ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016214	ATA	4	102	112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016214	TAC	4	1573	1584	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016214	GAA	4	1635	1645	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016214	AGGT	3	3711	3722	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016214	CCTT	3	5076	5086	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016214	TCT	4	5348	5359	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016214	AGG	4	5440	5451	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016214	CTA	4	5864	5875	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016214	TA	7	6307	6319	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016214	GA	7	8532	8544	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016214	AAGC	3	8785	8795	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016214	CTAT	3	8880	8890	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016214	CTT	4	10197	10209	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016214	GAA	4	13478	13490	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016214	AT	6	14160	14175	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016214	AGA	4	14955	14966	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016214	CTTT	3	16002	16013	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016214	CCGAT	3	16299	16312	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016214	CGCT	3	18338	18348	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016214	AG	6	18677	18688	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016214	TCT	4	18710	18720	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016214	CTT	4	19174	19186	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016214	TAGG	3	19986	19997	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016214	TAG	4	20189	20200	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016214	CTAT	3	22004	22016	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016214	TCT	4	22016	22027	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016214	AACT	3	22829	22839	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016214	CTT	4	23309	23319	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016214	AT	6	23454	23465	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016214	TTTC	3	24284	24294	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016214	GAG	4	24552	24562	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016214	GA	6	24777	24787	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016214	TGT	4	25209	25219	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016214	AG	6	25772	25782	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016214	CTTTCT	3	26092	26108	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
36	NC_016214	GAGGA	3	26373	26388	16	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_016214	AT	6	26761	26772	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016214	TCTT	3	27581	27591	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016214	TGAA	3	28217	28227	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016214	TGAA	3	28443	28453	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016214	GA	6	28739	28749	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016214	GAAAG	3	28763	28777	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016214	TTAA	3	29223	29233	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016214	TAG	4	29447	29457	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016214	CTT	4	29461	29473	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016214	CT	6	30136	30146	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016214	AAGAA	4	30914	30934	21	80 %	0 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016214	TA	6	31069	31080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016214	TCC	4	31621	31632	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016214	TAAGA	3	31742	31755	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016214	TGAA	3	32537	32548	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016214	GA	7	33127	33139	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016214	AGCC	3	33257	33268	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016214	TC	6	33758	33768	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016214	ATCT	3	34590	34601	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016214	TA	6	35760	35770	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016214	TAA	4	35948	35959	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016214	AG	6	36384	36394	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016214	GACAA	3	36468	36481	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016214	TTTG	3	36949	36960	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016214	TAGA	3	37300	37310	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016214	CCTT	3	37696	37706	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016214	CTC	4	38089	38100	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016214	AACA	3	38310	38320	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016214	AT	6	38824	38834	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016214	AT	7	38936	38948	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016214	ACTT	3	39309	39320	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016214	CTT	4	40370	40380	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016214	ATCT	3	40483	40494	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016214	TC	6	40828	40838	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016214	AGA	4	41835	41845	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016214	CTTT	4	41930	41945	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016214	TA	6	42746	42757	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016214	CTT	4	43219	43230	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016214	AAGAA	3	43252	43265	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016214	TA	6	43709	43719	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016214	GAA	4	44457	44467	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016214	TA	6	44591	44602	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016214	AG	6	44674	44684	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016214	TAG	4	45389	45399	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016214	GCA	4	46194	46205	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016214	CT	6	46346	46356	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016214	CTTT	3	46425	46436	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016214	TC	6	46647	46657	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016214	AT	6	46793	46803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016214	GGAA	3	46892	46903	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016214	AG	6	48293	48303	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016214	AAGA	3	48833	48844	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016214	TCT	4	49846	49857	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016214	TGCT	3	50299	50310	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016214	AGA	4	50407	50418	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016214	GA	6	51234	51245	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016214	ACT	4	51463	51473	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016214	GTAT	3	51920	51931	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016214	GAGAA	3	52010	52024	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016214	CT	8	53063	53077	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016214	CGA	4	53371	53382	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016214	AAAG	3	55020	55031	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016214	GTCGAA	4	55114	55137	24	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016214	GA	6	56924	56934	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016214	GAAA	3	57536	57547	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016214	AACG	3	57629	57640	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016214	CTT	4	57650	57660	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016214	TAGA	3	58375	58385	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016214	TAG	4	58482	58493	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016214	AGA	5	58517	58531	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016214	TCT	4	58548	58559	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016214	GCGA	3	59210	59221	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016214	AAAG	4	59432	59446	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016214	TGC	4	59674	59684	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016214	CTT	5	59753	59767	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016214	TA	8	59911	59927	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_016214	AAG	5	59996	60009	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016214	ACAAA	3	61653	61667	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016214	ATCTTT	3	61796	61814	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016214	AAAG	3	62194	62204	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016214	TA	6	63323	63334	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016214	TCT	5	63697	63712	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016214	TAAC	3	63877	63888	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016214	TAAG	4	64359	64374	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding

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