ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016213	T	17	1	17	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_016213	CT	6	676	686	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016213	CTCTC	3	739	753	15	0 %	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016213	GAACGA	3	812	829	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016213	AGA	5	1433	1446	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016213	GAA	4	1841	1852	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016213	AGGA	4	2242	2257	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016213	AGA	5	2327	2340	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016213	AGA	4	2459	2470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016213	CG	6	2502	2513	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016213	AAG	4	2517	2527	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016213	AT	6	3124	3135	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016213	CTC	4	3512	3523	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016213	AGAAAG	3	3788	3804	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_016213	ACCTCT	3	3888	3904	17	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
16	NC_016213	AAAG	3	4262	4272	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016213	ACA	4	4677	4687	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016213	AAGC	3	7647	7657	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016213	AGA	4	8168	8179	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016213	CTA	6	8561	8577	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016213	AAGAA	3	9221	9234	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016213	TAT	4	11099	11110	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016213	TC	6	11556	11566	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016213	CCTT	3	11866	11877	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016213	GAA	4	12184	12196	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016213	TA	6	14174	14185	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016213	TA	7	14880	14892	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016213	CTTT	3	15916	15926	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016213	AAGA	3	15927	15937	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016213	TTCT	3	16732	16743	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016213	GAAA	4	17228	17243	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016213	TA	6	17475	17485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016213	TATC	3	18757	18767	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016213	TCG	4	19313	19323	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016213	CTT	4	19393	19404	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016213	ACAA	3	20241	20251	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016213	AG	6	22093	22103	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016213	TCT	4	22298	22308	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016213	TA	6	22392	22402	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016213	TAG	4	22601	22611	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016213	TTC	4	22707	22717	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016213	GGGC	3	22791	22801	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016213	TACTT	3	23088	23101	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016213	TCTT	3	24450	24461	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016213	TCT	4	25157	25167	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016213	AAAT	3	25417	25428	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016213	TCAC	3	25739	25749	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016213	AT	6	26893	26904	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016213	TCTA	3	28386	28397	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016213	GA	8	28561	28575	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016213	TA	6	28919	28929	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016213	CAATC	3	29075	29089	15	40 %	20 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016213	GACTA	3	29346	29359	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016213	TA	8	31213	31227	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016213	AAAG	3	31880	31891	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016213	CCTTA	3	32382	32396	15	20 %	40 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016213	GGAT	3	32582	32593	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016213	TGAA	3	32943	32953	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016213	TTA	4	33206	33216	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016213	AAG	4	34053	34063	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016213	TTCTCC	3	35189	35205	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016213	AAAGGA	3	35289	35306	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_016213	CT	6	35514	35524	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016213	ATCT	3	36106	36117	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016213	AGGC	3	36389	36401	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016213	GA	6	37007	37018	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016213	AGAA	3	37683	37694	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016213	TA	6	37767	37778	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016213	GAAA	3	38365	38375	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016213	TGG	4	38500	38511	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016213	TTC	4	40287	40298	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016213	GAAA	3	40691	40701	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016213	CTT	4	40822	40834	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016213	AT	6	40835	40846	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016213	GTA	4	41104	41115	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016213	TAGA	4	42832	42846	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016213	TAGG	3	43563	43573	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016213	AG	6	43988	43998	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016213	TA	7	44114	44127	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016213	TTAAT	3	44707	44721	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016213	TA	6	45018	45029	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016213	TA	6	45385	45395	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016213	TGC	4	46203	46214	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016213	CTTT	3	46257	46267	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016213	ACT	4	46662	46673	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016213	CCTA	3	46748	46759	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016213	CTAT	3	47337	47347	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016213	AGG	4	47673	47684	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016213	TTTC	3	47884	47894	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016213	CTTT	3	49217	49228	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016213	CTG	4	49669	49680	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016213	TA	8	50281	50295	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016213	ACT	4	51562	51573	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016213	TATTG	3	51574	51587	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016213	AGT	4	51706	51717	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016213	AGA	4	52749	52762	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016213	ACG	4	52846	52857	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016213	ACAA	3	52975	52986	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016213	CT	6	53605	53615	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016213	TC	6	55314	55324	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016213	CTT	4	55350	55360	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016213	TA	6	55416	55427	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016213	TCT	4	55899	55909	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016213	TAG	4	56283	56294	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016213	CAAA	3	56313	56324	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016213	ACCA	3	57274	57284	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016213	TCAAC	3	57333	57346	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016213	GCA	4	57509	57520	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016213	TA	6	57708	57718	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016213	AAGG	3	58070	58081	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016213	TAG	4	58509	58521	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016213	CTT	4	58728	58740	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016213	TCT	4	59602	59612	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016213	GAG	4	60610	60620	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding

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