ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 4

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016220	TGC	4	597	608	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016220	CTC	4	633	644	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016220	TTTG	3	1571	1581	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016220	CG	6	3062	3073	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016220	AGA	5	4352	4365	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016220	CCTT	3	4795	4806	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016220	TA	6	6618	6629	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016220	AGC	4	6927	6938	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016220	TTGC	3	7579	7589	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016220	TTA	5	7623	7636	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016220	ATAG	3	7939	7949	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016220	CTTTT	3	7962	7977	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016220	TCAT	3	8326	8336	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016220	CTT	4	9156	9166	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016220	CTT	5	10070	10083	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016220	CTTT	3	10145	10157	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016220	AAGG	3	12960	12971	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016220	GAGG	3	13522	13533	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016220	TA	7	13936	13949	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016220	AAAG	3	13975	13987	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016220	TCT	4	16555	16565	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016220	TA	7	18018	18030	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016220	TA	8	18560	18574	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016220	ATC	4	19195	19205	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016220	AT	7	21218	21231	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016220	AG	6	21251	21261	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016220	TTGTT	3	23094	23108	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016220	TCT	4	23634	23645	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016220	GAA	4	24610	24621	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016220	TCCC	3	25063	25073	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016220	AGC	4	25200	25211	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016220	TA	6	25305	25316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016220	AGA	4	25615	25626	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016220	AAG	4	26316	26327	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016220	CCTT	3	28747	28758	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016220	AAG	4	28897	28908	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016220	TC	6	29932	29942	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016220	CTGT	3	30000	30010	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016220	TA	7	30126	30138	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016220	TA	6	31442	31452	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016220	TA	6	31935	31946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016220	GA	6	32058	32068	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016220	CTTT	3	32602	32613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016220	TCT	4	32621	32631	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016220	CT	7	32751	32763	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016220	AAGAA	4	32841	32859	19	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
47	NC_016220	AGG	4	33780	33792	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016220	TCT	4	34627	34639	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016220	CT	6	35161	35171	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016220	AGGA	3	35584	35594	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016220	GAAA	3	35684	35694	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016220	AGAC	3	38468	38478	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016220	TAAA	3	38600	38612	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016220	CTTTG	3	38929	38943	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016220	CGC	4	40843	40854	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016220	GA	6	41933	41943	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016220	AAAG	4	43666	43681	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	35796720
58	NC_016220	AAGG	3	44334	44345	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016220	AAGA	3	44423	44434	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016220	GA	6	45308	45318	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016220	TA	6	45582	45593	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016220	ATCCT	3	45622	45636	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016220	AGA	4	45833	45845	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016220	CTA	4	46742	46752	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016220	TC	6	47130	47141	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016220	TAAG	3	48130	48140	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016220	TAC	4	48216	48226	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016220	TA	6	48951	48962	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016220	AAAG	3	49039	49051	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016220	CCAA	3	49539	49549	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016220	AACC	3	50472	50483	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016220	TA	6	50968	50978	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016220	CTTGG	3	51043	51056	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016220	TTAC	3	51812	51823	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016220	TTTC	3	52070	52082	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016220	CTTA	3	52223	52235	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016220	TTA	4	52634	52644	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016220	TTTA	3	53539	53550	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016220	TA	13	53691	53716	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016220	CTT	4	53769	53780	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016220	GGAA	3	54461	54471	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016220	AAG	4	55007	55019	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016220	CAG	4	55152	55163	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016220	GCGCC	3	55814	55828	15	0 %	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016220	CT	6	56390	56401	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016220	G	13	56529	56541	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016220	AGA	4	57324	57334	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016220	CTAGC	3	58435	58448	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016220	TAA	4	59780	59790	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016220	AGA	4	59791	59801	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016220	TAGAA	3	59884	59897	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016220	CTT	4	60783	60793	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016220	ACTAA	3	61240	61254	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016220	CTTT	3	61293	61303	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016220	CAT	4	61683	61693	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016220	GAA	5	61782	61796	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016220	CTGC	3	63196	63206	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016220	ATCT	4	63722	63737	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016220	GTTT	3	64073	64084	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016220	TGTC	3	65898	65908	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016220	CT	7	66036	66048	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016220	TCAGA	3	66651	66664	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016220	TAG	4	66679	66690	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016220	TC	7	67561	67573	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016220	ATCT	3	67729	67741	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016220	TAC	4	68974	68984	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016220	AAAG	3	69202	69213	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016220	ATA	4	69260	69271	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016220	AGTC	3	69863	69873	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016220	AAAG	3	69972	69983	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016220	TTTG	3	70732	70744	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016220	TCTTA	3	71418	71431	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016220	AGTT	3	71557	71567	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016220	GA	7	72577	72589	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016220	CAG	4	73619	73630	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016220	TACT	3	73906	73916	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016220	TTAC	3	75191	75202	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016220	AGTA	3	75791	75802	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016220	TTAC	3	76223	76233	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016220	TAAA	3	77579	77590	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016220	TA	7	77669	77681	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016220	ATGA	3	80986	80997	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016220	GA	8	82239	82253	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_016220	AAAG	3	83913	83925	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016220	CT	7	84499	84511	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016220	TCT	4	84631	84641	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016220	AGT	4	85236	85248	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016220	TGGTT	3	86008	86021	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016220	TCT	4	86315	86326	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016220	TCT	4	89109	89119	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016220	TA	7	89379	89391	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016220	AGGA	3	89828	89840	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016220	TA	6	89915	89926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016220	TAC	4	90171	90182	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016220	TTAA	3	90194	90205	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016220	GAA	4	90364	90374	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016220	AGAGG	3	91001	91015	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016220	CTTA	3	91138	91149	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016220	TCTA	4	91967	91982	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
140	NC_016220	AAGAA	3	92470	92483	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016220	TC	6	92579	92590	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016220	TA	6	93341	93352	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016220	CTCTT	3	93538	93552	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
144	NC_016220	AAGA	3	93913	93923	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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152	NC_016220	TA	6	97794	97806	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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162	NC_016220	AAG	4	104276	104287	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
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164	NC_016220	TCT	4	104943	104954	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
165	NC_016220	AAGA	3	106994	107005	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_016220	CT	6	107621	107631	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
167	NC_016220	CT	7	108632	108646	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
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173	NC_016220	TTCA	3	112239	112249	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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175	NC_016220	TCT	4	112538	112549	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
176	NC_016220	TC	6	112673	112683	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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191	NC_016220	TTTC	4	119604	119619	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
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203	NC_016220	TTCT	4	124245	124260	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
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220	NC_016220	CTCG	3	137432	137443	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
221	NC_016220	TA	8	137945	137959	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
222	NC_016220	A	12	138922	138933	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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224	NC_016220	CTGT	4	139905	139920	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
225	NC_016220	CTT	4	140050	140060	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
226	NC_016220	TTGCT	3	140385	140398	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
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229	NC_016220	TA	6	141918	141929	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
230	NC_016220	TTAA	3	142753	142764	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_016220	AG	6	143036	143047	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
232	NC_016220	TACC	3	143450	143461	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
233	NC_016220	GTA	4	143747	143758	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
234	NC_016220	AAGA	3	144330	144342	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
235	NC_016220	GGC	4	144790	144801	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
236	NC_016220	TCT	4	145480	145490	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
237	NC_016220	CT	6	145601	145611	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
238	NC_016220	CTTTT	3	145692	145706	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
239	NC_016220	AT	7	145775	145788	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
240	NC_016220	TAG	4	146287	146298	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
241	NC_016220	CTT	4	146842	146853	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
242	NC_016220	AAGG	3	147505	147516	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
243	NC_016220	ACTT	3	147828	147839	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
244	NC_016220	AAAGAA	3	148971	148989	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 4