ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016205	CCTTG	3	154	167	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016205	TTCC	3	1651	1662	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016205	CCA	4	1965	1976	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016205	TTAG	3	3330	3340	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016205	N	100	3729	3828	100	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016205	TAGT	4	4321	4335	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016205	CCTAT	3	4700	4713	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016205	AG	7	4798	4811	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016205	AGGC	3	5400	5411	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016205	AT	6	5525	5535	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016205	TA	6	5691	5701	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016205	CGA	4	5714	5724	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016205	CTT	4	5769	5781	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016205	AG	6	6418	6428	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016205	TAG	4	6832	6842	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016205	TATGAT	3	6871	6889	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
17	NC_016205	CTT	4	7091	7102	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016205	CTT	4	7109	7120	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016205	ACT	4	7293	7304	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016205	TAG	4	7522	7532	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016205	GA	6	7566	7577	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016205	AAGA	3	8698	8709	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016205	T	14	8857	8870	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016205	AAG	4	9077	9088	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016205	TC	6	9130	9140	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016205	ACGC	3	9733	9744	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016205	TTAA	3	9757	9768	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016205	GT	6	10247	10258	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016205	CT	6	10922	10932	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016205	CTTT	3	11633	11644	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016205	CTTAG	3	11939	11952	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016205	AAGG	3	13856	13867	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016205	TGGC	3	14559	14570	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016205	CCT	4	14835	14846	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016205	CTTT	3	15119	15131	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
36	NC_016205	CT	6	15222	15232	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016205	CT	6	15297	15307	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016205	TA	6	18682	18695	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016205	GCT	4	19450	19461	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016205	TAG	4	21161	21172	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016205	TTCT	4	22611	22625	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016205	GAA	6	25504	25522	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_016205	TA	9	25798	25815	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016205	CTTT	3	26082	26093	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016205	ATCA	3	26703	26714	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016205	AGAA	3	27258	27269	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016205	GAG	4	27643	27653	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016205	TA	7	29912	29924	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016205	AGA	4	30162	30172	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016205	AGA	4	31308	31318	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016205	GAAA	3	32428	32439	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016205	TGATG	3	32847	32861	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016205	AAG	4	32996	33006	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016205	CATAA	3	33678	33691	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016205	CAA	4	33755	33765	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016205	TTTTC	3	34303	34318	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016205	AGACG	3	34478	34491	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016205	CCATA	3	34654	34667	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016205	TAAG	3	35831	35842	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016205	AGA	4	35904	35915	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016205	AAAG	3	37083	37094	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016205	AT	6	37728	37739	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016205	AAG	5	38114	38128	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016205	CTTGGT	3	38201	38219	19	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
65	NC_016205	TTC	4	38935	38947	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016205	CTT	4	39543	39554	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016205	AAAG	3	42453	42463	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016205	TTTG	3	42879	42890	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016205	CCTT	3	43172	43182	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016205	AATT	3	43818	43829	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016205	TAGA	3	43880	43891	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016205	TGAA	3	44147	44157	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016205	GA	6	44161	44171	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016205	CT	6	46058	46068	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016205	AT	6	46469	46480	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016205	AAG	4	46740	46751	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016205	AAG	4	47784	47794	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016205	CATTC	3	48710	48723	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016205	CT	6	48728	48738	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016205	CT	6	49050	49060	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016205	CCT	4	49064	49075	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016205	CTA	4	49402	49413	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016205	AGA	4	50336	50347	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016205	AAG	4	51682	51692	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016205	CT	6	51995	52005	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion