ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016207	TCTT	3	67	79	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016207	GGAC	3	249	260	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016207	TGAA	3	726	738	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016207	CTTA	4	1097	1112	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016207	CCT	4	1850	1861	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016207	AGAA	3	1866	1877	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016207	A	15	2779	2793	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016207	TA	6	3979	3989	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016207	TGGA	3	4034	4044	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016207	ATCT	3	5459	5469	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016207	AAAG	4	6092	6106	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016207	TCCTT	3	6641	6654	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016207	CTTT	3	10039	10049	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016207	AGA	5	10904	10917	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016207	CA	6	11039	11050	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016207	AT	6	11108	11118	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016207	CTTAA	3	11694	11707	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016207	GCAA	3	12005	12015	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016207	AGA	4	12852	12862	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016207	GTA	4	14070	14081	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016207	CAAG	3	14088	14099	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016207	AAGA	3	14206	14216	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016207	CTTT	3	14617	14628	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016207	AAAG	3	15353	15363	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016207	AGGT	3	15879	15889	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016207	AGTT	3	15908	15918	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016207	CTGC	3	17275	17287	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016207	TTCTCC	3	17634	17650	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016207	AG	6	19131	19141	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016207	TC	6	19697	19707	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016207	AGAC	3	19711	19721	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016207	ACCC	3	19855	19866	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016207	AAAG	3	21300	21311	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016207	TTTG	3	23188	23198	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016207	TAG	4	24138	24148	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016207	AGT	4	24214	24226	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016207	AACT	4	24283	24297	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016207	AAG	4	28832	28842	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016207	GAA	4	29625	29635	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016207	TC	6	30040	30051	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016207	AAGTT	3	30292	30305	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016207	TCTTT	3	31510	31524	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016207	AGC	4	31886	31896	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016207	ACATC	3	32540	32553	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016207	GTCC	3	34099	34109	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016207	TCT	4	34268	34279	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016207	TA	6	34599	34610	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016207	TGC	4	34648	34660	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016207	CTT	4	34882	34892	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016207	CTT	4	35567	35577	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016207	GAAA	3	35762	35772	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016207	TCT	4	35856	35866	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016207	GAAA	3	37285	37295	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016207	GA	6	37423	37433	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016207	TTTCC	3	38482	38495	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016207	TAG	4	39106	39117	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016207	TA	6	39410	39421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016207	TGA	4	39422	39432	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016207	AAG	4	39674	39686	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016207	GA	6	40827	40837	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016207	ATC	4	42622	42632	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016207	AT	6	44520	44532	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016207	TTCT	3	44876	44887	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016207	AGA	4	45158	45169	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016207	ACCTT	3	46201	46214	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016207	TAGAA	3	46277	46290	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016207	ATAA	3	46585	46596	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016207	ATA	4	47385	47396	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016207	GCT	4	47418	47428	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016207	AG	6	47799	47810	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016207	CTT	4	47822	47833	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016207	TCT	4	49431	49442	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016207	TA	6	49518	49528	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016207	AATG	3	49650	49660	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016207	CTTT	3	49836	49847	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016207	TTAC	3	50242	50252	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016207	TG	9	50708	50724	17	0 %	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_016207	TA	6	50985	50995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016207	TCTT	4	51562	51576	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016207	ACT	4	51780	51790	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016207	CT	6	52189	52200	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016207	TA	6	52691	52701	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016207	AGGAAA	3	53744	53761	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016207	CTTT	3	53870	53881	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016207	AGT	4	54345	54355	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016207	ATC	4	54403	54413	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016207	AAG	4	54514	54524	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016207	CTT	4	54929	54939	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016207	TAAC	3	55304	55315	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016207	AC	6	56078	56088	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016207	TC	7	56259	56271	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016207	AAGAG	3	56413	56426	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016207	AGA	4	56450	56462	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016207	CTTT	3	56922	56933	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016207	CG	6	57507	57518	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016207	CCT	4	58305	58316	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016207	CAAA	3	58557	58569	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016207	AAAAG	3	59023	59036	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016207	ATTC	3	59373	59383	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016207	TA	7	59385	59398	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016207	AAGAA	3	60551	60565	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016207	CTTT	3	60855	60865	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016207	CTGC	3	61743	61753	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016207	TAG	5	61790	61803	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016207	GGAT	3	62264	62274	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

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