ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 28

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016216	TGAA	3	1297	1307	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016216	GA	6	1743	1753	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016216	TGAA	3	1865	1875	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016216	TCTT	3	1998	2009	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016216	TGAA	3	2278	2288	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016216	TGAA	3	2350	2360	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016216	GAG	4	2480	2491	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016216	CTT	4	3067	3077	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016216	CTT	4	4218	4229	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016216	GA	7	4559	4571	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016216	GA	6	6505	6516	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016216	CTTT	3	7300	7311	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016216	TCT	4	7449	7459	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016216	TA	6	8117	8127	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016216	AG	6	8345	8355	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016216	AGA	4	8367	8378	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016216	ACC	4	8406	8416	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016216	TAC	4	9241	9252	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016216	TCT	4	9473	9484	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016216	CCGC	3	9554	9564	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016216	GAA	4	10623	10634	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016216	AGGTT	3	11296	11309	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016216	TCT	4	12328	12339	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016216	GAAA	3	12896	12908	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016216	TCTTT	3	13112	13125	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016216	TTCC	3	13942	13953	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016216	CTT	4	14065	14075	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016216	CTT	4	15067	15078	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016216	CTTT	3	15117	15127	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016216	CTT	5	15821	15836	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
31	NC_016216	GA	7	16418	16430	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016216	CATT	3	16796	16807	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016216	AAG	4	17150	17160	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016216	TCT	4	18039	18050	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016216	TA	8	20608	20622	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016216	TGAT	3	21394	21405	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016216	CTT	4	21676	21687	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016216	TCC	4	22300	22311	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016216	TTTC	3	22336	22346	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016216	CTT	4	23802	23813	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016216	AAAT	3	24318	24329	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016216	AAG	4	25592	25604	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016216	GTCT	4	26077	26091	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
44	NC_016216	TAG	4	27549	27560	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016216	TTTG	3	27692	27703	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016216	CTT	4	28803	28813	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016216	TA	6	29827	29837	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016216	CTT	4	29923	29933	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016216	TAG	4	30076	30086	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016216	GAA	4	30221	30231	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016216	TAG	4	31285	31295	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016216	GA	6	31980	31990	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016216	CTA	4	32079	32089	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016216	TCCT	3	32987	32998	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016216	GCA	5	33023	33037	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016216	TTAA	3	33048	33059	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016216	CGAG	3	33864	33876	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016216	AGA	4	34066	34077	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016216	TAG	4	35433	35443	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016216	GATC	3	37668	37680	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016216	TAC	4	39309	39320	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016216	GAA	4	39448	39458	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016216	AT	6	41081	41092	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016216	TC	6	42119	42129	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016216	TA	8	42592	42608	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_016216	AT	6	44331	44344	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016216	AT	6	45677	45688	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016216	CTTT	3	46525	46535	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016216	ACT	4	46631	46643	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016216	CTTG	3	47200	47210	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016216	CTAA	3	47244	47255	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016216	ATGTA	3	47456	47470	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016216	GTATGA	3	47624	47642	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
74	NC_016216	CTA	4	47766	47777	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016216	GAA	4	47943	47953	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016216	AAAAG	3	48019	48032	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016216	CATT	3	48684	48695	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016216	AAG	4	49727	49739	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016216	TGAA	3	50732	50742	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016216	GGGAGA	3	50795	50813	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
81	NC_016216	CT	6	51285	51295	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016216	TC	7	51313	51325	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016216	TCTCCT	3	51444	51460	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016216	ACTCTC	3	51500	51516	17	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016216	TC	6	51524	51536	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016216	AGTT	3	52098	52109	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016216	TTC	5	52405	52419	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016216	GCA	4	54111	54121	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016216	ATCT	3	54270	54282	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	35796720
90	NC_016216	TC	7	54625	54637	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	35796720
91	NC_016216	AAG	4	54813	54823	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35796720
92	NC_016216	AGG	4	55120	55131	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	35796720
93	NC_016216	TCA	4	56034	56045	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	35796720
94	NC_016216	AGGC	3	56357	56367	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	35796720
95	NC_016216	AAAG	3	56402	56413	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	35796720
96	NC_016216	GAAC	3	57010	57020	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	35796720
97	NC_016216	TCAGAC	3	57137	57154	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	35796720
98	NC_016216	CTTT	3	57389	57400	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35796720
99	NC_016216	TA	6	57415	57425	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35796720
100	NC_016216	AAAG	3	58014	58025	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	35796720
101	NC_016216	TC	6	58325	58337	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	35796720
102	NC_016216	TCTT	3	58884	58895	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	35796720
103	NC_016216	AAAG	3	59433	59443	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016216	AAG	4	59875	59886	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016216	GA	6	60021	60031	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016216	AAAAGA	3	60428	60445	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_016216	CTT	4	60603	60614	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016216	AAG	4	60666	60677	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016216	GAC	4	60793	60804	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016216	CT	6	61832	61842	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016216	GAA	4	62014	62025	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016216	CT	6	62925	62936	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016216	AAAG	3	63004	63014	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016216	TA	6	65766	65777	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016216	AGA	4	65944	65954	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016216	CAAG	3	66543	66553	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016216	AT	6	66693	66704	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016216	TCTTT	3	66825	66839	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016216	GACAT	3	67167	67180	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016216	CTTTAG	3	67355	67372	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
121	NC_016216	GTA	4	67849	67859	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016216	ACT	4	67911	67922	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016216	TCT	4	68691	68702	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016216	AAG	4	69558	69569	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016216	CATT	3	72278	72289	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016216	AGA	4	72381	72392	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016216	CT	7	72855	72867	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016216	CTT	4	73183	73194	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016216	CCCT	3	74447	74458	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016216	AAGA	3	75046	75057	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016216	AAGA	3	75187	75198	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016216	TGC	4	75234	75245	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016216	CTG	4	76576	76586	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016216	ATTT	3	76752	76764	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016216	AGA	4	77102	77113	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016216	TA	6	77975	77986	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016216	CTTT	4	78270	78284	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
138	NC_016216	AGA	4	78753	78763	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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177	NC_016216	TTC	4	102146	102158	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
178	NC_016216	CTT	4	102385	102396	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
179	NC_016216	AT	6	102428	102438	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 28