ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 9

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016218	GTCT	3	991	1001	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016218	TA	7	1111	1123	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016218	CTT	4	1648	1659	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016218	TTAAT	3	2669	2682	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016218	CTT	4	2960	2971	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016218	CAG	4	3548	3559	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016218	TA	7	3641	3656	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016218	CTT	4	5076	5086	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016218	TA	6	5256	5267	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016218	TCTT	3	5429	5439	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016218	TTGG	3	6644	6654	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016218	TA	6	8915	8927	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016218	TGGC	3	10385	10396	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016218	AT	6	12026	12037	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016218	AGGAG	3	12427	12441	15	40 %	0 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016218	TGAA	3	12465	12475	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016218	AAGG	3	12799	12809	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016218	AGA	4	13140	13152	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016218	TA	7	13559	13571	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016218	AT	6	14875	14885	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016218	AAGGA	3	15131	15144	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016218	GA	7	15345	15358	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016218	GTA	4	16460	16472	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016218	CAA	4	16837	16848	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016218	AAGA	3	17750	17762	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016218	TAAT	3	17904	17914	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016218	AGAA	3	17932	17942	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016218	AAAGA	3	18620	18634	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016218	TTCC	3	18847	18858	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016218	GTAAT	3	19629	19643	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016218	TC	6	19653	19663	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016218	TA	6	20291	20302	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016218	CTT	4	20821	20832	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016218	TCTT	3	20956	20968	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016218	CTA	4	22068	22078	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016218	CTA	5	22162	22176	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016218	CCTT	3	23253	23263	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016218	CTTT	3	23389	23399	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016218	TGAT	4	23521	23535	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016218	ACT	4	24078	24089	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016218	CAAG	3	24299	24310	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016218	AAGG	3	24812	24824	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016218	AAAG	3	24878	24888	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016218	CTTT	3	25243	25253	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016218	AGCA	3	25993	26004	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016218	CTCTT	3	26546	26560	15	0 %	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016218	GAA	4	26892	26902	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016218	CTTT	3	30173	30183	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016218	GAA	4	32663	32673	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016218	TTA	4	32831	32841	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016218	TTC	4	33288	33299	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016218	TA	9	34515	34535	21	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
53	NC_016218	AT	6	35533	35543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016218	TA	6	35979	35989	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016218	CTT	4	36213	36224	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016218	ACCAT	3	36612	36626	15	40 %	20 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016218	GAG	4	37669	37681	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016218	AAAAG	3	37806	37820	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016218	GA	6	38136	38146	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016218	ATA	4	38165	38176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016218	CTTT	3	38979	38989	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016218	GAA	4	39775	39785	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016218	AT	9	40709	40725	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016218	CTTT	3	40816	40826	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016218	AGAAA	4	42139	42158	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
66	NC_016218	GTTC	3	42199	42209	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016218	CT	6	42502	42512	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016218	CATT	3	42744	42754	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016218	CTC	4	43690	43700	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016218	AAAAAG	3	45233	45250	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_016218	TGT	4	45443	45454	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016218	AT	6	46636	46649	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016218	AT	6	48186	48196	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016218	AAG	4	48501	48511	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016218	CTCC	3	49086	49097	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016218	AT	6	49209	49220	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016218	AAGAA	4	49626	49644	19	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
78	NC_016218	AAAG	3	49881	49891	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016218	AT	6	50175	50186	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016218	CTT	4	50894	50905	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016218	ATT	4	50900	50911	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016218	AG	6	51819	51829	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016218	CTT	4	51854	51865	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016218	CTT	4	52376	52387	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016218	TA	7	52955	52969	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016218	TCTTTA	3	53245	53261	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016218	TA	6	53576	53586	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016218	TAG	4	53988	53998	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016218	TTCACT	3	54746	54764	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
90	NC_016218	AAAG	3	55107	55118	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016218	CTA	4	55587	55597	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016218	ACTT	3	55636	55647	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016218	TCT	4	55649	55660	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016218	TTC	4	56368	56378	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016218	CTTT	3	56653	56663	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016218	TCT	4	56848	56859	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016218	ACG	4	58767	58777	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016218	TTAG	3	60145	60156	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016218	TCTT	3	60176	60187	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016218	TGG	4	60304	60315	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016218	CT	6	61272	61282	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016218	GAAA	3	61471	61481	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016218	AGAC	3	62223	62233	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016218	AT	6	62243	62254	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016218	TA	6	62726	62736	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016218	AAAGA	3	65338	65351	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016218	CGTT	3	65399	65410	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016218	CTTT	3	65581	65591	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016218	GAA	4	65602	65613	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016218	GAC	4	65709	65720	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016218	CTTT	3	65960	65970	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016218	AAAG	3	68085	68096	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016218	TTC	4	68360	68371	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016218	TAC	4	68988	68999	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016218	ATTC	3	69612	69622	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016218	AGT	4	69682	69692	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016218	AG	6	70016	70026	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016218	AGG	4	70488	70499	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016218	AACT	3	70720	70731	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016218	GCT	4	71377	71387	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016218	AT	6	72635	72646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016218	AGAC	4	72762	72776	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016218	AAG	4	74380	74391	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016218	CCTT	3	74927	74938	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016218	AGA	4	76359	76369	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016218	AGA	4	76376	76387	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016218	AAAGAA	3	76697	76715	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
128	NC_016218	AGAAAG	3	77150	77166	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_016218	TC	6	77257	77267	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016218	TACC	3	77310	77320	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016218	AG	6	78271	78281	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016218	TGC	4	80196	80207	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016218	AAAG	3	80303	80314	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016218	CAAT	3	81014	81024	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016218	ATGT	3	81683	81694	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016218	TA	6	82062	82073	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016218	AGAA	3	82351	82361	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016218	CCCG	3	82443	82454	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016218	CT	7	82922	82934	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016218	TAAG	4	83089	83104	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
141	NC_016218	TGAT	4	83457	83471	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
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228	NC_016218	TC	6	126879	126889	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
229	NC_016218	CTTT	3	127006	127018	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 9