ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 27

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016219	ATGA	3	359	370	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016219	TA	8	1502	1516	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016219	AAGG	3	2458	2468	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016219	CAG	4	2653	2664	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016219	AGCT	3	3381	3392	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016219	CTT	4	3450	3461	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016219	ATAAT	3	3976	3989	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016219	TA	7	4096	4110	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016219	TA	6	6314	6324	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016219	TTTC	4	6360	6375	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016219	GTA	4	7216	7226	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016219	GT	8	7504	7519	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_016219	AGTC	3	8550	8561	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016219	ATC	4	8875	8886	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016219	AT	6	8887	8898	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016219	AG	7	9920	9932	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016219	TA	6	10350	10361	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016219	GA	7	10737	10749	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016219	CTT	4	12052	12063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016219	TA	11	13350	13370	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016219	GAAAA	3	13399	13413	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016219	TCT	4	14551	14562	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016219	CTT	4	14948	14959	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016219	CTT	4	16051	16061	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016219	CAT	4	16081	16092	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016219	TTTTC	3	16927	16941	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016219	CTT	4	16994	17004	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016219	GA	6	17248	17258	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016219	CTT	4	17480	17490	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016219	AT	6	18082	18093	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016219	GAGAA	3	18284	18298	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016219	CAAGG	3	18792	18805	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016219	AAAG	3	19638	19650	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016219	GAGAG	4	19920	19938	19	40 %	0 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_016219	AT	6	21681	21692	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016219	TCTT	3	22034	22045	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016219	CT	6	23108	23118	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016219	TTCC	4	24228	24243	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016219	TTTG	3	24514	24526	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016219	TTCT	3	25004	25015	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016219	GAGAG	3	25030	25045	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016219	TCTT	3	25134	25145	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016219	TGAA	3	25481	25491	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016219	GGTA	3	26085	26096	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016219	TA	6	26219	26230	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016219	CCTT	3	26384	26395	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016219	AG	6	26666	26676	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016219	GA	6	26727	26737	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016219	AG	6	27803	27814	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016219	CTTT	4	28896	28911	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016219	AGAA	3	29011	29022	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016219	GCATTT	3	30040	30056	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
53	NC_016219	CTT	4	30876	30888	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016219	AGGGA	3	31748	31762	15	40 %	0 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016219	TC	7	31801	31813	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016219	TAAG	4	34906	34920	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016219	GGA	4	36545	36556	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016219	CTT	4	37867	37879	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016219	AT	6	37880	37891	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016219	TC	6	38218	38228	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016219	CAG	4	38456	38467	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016219	ACTT	3	38638	38649	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016219	GGC	4	38921	38932	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016219	AGA	4	39793	39804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016219	AAG	4	40314	40325	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016219	CT	6	40350	40360	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016219	AAT	4	41268	41279	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016219	AAG	4	41277	41288	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016219	CTT	4	41890	41901	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016219	CTTT	3	42288	42298	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016219	TTCTT	4	42535	42553	19	0 %	80 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
72	NC_016219	CTT	4	43668	43678	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016219	AT	6	43983	43993	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016219	CAAG	3	44300	44312	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016219	CT	6	45121	45132	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016219	CTT	4	45406	45416	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016219	TA	8	45531	45545	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016219	ACA	4	46725	46736	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016219	ATAG	3	46905	46915	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016219	CTTTTT	3	46929	46946	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
81	NC_016219	TA	6	48218	48229	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016219	GAG	4	48757	48767	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016219	CAAA	3	50225	50235	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016219	GGA	4	50449	50460	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016219	CA	6	50904	50915	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016219	CAAA	3	51494	51504	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016219	TA	6	51836	51847	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016219	AAGGAG	3	52636	52652	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_016219	AGA	4	53107	53118	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016219	GA	6	53857	53867	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016219	CCTT	3	54475	54485	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016219	TCT	5	56147	56160	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016219	ACGC	3	56637	56648	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016219	TGAA	3	57312	57322	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016219	TCT	5	57733	57747	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016219	GAA	4	57758	57768	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016219	CTT	4	58505	58515	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016219	GA	7	58596	58608	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016219	AAAG	3	59689	59700	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016219	AT	6	60131	60142	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016219	GA	7	60634	60646	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016219	AT	6	61123	61134	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016219	AAGA	3	61361	61373	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016219	ACTTGG	3	61413	61429	17	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
105	NC_016219	AGA	4	61552	61562	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016219	AT	7	61912	61925	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016219	CTT	4	62618	62630	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016219	TAT	4	63323	63333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016219	TC	6	63788	63798	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016219	TCT	4	64207	64218	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016219	GCT	4	64582	64593	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016219	CTT	7	64624	64643	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
113	NC_016219	TTCT	3	64782	64793	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016219	CTT	4	65170	65181	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016219	TTG	4	65252	65263	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016219	CTT	4	65491	65502	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016219	CT	6	65712	65723	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016219	CT	7	65751	65764	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016219	TAAG	3	65777	65788	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016219	GAA	4	65959	65969	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016219	CTTT	3	66258	66269	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016219	GCAA	3	66419	66430	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016219	TCT	4	67933	67944	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016219	GA	6	68041	68051	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016219	TCTT	3	69154	69165	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016219	AAC	4	69422	69432	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016219	TC	6	69647	69657	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016219	CTT	4	69861	69871	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016219	AGA	4	70351	70361	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016219	TAG	4	70582	70592	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016219	AAG	4	70630	70640	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016219	AAG	4	70666	70676	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016219	TC	7	71262	71275	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
134	NC_016219	AGTGAG	3	71530	71546	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
135	NC_016219	TTCT	3	72430	72441	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016219	TTCT	3	73588	73599	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016219	GGTA	3	73723	73734	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016219	TTTGC	3	73979	73992	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016219	CT	6	74162	74172	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016219	CTT	4	74605	74616	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016219	TGT	4	75978	75989	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016219	TCTT	3	76991	77001	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016219	AAAG	3	78467	78478	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016219	ATA	4	80007	80017	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_016219	ATTC	3	81461	81471	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016219	AGAA	3	82057	82068	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_016219	TACTTA	4	82545	82568	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	4 %	Non-Coding
148	NC_016219	AAGAA	3	83566	83579	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
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155	NC_016219	TC	6	88895	88905	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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158	NC_016219	CCCG	3	89805	89815	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
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168	NC_016219	TCTA	3	99123	99134	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016219	TAG	5	100179	100193	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
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175	NC_016219	TTTC	3	104307	104319	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
176	NC_016219	AT	7	104759	104774	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
177	NC_016219	TTC	4	105052	105063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
178	NC_016219	TA	6	105204	105214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 27