ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016211	TCTT	3	512	523	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016211	TAAGTA	3	789	806	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_016211	AAAGAA	3	831	849	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_016211	TA	6	1313	1323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016211	TA	6	1637	1648	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016211	TTCT	3	2757	2768	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016211	CTT	4	4094	4104	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016211	CCT	4	4238	4248	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016211	TTTC	3	4311	4321	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016211	CTTT	3	4560	4571	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016211	TAG	5	5394	5408	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016211	GAA	4	6855	6866	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016211	AGT	4	8413	8424	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016211	AGA	5	8429	8443	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016211	CT	7	8788	8800	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016211	GAA	4	9375	9386	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016211	TTTC	3	9740	9751	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016211	TTC	4	10253	10265	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016211	TTTG	3	10284	10295	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016211	GGCT	3	11065	11076	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016211	CTT	4	12846	12857	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016211	AAAAG	3	12986	13000	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_016211	CTTT	3	13141	13151	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016211	TTGTC	3	13214	13228	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016211	CAAAG	3	15797	15810	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016211	TA	7	16049	16062	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016211	TAG	5	16368	16381	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016211	GTATAA	3	16608	16626	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016211	GA	6	16759	16769	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016211	AGA	4	17598	17608	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016211	AT	6	18032	18042	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016211	AC	6	18355	18366	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016211	AT	7	19918	19933	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016211	AAGG	3	20011	20022	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016211	AAG	4	20230	20240	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016211	TC	7	20905	20918	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016211	TA	6	21067	21078	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016211	ATTC	3	21698	21708	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016211	ACTT	3	21969	21980	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016211	TCT	4	22526	22537	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016211	AAAG	3	22729	22740	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016211	AG	6	23387	23397	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016211	TTC	4	25217	25229	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016211	TTGTC	3	26343	26358	16	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016211	AAGA	4	26575	26589	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016211	GCTT	3	26933	26944	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016211	TTTC	3	27111	27121	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016211	GAG	4	27657	27668	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016211	AC	6	28573	28583	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016211	CTT	4	29284	29294	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016211	CTTT	3	29534	29545	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016211	AAG	4	31352	31363	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016211	CT	6	31650	31660	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016211	TCT	4	32035	32046	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016211	TGAA	3	32738	32748	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016211	GA	8	32755	32769	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016211	AGAGG	3	32986	33000	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016211	GAG	4	33318	33328	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016211	TGAA	3	33374	33384	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016211	GTTT	3	34572	34583	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016211	TCT	4	35451	35462	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016211	TGAA	3	35722	35732	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016211	CTT	4	35842	35852	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016211	AAAAAG	3	35879	35897	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
65	NC_016211	CTT	4	35956	35967	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016211	TTAG	3	36124	36134	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016211	CTTT	3	36153	36163	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016211	T	12	37769	37780	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016211	TCT	4	38483	38496	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016211	CG	6	38627	38638	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016211	GA	7	38900	38912	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016211	GTC	4	39259	39270	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016211	TC	6	39495	39505	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016211	GAAA	3	39545	39555	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016211	GAAA	3	41541	41551	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016211	AAG	4	41974	41985	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016211	GA	6	42032	42042	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016211	CTTT	3	43122	43132	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016211	TTC	4	43134	43144	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016211	TA	6	44350	44360	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016211	CTT	4	44639	44650	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016211	TATAT	3	44899	44913	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016211	GAA	4	45445	45455	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016211	GTCTT	4	45691	45709	19	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
85	NC_016211	TTG	4	45714	45725	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016211	TCT	4	46313	46325	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016211	AGA	4	46556	46568	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016211	TA	6	47837	47847	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016211	CT	6	48691	48701	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016211	CG	6	48926	48937	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016211	GAAA	4	49043	49057	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016211	AAAG	3	49173	49184	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016211	CCCA	3	49949	49960	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016211	AT	7	50896	50908	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016211	ACT	4	52116	52127	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016211	ATCCT	3	52158	52171	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016211	GTTTT	3	53652	53666	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016211	GA	6	53956	53966	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016211	TA	6	55162	55174	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016211	AGA	4	55351	55361	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016211	AGA	4	55631	55643	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016211	ACTA	5	55823	55843	21	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016211	AGAA	3	56728	56738	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016211	CA	6	57270	57280	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016211	TTCT	3	58454	58465	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016211	TA	7	58710	58723	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_016211	TCT	4	58781	58793	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016211	CTA	4	59489	59499	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016211	TAA	4	59500	59510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016211	ATTA	3	59651	59662	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016211	CT	6	59814	59825	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016211	AG	6	60070	60080	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016211	TACT	3	60806	60817	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016211	TGGG	3	61872	61883	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016211	AGA	4	62750	62761	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

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