ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arachnocampa flava mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016204	ATT	4	86	98	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016204	TTA	4	99	109	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016204	ATT	4	950	961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701819
4	NC_016204	ATT	4	2193	2203	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
5	NC_016204	GGA	4	2286	2296	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35701820
6	NC_016204	AAT	4	3220	3231	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701820
7	NC_016204	TAT	4	3433	3444	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
8	NC_016204	ATT	4	3873	3883	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
9	NC_016204	ATT	4	4037	4048	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016204	ATT	4	4456	4466	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
11	NC_016204	ATT	6	4780	4796	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35701820
12	NC_016204	TAT	5	5300	5313	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701820
13	NC_016204	ATT	4	5931	5942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
14	NC_016204	TAT	4	5984	5995	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
15	NC_016204	TAT	4	6041	6052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
16	NC_016204	TAA	4	6287	6298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016204	ATT	4	7029	7040	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
18	NC_016204	ATT	5	7449	7463	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701820
19	NC_016204	TAA	4	7559	7570	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35701820
20	NC_016204	ATT	4	7758	7769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
21	NC_016204	TAA	4	7993	8005	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701820
22	NC_016204	AAT	4	8271	8282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701820
23	NC_016204	ATA	4	8436	8448	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701820
24	NC_016204	TTA	4	8711	8723	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701820
25	NC_016204	CTT	4	8726	8737	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35701820
26	NC_016204	ATA	4	9707	9717	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701820
27	NC_016204	ATT	4	10080	10090	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016204	TAT	6	10154	10174	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
29	NC_016204	ATT	5	11021	11034	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701821
30	NC_016204	TAT	4	11230	11241	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701821
31	NC_016204	TTA	4	11367	11377	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701821
32	NC_016204	TAA	4	11905	11915	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701821
33	NC_016204	TAA	4	12540	12550	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701821
34	NC_016204	TAA	4	12850	12860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016204	TAT	4	12914	12925	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016204	TAA	4	13223	13233	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016204	TTA	4	13824	13834	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016204	TAT	4	13979	13991	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016204	ATT	6	14132	14149	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016204	AAT	4	15042	15053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016204	TAA	4	15259	15269	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016204	TAA	4	15478	15488	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016204	TAA	4	15697	15707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016204	TAA	4	15916	15926	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016204	ATA	4	16566	16578	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016204	ATT	4	16743	16755	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016204	TTA	4	16756	16766	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016204	TAA	4	16817	16827	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016204	ATT	4	16874	16886	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Arachnocampa flava mitochondrion