ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 5

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_016212CTTC312471258120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
2NC_016212CCTT317561767120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
3NC_016212AGGC3201420241125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
4NC_016212GAAA3206320731175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
5NC_016212CAAA3380538161275 %0 %0 %25 %0 %Non-Coding
6NC_016212CTTC343234334120 %50 %0 %50 %0 %Non-Coding
7NC_016212TGAA3640564151150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
8NC_016212GAAA3773477441175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
9NC_016212GGAA3812881391250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
10NC_016212TAAC3984498541150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
11NC_016212CTTA310998110091225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
12NC_016212CCTT31120611217120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
13NC_016212TCTT41175711771150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
14NC_016212TGAA318474184841150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
15NC_016212TGAA318533185431150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
16NC_016212TGAA319928199381150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
17NC_016212AAGA320776207871275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
18NC_016212GAAA328914289251275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
19NC_016212GTTT32915229163120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
20NC_016212TCTT32968629697120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
21NC_016212GAAA332302323121175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
22NC_016212TGAA332804328141150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
23NC_016212GGTA333781337921225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
24NC_016212TCTT33490634916110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
25NC_016212TTTG33538235394130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
26NC_016212CTTT43556635581160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
27NC_016212TTTG33630536315110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
28NC_016212TTTC33732737338120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
29NC_016212GAAA338324383351275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
30NC_016212ACTT341267412781225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
31NC_016212TACT342762427731225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
32NC_016212AATA343234432451275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_016212AAAG343921439311175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
34NC_016212AAGA344462444731275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
35NC_016212TTCA344947449571125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
36NC_016212GTTT34601746027110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
37NC_016212AGTA346625466371350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
38NC_016212TCTT34704947059110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
39NC_016212TGCG34821748229130 %25 %50 %25 %7 %Non-Coding
40NC_016212GGCA349566495771225 %0 %50 %25 %0 %Non-Coding
41NC_016212ACCC350783507931125 %0 %0 %75 %9 %Non-Coding
42NC_016212TAAG451700517151650 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
43NC_016212TTCT45357853594170 %75 %0 %25 %5 %Non-Coding
44NC_016212CGTT35832358333110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
45NC_016212ATTT359794598051225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_016212AAAG360312603231275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
47NC_016212GCTT36214362153110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
48NC_016212AGAA362803628151375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
49NC_016212TTAA362913629241250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
50NC_016212TTGC36363763648120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
51NC_016212GGGC36770567715110 %0 %75 %25 %9 %Non-Coding
52NC_016212AAGT369933699441250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
53NC_016212CTTT37264272652110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_016212AAAG373077730881275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
55NC_016212AATT373739737501250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
56NC_016212ACCT378266782771225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
57NC_016212AAAG379194792061375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
58NC_016212CCAG379764797741125 %0 %25 %50 %9 %Non-Coding
59NC_016212GAAA381261812711175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
60NC_016212TCTT38163181641110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
61NC_016212AGCT383248832581125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
62NC_016212CTTA384248842591225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
63NC_016212AAGG386607866191350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
64NC_016212TTTC38956389573110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
65NC_016212CTAT390264902741125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
66NC_016212CGTC39100291013120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
67NC_016212TTAT392558925691225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_016212AAAG393620936301175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
69NC_016212ACTT31000381000491225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
70NC_016212CGAA31001261001361150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
71NC_016212CTTT3102144102155120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
72NC_016212CTTT3103411103421110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
73NC_016212TGAA31040091040191150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
74NC_016212CCTT3105354105366130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
75NC_016212ATCT31068481068591225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
76NC_016212TATC31150481150581125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
77NC_016212AAAG31152921153021175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
78NC_016212TTAT31166261166371225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
79NC_016212TTTC3125037125047110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
80NC_016212AAAG31268021268121175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
81NC_016212TTCC3128357128368120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
82NC_016212ATGT31297991298091125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
83NC_016212AGAA31303561303661175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
84NC_016212CAAG31307051307151150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
85NC_016212GTGC3132076132086110 %25 %50 %25 %9 %Non-Coding
86NC_016212AGAA31333001333111275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
87NC_016212TTCA31333901334001125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
88NC_016212CGCT3135961135972120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
89NC_016212CAAA31397571397681275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
90NC_016212TCCT3140144140156130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
91NC_016212CTTA31459511459621225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
92NC_016212AGAA41462191462341675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding