ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 4

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016220	CG	6	3062	3073	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016220	TA	6	6618	6629	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016220	TA	7	13936	13949	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016220	TA	7	18018	18030	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016220	TA	8	18560	18574	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016220	AT	7	21218	21231	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016220	AG	6	21251	21261	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016220	TA	6	25305	25316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016220	TC	6	29932	29942	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016220	TA	7	30126	30138	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016220	TA	6	31442	31452	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016220	TA	6	31935	31946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016220	GA	6	32058	32068	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016220	CT	7	32751	32763	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016220	CT	6	35161	35171	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016220	GA	6	41933	41943	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016220	GA	6	45308	45318	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016220	TA	6	45582	45593	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016220	TC	6	47130	47141	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016220	TA	6	48951	48962	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016220	TA	6	50968	50978	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016220	TA	13	53691	53716	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016220	CT	6	56390	56401	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016220	CT	7	66036	66048	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016220	TC	7	67561	67573	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016220	GA	7	72577	72589	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016220	TA	7	77669	77681	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016220	GA	8	82239	82253	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016220	CT	7	84499	84511	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016220	TA	7	89379	89391	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016220	TA	6	89915	89926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016220	TC	6	92579	92590	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016220	TA	6	93341	93352	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016220	AG	7	94044	94057	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016220	TG	6	95076	95087	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016220	TA	6	95560	95572	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016220	TA	6	96560	96571	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016220	TA	6	97794	97806	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016220	TC	6	103962	103972	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016220	CT	6	107621	107631	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016220	CT	7	108632	108646	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016220	TC	7	111890	111902	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016220	TC	6	112419	112429	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016220	TC	6	112673	112683	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016220	AT	6	114440	114450	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016220	AG	7	116158	116170	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016220	AG	6	117023	117033	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016220	TC	6	117370	117380	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016220	GA	7	118244	118256	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016220	GA	6	118594	118604	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016220	CG	6	119361	119372	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016220	GA	6	119751	119761	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016220	GA	6	120015	120025	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016220	GA	6	120483	120493	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016220	AG	6	121382	121393	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016220	GA	6	122139	122149	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016220	GA	6	123700	123711	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016220	AT	6	125487	125498	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016220	TA	6	132923	132934	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016220	CT	6	134676	134686	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016220	TA	6	135723	135733	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016220	AG	6	136106	136116	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016220	TA	8	137945	137959	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016220	TA	6	141918	141929	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016220	AG	6	143036	143047	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016220	CT	6	145601	145611	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016220	AT	7	145775	145788	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 4