ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 59

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016210	GA	7	450	462	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016210	TA	8	3250	3264	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016210	AAAG	3	3426	3437	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016210	TAC	4	4517	4528	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016210	TG	6	5059	5069	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016210	AAAG	4	5722	5737	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016210	AAGT	3	8001	8012	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016210	GGA	4	10556	10567	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016210	GTC	4	10608	10618	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016210	CTTT	3	11001	11011	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016210	GGCC	3	11330	11341	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016210	TA	6	12434	12444	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016210	TAAA	3	12640	12652	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016210	TAGC	3	14495	14506	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016210	AGAAAA	3	16217	16235	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_016210	TA	7	16487	16499	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016210	GAA	4	16517	16527	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016210	TAG	4	16992	17003	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016210	GCA	4	18236	18247	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016210	AAAGA	3	19234	19247	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016210	TAG	4	19638	19649	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016210	AAGA	3	20435	20446	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016210	AT	6	20973	20984	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016210	GA	6	21821	21833	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016210	CTTT	3	22592	22602	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016210	CTT	4	22868	22880	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016210	AAAG	3	23635	23646	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016210	GTAA	3	23829	23840	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016210	TC	7	24159	24171	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016210	AAAG	3	25397	25408	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016210	TA	6	25765	25776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016210	TA	6	26223	26233	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016210	CTCTA	3	26511	26524	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016210	TTC	4	26668	26678	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016210	CT	6	27472	27483	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016210	GGC	4	27553	27564	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016210	CTT	4	28274	28286	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016210	CCT	4	28304	28314	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016210	GGTT	3	28726	28736	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016210	AG	6	28742	28752	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016210	ATATC	3	28860	28873	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016210	TCTT	4	29447	29461	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016210	TCA	4	30148	30160	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016210	CAC	4	31611	31621	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016210	GAA	5	32619	32632	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016210	TC	6	33106	33116	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016210	AGA	4	33663	33675	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016210	TA	8	34227	34242	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016210	TG	6	34966	34977	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016210	TA	7	35335	35349	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016210	CAAG	3	36292	36303	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016210	GA	6	36929	36940	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016210	CTA	4	38121	38131	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016210	AG	6	40881	40892	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016210	CTTT	3	41890	41901	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016210	ACT	4	42167	42177	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016210	TAG	5	42179	42194	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_016210	AAG	4	43603	43613	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016210	CTT	4	43986	43996	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016210	CTA	4	45544	45555	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016210	CT	6	45565	45575	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016210	AGAA	3	45919	45930	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016210	AT	6	47155	47166	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016210	AGGT	3	47282	47293	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016210	AGA	4	47464	47474	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016210	TA	7	47759	47772	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016210	TCCT	3	47909	47919	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016210	TAAG	4	48216	48232	17	50 %	25 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016210	TCT	4	48347	48357	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016210	TA	6	48364	48374	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016210	AGT	5	48541	48555	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016210	AAGC	3	48710	48721	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016210	CTT	4	49024	49035	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016210	TTTC	3	49904	49914	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016210	TA	7	50737	50749	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016210	CTTT	3	51669	51679	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016210	CTTT	3	51902	51912	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016210	TCT	4	51993	52003	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016210	AG	6	52150	52160	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016210	GCAA	3	52331	52341	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016210	CTTT	3	52431	52443	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016210	TAGA	3	52475	52485	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016210	CTTT	3	53139	53149	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016210	AG	6	53318	53328	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016210	TA	6	53812	53823	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016210	TA	6	54265	54276	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016210	TA	6	54553	54564	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016210	TA	6	54610	54620	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016210	AGA	4	55618	55629	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016210	TTTA	3	55812	55823	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016210	TTC	4	56555	56567	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016210	TTAACA	3	57522	57538	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
93	NC_016210	TAG	4	59988	59998	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016210	AAG	4	60450	60461	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016210	TCT	4	61040	61051	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016210	AAAG	3	61464	61475	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016210	CA	6	61866	61876	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016210	AAAG	3	62174	62185	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016210	AG	6	62666	62677	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016210	GA	6	62770	62780	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016210	TAAC	3	62791	62802	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016210	TC	6	63818	63828	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016210	TCTT	3	64264	64275	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016210	CTTTT	3	65873	65888	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016210	TCT	4	66029	66040	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016210	GTT	4	66038	66049	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016210	TTC	4	66802	66812	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016210	CCT	4	66959	66971	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016210	AGC	4	67014	67025	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016210	CT	6	67467	67477	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016210	GAA	4	67743	67754	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016210	GAA	4	68341	68352	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016210	AAGA	4	68582	68596	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016210	CTT	4	69024	69036	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016210	CTT	4	69348	69359	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016210	GGAAGA	3	70060	70076	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
117	NC_016210	GGA	4	70134	70144	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016210	AAAAAG	3	72329	72347	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
119	NC_016210	TC	6	72824	72834	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016210	CTC	4	73143	73153	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016210	CCTT	3	73276	73287	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016210	AGA	4	73322	73332	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016210	GTCA	3	73444	73456	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
124	NC_016210	AGA	5	74054	74068	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016210	TC	7	74277	74289	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
126	NC_016210	CT	6	74679	74689	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016210	CTC	4	74779	74789	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016210	TC	7	75537	75549	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016210	GAA	4	77249	77260	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016210	TAAA	3	77826	77836	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016210	GA	6	78154	78164	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016210	AT	6	78343	78354	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016210	GAA	4	78806	78817	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016210	AAGAA	3	81634	81648	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
135	NC_016210	CATT	3	82272	82282	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016210	TGT	4	82461	82472	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016210	CT	6	82806	82816	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016210	TTTA	3	82904	82915	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016210	TTCC	3	82962	82973	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016210	CTT	4	84623	84634	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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