221	TC	6	10373	10383	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016221	TC	6	15996	16006	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016221	TC	6	17182	17192	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016221	AG	8	18295	18309	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016221	AG	6	19035	19046	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016221	TA	6	22176	22187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016221	AG	6	23469	23480	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016221	CG	6	24026	24037	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016221	TC	6	24145	24155	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016221	TA	7	24966	24979	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016221	TA	6	25183	25194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016221	CG	7	26332	26345	14	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016221	CT	6	26461	26471	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016221	TC	8	26726	26740	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016221	CG	6	28478	28489	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016221	GA	7	30364	30376	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016221	GA	6	30785	30795	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016221	CT	6	31055	31065	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016221	CT	6	31687	31697	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016221	TG	6	31979	31989	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016221	TC	7	32730	32742	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016221	TC	6	34615	34625	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016221	AT	7	35073	35088	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016221	CG	6	35212	35223	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016221	TA	6	35224	35234	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016221	TC	6	36804	36814	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016221	AT	6	38401	38412	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016221	TA	6	42310	42321	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016221	TC	6	42422	42432	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016221	TC	6	42483	42493	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016221	TC	6	45734	45745	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016221	TA	7	45784	45796	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016221	AG	6	47105	47115	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016221	TA	6	47581	47592	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016221	AT	6	47783	47793	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016221	TA	6	50354	50365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016221	AT	7	52321	52333	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016221	TA	6	53332	53343	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016221	CG	6	57595	57606	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016221	TA	6	57611	57621	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016221	GA	6	58888	58898	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016221	TA	6	64431	64442	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016221	CT	6	64930	64941	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016221	AG	6	65283	65293	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016221	CT	6	65428	65438	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016221	CT	6	67062	67072	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016221	TC	6	70393	70403	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016221	AG	6	72055	72066	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016221	GA	8	73134	73148	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016221	AT	6	74973	74983	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016221	TC	6	76184	76194	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016221	TC	6	79790	79800	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016221	TC	7	80556	80568	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016221	TC	7	83147	83159	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016221	CA	6	84121	84132	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016221	TC	6	85154	85164	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016221	GA	6	85745	85755	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016221	TC	7	86642	86654	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016221	AT	7	87331	87343	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016221	AT	7	87804	87816	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016221	CT	7	94410	94423	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016221	TA	6	94453	94464	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016221	TC	6	98370	98380	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016221	TA	6	99488	99499	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016221	TC	6	99889	99899	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016221	AG	6	102420	102430	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016221	GA	6	102592	102602	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016221	GA	7	106315	106327	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016221	AG	6	109889	109899	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016221	AG	8	111739	111753	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016221	CT	7	112849	112861	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016221	AG	7	118611	118623	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016221	AG	6	119480	119490	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016221	TC	6	123306	123316	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016221	TC	6	123374	123384	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016221	AT	6	126160	126171	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016221	TC	6	126411	126422	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016221	AG	6	126870	126880	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016221	CT	6	128976	128987	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016221	AT	6	129280	129291	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016221	AG	6	129382	129392	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016221	AT	6	130469	130480	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016221	CT	6	131622	131633	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016221	AT	6	131701	131711	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016221	CT	6	132519	132529	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016221	GA	7	133614	133626	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016221	CG	6	134461	134472	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016221	CG	6	137408	137419	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016221	AG	7	138391	138403	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016221	GA	7	139183	139195	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016221	GA	7	143053	143065	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016221	TC	6	144789	144799	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016221	TC	7	145656	145668	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016221	CT	6	145867	145877	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016221	TC	6	148521	148531	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016221	TC	6	148545	148555	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016221	CG	6	148880	148891	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding

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