ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 93

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016206	TA	6	57	67	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016206	TAC	4	337	347	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016206	TCT	4	1053	1064	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016206	AGGTC	3	1767	1780	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016206	TAG	4	2357	2369	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016206	CT	6	2386	2397	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016206	CTT	4	2488	2498	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016206	GA	6	2656	2666	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016206	TCT	4	2709	2719	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016206	CTAC	3	2982	2992	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016206	AGA	4	3631	3642	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016206	CTT	4	4416	4427	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016206	CTT	4	5400	5411	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016206	TC	6	5496	5506	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016206	CTTA	3	5576	5588	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016206	GGAAC	3	5706	5719	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016206	TCTTG	3	6892	6905	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016206	TTTC	3	6917	6928	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016206	TCAC	3	7667	7678	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016206	GA	6	8392	8402	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016206	AGT	5	8739	8753	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016206	CCTT	3	9013	9024	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016206	AAGC	3	9291	9301	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016206	TTC	4	9410	9421	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016206	GAAA	3	10418	10429	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016206	TGAG	4	11548	11563	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016206	AAAG	3	11712	11722	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016206	TA	6	12736	12747	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016206	TA	6	13011	13022	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016206	CTTT	3	13393	13403	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016206	CTT	4	14114	14125	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016206	TGGT	3	15089	15100	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016206	GGAC	3	15157	15167	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016206	TA	6	16208	16219	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016206	AGA	4	16639	16649	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016206	CGGG	3	16934	16946	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016206	AG	6	16969	16979	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016206	AAAGA	3	17026	17041	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_016206	GA	6	17697	17707	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016206	GAAAG	3	17721	17735	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016206	AG	6	17887	17897	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016206	AGGA	3	18767	18778	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016206	TAT	4	19253	19263	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016206	TGTA	3	19697	19708	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016206	GTCT	3	19848	19859	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016206	TGT	4	20482	20492	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016206	TA	6	20620	20630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016206	TTC	4	21052	21063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016206	GCTT	3	23449	23460	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016206	AAGA	3	23774	23785	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016206	GAAA	3	24296	24306	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016206	TTTC	3	24371	24383	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
53	NC_016206	GCTT	3	24514	24524	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016206	TC	6	26109	26119	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016206	TAG	4	26864	26874	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016206	CTTT	3	27020	27030	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016206	CTAA	3	27748	27758	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016206	AAGA	4	27802	27817	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016206	CTAAT	3	28070	28083	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016206	TAAA	3	28233	28243	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016206	TA	6	28482	28492	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016206	AGAA	3	28548	28559	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016206	GAAGA	3	28738	28753	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016206	ACC	5	28831	28846	16	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016206	TA	6	30738	30750	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016206	TTAA	3	32109	32120	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016206	AGA	4	32991	33002	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016206	TTTG	3	34438	34449	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016206	TC	6	34457	34467	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016206	CCT	4	35576	35586	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016206	AT	6	35738	35749	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016206	TCTT	3	35865	35875	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016206	CCT	4	36037	36047	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016206	GCA	5	36176	36190	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016206	GAA	7	36191	36211	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016206	CG	6	36865	36876	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016206	TC	7	37024	37036	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016206	TC	6	37111	37121	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016206	TC	6	37472	37482	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016206	CT	6	37658	37668	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016206	AG	6	38021	38031	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016206	CTA	4	39356	39366	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016206	TA	8	39440	39454	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016206	CT	6	40214	40224	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016206	TAT	4	40402	40413	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016206	TAT	4	40723	40734	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016206	AAGA	4	41402	41416	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016206	TTTC	3	42229	42239	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016206	AAG	4	43118	43128	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016206	TTTA	3	43328	43339	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016206	GTGG	3	43757	43768	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016206	CCT	4	44332	44343	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016206	AG	6	44630	44640	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016206	CTTT	3	44745	44755	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016206	CTTTC	3	44927	44940	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016206	TAG	5	45468	45481	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016206	TCGC	3	45721	45733	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016206	TGGG	3	45813	45823	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016206	AAAG	3	46552	46564	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016206	TTC	4	46837	46848	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016206	TTACT	3	48064	48077	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016206	CCTC	3	48702	48713	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016206	AAG	5	49019	49032	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016206	GTTT	3	49093	49103	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016206	AGATT	3	50086	50100	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016206	TA	8	50491	50505	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_016206	TA	7	50939	50952	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016206	AT	6	51168	51178	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016206	TA	6	52329	52342	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016206	CGG	4	52418	52428	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016206	CTA	5	52807	52820	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016206	AGA	4	53989	53999	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016206	TA	7	54257	54270	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016206	AAAAAG	3	54423	54441	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_016206	TCTT	3	54675	54687	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
116	NC_016206	AGTC	3	55855	55866	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016206	CT	7	57501	57515	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016206	AGA	4	59543	59555	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016206	AGA	4	59678	59688	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016206	ACC	4	60262	60274	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016206	AT	6	60275	60285	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016206	CCTT	3	60572	60583	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016206	AGA	4	61142	61152	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016206	TAAG	3	61780	61791	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016206	ATGC	3	62926	62937	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016206	ATCT	3	62995	63006	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016206	GTA	4	63342	63352	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016206	CTT	4	64605	64616	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016206	GCTT	3	64736	64746	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016206	GAA	4	65167	65179	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016206	ACT	4	65654	65665	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016206	TA	10	67028	67046	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
133	NC_016206	TGC	4	67468	67479	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

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