ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 31

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016209	AAG	4	930	941	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016209	AGA	5	1276	1289	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016209	GAA	4	1713	1724	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016209	TCT	4	2776	2786	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016209	AAG	4	2954	2966	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016209	TAC	4	3071	3081	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016209	ATAA	5	3292	3312	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016209	CTT	4	3718	3728	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016209	AAG	4	4089	4101	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016209	CTA	4	4313	4325	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016209	TTA	4	4504	4515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016209	CTTT	3	4938	4950	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016209	TCCC	3	5179	5190	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016209	AGA	4	5201	5212	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016209	AGAA	3	5810	5820	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016209	AGC	4	5903	5914	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016209	CTTT	5	6256	6276	21	0 %	75 %	0 %	25 %	4 %	Non-Coding
18	NC_016209	CTT	4	6615	6625	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016209	TA	6	7396	7407	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016209	GCTT	3	7489	7500	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016209	CTTT	3	8093	8105	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016209	ATAG	3	8139	8149	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016209	TTAC	3	8558	8568	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016209	AGT	4	8595	8605	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016209	TA	6	8710	8721	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016209	AAGT	3	9360	9371	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016209	CCTT	3	9483	9493	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016209	CT	6	10327	10337	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016209	TTTTA	3	12307	12321	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016209	GAAA	3	13120	13131	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016209	GAA	4	13335	13346	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016209	AG	6	14308	14319	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016209	TCT	4	14831	14843	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016209	CTA	5	15895	15909	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
35	NC_016209	AAGT	3	16476	16486	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016209	AG	6	16901	16911	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016209	AGGC	3	17203	17214	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016209	TATAG	3	17319	17333	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016209	AGA	4	17992	18003	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016209	TAC	4	18432	18443	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016209	TA	6	20060	20070	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016209	GTT	5	20185	20199	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016209	CAGT	3	22156	22167	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016209	CAGC	3	22760	22771	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016209	TTC	4	23975	23987	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016209	CT	6	24027	24038	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016209	ACTT	3	24162	24172	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016209	GCA	4	24441	24452	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016209	TA	6	25058	25068	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016209	CCATT	3	25112	25125	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016209	TCC	4	25227	25239	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016209	TAG	4	26241	26252	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016209	TCT	4	26258	26269	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016209	AT	6	26582	26592	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016209	AG	6	28027	28037	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016209	AT	7	28666	28679	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016209	TA	6	29484	29494	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016209	AG	7	29890	29902	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016209	AGAC	3	30137	30147	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016209	TAG	4	30303	30314	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016209	GA	6	30538	30549	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016209	AGA	4	30726	30737	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016209	TA	6	31620	31630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016209	CTT	4	31680	31690	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016209	CCACT	3	32925	32938	14	20 %	20 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016209	TA	7	33160	33173	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016209	TA	6	33614	33624	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016209	AGGAGA	3	33912	33928	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016209	CTTT	3	33933	33943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016209	CTT	4	33987	33997	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016209	AG	6	34058	34068	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016209	AAGA	4	34639	34653	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016209	ATG	5	35223	35236	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016209	CT	7	35261	35273	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016209	TCT	4	37786	37797	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016209	CTT	4	37870	37880	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016209	AGAGA	3	38699	38712	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016209	AGA	5	39861	39874	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016209	AAAG	3	40243	40254	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016209	TCATA	3	40557	40570	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016209	GCTTT	3	40749	40764	16	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
82	NC_016209	CG	6	41446	41457	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016209	AGAA	3	42699	42710	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016209	TA	9	44409	44425	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016209	CAA	4	44430	44442	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016209	CT	6	44863	44873	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016209	CTTT	3	45055	45067	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016209	TA	6	45147	45157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016209	TGAC	3	45298	45308	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016209	GCC	5	45479	45492	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016209	TTC	4	46836	46847	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016209	CTTT	3	47599	47609	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016209	AG	6	47788	47798	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016209	TA	12	48865	48887	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016209	ACCC	3	49104	49114	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016209	CTTT	3	49498	49508	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016209	TA	7	50918	50930	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016209	ACTT	3	51672	51682	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016209	AAT	4	52858	52868	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016209	CTT	5	53086	53101	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016209	TA	6	53514	53525	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016209	GAA	4	53969	53979	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016209	AGC	4	55222	55233	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016209	AG	6	55908	55918	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016209	CGTG	3	56799	56809	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016209	CTAA	3	57009	57019	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016209	GAAT	3	57408	57420	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016209	AGT	4	57838	57849	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016209	AAAT	3	57947	57958	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016209	AGA	4	59876	59886	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016209	C	15	60189	60203	15	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016209	AG	6	60253	60263	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016209	TCT	4	61971	61982	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016209	CTTT	3	62643	62653	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016209	TA	6	62709	62719	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016209	TCCT	3	62928	62939	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016209	AG	6	63290	63300	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016209	TTC	4	63824	63834	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016209	TCT	4	65366	65377	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016209	CT	6	66737	66747	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016209	TC	6	66949	66959	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016209	TC	7	67082	67094	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016209	TGTC	3	68294	68304	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016209	CT	7	68586	68598	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016209	AT	6	69527	69538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016209	CT	6	71090	71100	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016209	AG	6	72669	72680	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016209	AAAG	3	73081	73092	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016209	AT	6	73232	73243	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016209	GAT	4	73480	73490	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016209	TA	6	74464	74475	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016209	TCT	4	74540	74551	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016209	AT	6	74833	74843	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016209	CCCT	3	75462	75472	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016209	AG	6	75678	75689	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016209	TAAAG	3	75759	75772	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016209	TTC	6	77326	77344	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
138	NC_016209	TAACA	3	78646	78659	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016209	TACA	3	79540	79551	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016209	AGA	4	79593	79603	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016209	AGGA	3	80128	80140	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016209	AAG	4	80393	80403	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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177	NC_016209	CTTTT	3	99978	99992	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
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183	NC_016209	AAAG	3	102477	102487	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
184	NC_016209	AAAG	3	102843	102853	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 31