ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016217	AAAG	3	598	608	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016217	CCTT	3	1112	1122	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016217	TTTG	3	2156	2166	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016217	CTT	4	2168	2180	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016217	CTTT	3	2986	2996	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016217	CCT	4	3542	3552	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016217	CT	6	3570	3580	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016217	CT	6	3601	3611	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016217	CTC	4	3818	3828	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016217	TCTT	3	4356	4367	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016217	CT	6	5696	5706	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016217	AT	6	6156	6167	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016217	TCT	4	6674	6684	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016217	AGAAAA	3	7667	7685	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_016217	TA	6	8924	8934	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016217	ACTT	3	9587	9597	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016217	AAAG	3	9884	9895	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016217	TTCT	3	10128	10138	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016217	TA	6	10337	10348	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016217	GAA	4	11589	11599	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016217	AAG	4	11598	11610	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016217	GCA	4	11624	11636	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016217	CTG	4	12065	12076	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016217	AGA	4	12540	12550	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016217	AGC	4	12688	12699	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016217	GA	6	13388	13398	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016217	CTTT	5	14107	14125	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
28	NC_016217	AAGG	3	14502	14512	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016217	CTT	4	14752	14764	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016217	GAA	4	16733	16743	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016217	TA	10	17660	17679	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_016217	ATGA	3	18699	18709	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016217	ACAG	3	19746	19756	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016217	GA	6	19855	19866	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016217	GTTT	3	20734	20744	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016217	AGT	4	20786	20797	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016217	CT	7	22008	22020	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016217	T	13	22227	22239	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016217	AAGA	3	22967	22978	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016217	AAG	4	23061	23072	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016217	TTC	4	23800	23810	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016217	AAAG	3	24032	24043	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016217	TC	7	25001	25013	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016217	TA	10	25081	25100	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
45	NC_016217	GTA	4	26835	26845	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016217	AAG	4	27309	27320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016217	CAG	4	27484	27495	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016217	GAA	4	27666	27676	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016217	A	15	27847	27861	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_016217	CAA	4	28252	28262	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016217	TTC	4	28445	28456	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016217	AGAA	3	29519	29530	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016217	TA	6	30167	30177	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016217	CT	6	30581	30591	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016217	CTTT	3	30869	30880	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016217	AGC	4	30975	30986	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016217	CT	6	32902	32912	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016217	CGAA	3	35821	35831	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016217	GCAA	3	36577	36587	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016217	AAGT	3	36656	36668	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016217	CTT	4	37274	37288	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016217	AGA	4	37604	37616	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016217	AGATA	3	37914	37927	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016217	AAGGAG	3	38346	38362	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016217	AT	6	41317	41328	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016217	GTAA	3	42616	42628	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016217	TC	6	42903	42913	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016217	CT	6	42966	42976	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016217	TAG	4	44245	44256	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016217	CCCTT	3	44459	44473	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016217	ATCT	3	44577	44589	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016217	CT	10	45167	45185	19	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	Non-Coding
73	NC_016217	GTC	4	45297	45307	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016217	AAAG	3	45496	45507	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016217	CGG	4	46243	46253	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016217	TCTCC	3	47335	47348	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016217	TC	7	47411	47423	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016217	CCTG	3	47957	47969	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016217	AGA	4	48021	48032	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016217	TAT	4	48183	48193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016217	TA	8	48817	48832	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016217	CTTT	3	51246	51257	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016217	CA	7	52019	52032	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016217	AGA	4	52051	52062	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016217	ACT	4	52063	52073	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016217	AAG	4	52121	52133	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016217	GTA	4	52194	52204	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016217	AGAA	3	53620	53631	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016217	CTTT	3	53890	53900	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016217	CTT	4	54016	54027	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016217	GAAA	3	54820	54830	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016217	TAAA	3	56475	56485	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016217	CTTTT	3	58020	58035	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016217	AAG	4	58480	58491	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016217	CTTT	3	58701	58713	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016217	CTTT	3	61295	61306	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016217	CTT	4	61403	61413	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016217	CTC	4	62182	62192	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016217	GGCA	3	62314	62324	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016217	TCTT	3	62350	62361	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016217	TCT	4	62413	62423	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016217	TCT	4	62497	62508	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016217	CTT	4	62597	62609	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016217	GCGA	3	62889	62900	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding

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