ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 37

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016208	ACT	4	453	463	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016208	CTT	4	1108	1119	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016208	TA	6	1645	1655	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016208	CT	7	2260	2274	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016208	CTT	4	2335	2347	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016208	CTG	4	2646	2657	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016208	TGAA	3	3342	3352	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016208	GAG	4	3564	3575	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016208	AAG	4	3756	3767	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016208	AGGC	3	4074	4086	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016208	TTC	4	4529	4541	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016208	CTT	4	4846	4858	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016208	CTTT	3	4971	4982	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016208	AT	7	5290	5303	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016208	CCCTT	3	6550	6564	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016208	TC	6	8307	8317	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016208	TCT	4	8972	8982	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016208	GAA	4	9088	9100	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016208	TG	6	9409	9420	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016208	CTTT	3	10098	10109	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016208	AG	7	10678	10690	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016208	CTT	4	11195	11207	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016208	TAGG	3	11745	11756	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016208	TTGC	3	11978	11989	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016208	AGA	4	12030	12041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016208	AGAGCG	3	12265	12283	19	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
27	NC_016208	AGAA	4	13464	13479	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016208	CTTT	3	14008	14018	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016208	AGAC	3	14440	14450	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016208	TCT	4	14511	14522	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016208	CTTTA	3	14528	14541	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016208	CTG	4	14569	14580	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016208	AAAAGA	3	15177	15194	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_016208	TCT	4	15587	15597	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016208	TAT	4	15677	15688	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016208	TTTC	3	15761	15771	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016208	TCCT	3	16225	16236	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016208	TCT	4	16286	16296	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016208	CCT	4	16765	16776	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016208	TTAC	3	17278	17289	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016208	TC	6	17431	17442	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016208	CT	6	17506	17518	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016208	GAA	4	18153	18163	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016208	AAG	5	18276	18290	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016208	TAAG	3	18375	18385	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016208	GAA	4	18772	18783	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016208	CTGT	3	19050	19061	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016208	CTTG	3	19309	19321	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016208	AGC	4	19435	19446	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016208	CCTTCT	3	20466	20482	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016208	AAG	4	20612	20623	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016208	GAA	4	20763	20774	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016208	CTCTT	3	20982	20995	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016208	TGTT	3	21485	21495	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016208	AAG	5	22043	22057	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016208	GAA	4	22111	22122	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016208	CTC	4	22676	22687	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016208	CTT	4	23115	23125	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016208	CGT	4	24975	24986	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016208	ATTCTT	3	25504	25520	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
61	NC_016208	AAG	4	26065	26076	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016208	AAAG	3	26390	26401	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016208	AT	6	27516	27527	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016208	AG	7	27742	27754	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016208	GA	6	27886	27896	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016208	AAAT	3	29310	29321	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016208	GAC	4	29466	29477	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016208	CTTT	4	29778	29793	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016208	CT	6	29798	29809	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016208	AAG	4	29839	29849	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016208	TCT	4	31289	31300	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016208	CT	6	31322	31333	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016208	AGTAA	3	31617	31630	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016208	TAGA	3	32447	32458	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016208	CTTA	3	32498	32510	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016208	GGAA	3	32518	32530	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016208	GAAAAA	3	32848	32864	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_016208	AAGG	3	33583	33593	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016208	AGC	4	34104	34114	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016208	GA	7	34344	34356	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016208	AAG	4	35338	35349	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016208	GCT	4	35677	35688	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016208	TAG	4	35725	35735	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016208	TAA	4	36547	36558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016208	ATTT	4	36559	36574	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016208	TAGA	3	36868	36880	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016208	TA	6	37327	37337	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016208	AG	6	38075	38085	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016208	CTTTT	3	38685	38699	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
90	NC_016208	GAA	4	39368	39378	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016208	CT	6	39443	39454	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016208	TA	6	39733	39743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016208	TA	7	40717	40729	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016208	AAGC	3	40735	40747	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016208	TA	7	41732	41744	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016208	AAG	4	42832	42843	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016208	GCT	4	43641	43651	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016208	AAG	4	44951	44961	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016208	CTT	4	45731	45743	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016208	TAAA	3	46209	46220	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016208	CT	6	46383	46393	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016208	TTTAG	3	46530	46544	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016208	ACAT	3	47049	47060	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016208	CT	6	47336	47346	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016208	CCTT	3	49014	49025	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016208	GGCG	3	50607	50618	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016208	CTT	4	50695	50707	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016208	TC	7	51378	51390	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016208	TC	6	51681	51691	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016208	ACCC	3	51851	51862	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016208	AG	8	52052	52066	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016208	TCT	4	52577	52588	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016208	GA	8	52859	52873	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016208	AG	6	53061	53071	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016208	AGGA	3	53704	53715	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016208	CTT	4	53996	54007	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016208	GA	7	54120	54132	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016208	TA	7	54769	54782	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016208	AT	7	56661	56674	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016208	GTAC	3	57394	57404	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016208	TTG	4	57410	57422	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016208	TTCT	3	58065	58076	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016208	CTT	4	58346	58356	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016208	CTT	4	59005	59016	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016208	CTT	4	59150	59160	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016208	TCTT	3	60313	60324	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016208	GCT	4	60342	60353	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016208	GCC	4	60874	60884	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016208	CTT	4	61281	61292	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016208	CTT	4	61476	61486	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016208	AAAG	3	61878	61889	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016208	CTT	4	62145	62156	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016208	TCT	4	63411	63422	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016208	CTT	5	63785	63798	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016208	AAGA	3	63999	64010	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016208	AAGA	3	64035	64046	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016208	TCT	4	64101	64112	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016208	GAAA	3	64869	64881	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016208	CT	6	65177	65189	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016208	CTT	4	65890	65901	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 37