ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Arachnocampa flava mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016204	ATT	4	86	98	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016204	TTA	4	99	109	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016204	T	12	110	121	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016204	AATT	3	135	146	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016204	T	13	391	403	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701819
6	NC_016204	ATT	4	950	961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701819
7	NC_016204	ATTTTA	3	1188	1205	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35701819
8	NC_016204	TTAA	3	1527	1538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016204	TTTA	3	1596	1606	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016204	GATT	3	1717	1727	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35701820
11	NC_016204	ATT	4	2193	2203	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
12	NC_016204	GGA	4	2286	2296	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35701820
13	NC_016204	GAAA	3	2404	2415	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35701820
14	NC_016204	ATTT	4	2792	2807	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35701820
15	NC_016204	AAT	4	3220	3231	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701820
16	NC_016204	TTAATT	3	3308	3325	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35701820
17	NC_016204	TAT	4	3433	3444	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
18	NC_016204	AAAT	3	3603	3613	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701820
19	NC_016204	ATT	4	3873	3883	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
20	NC_016204	AATT	3	4000	4011	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016204	ATT	4	4037	4048	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016204	T	13	4101	4113	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701820
23	NC_016204	TTTA	3	4431	4441	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701820
24	NC_016204	ATT	4	4456	4466	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
25	NC_016204	ATT	6	4780	4796	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35701820
26	NC_016204	AACAAT	3	4967	4984	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	35701820
27	NC_016204	T	13	5170	5182	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701820
28	NC_016204	TAT	5	5300	5313	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701820
29	NC_016204	TTTAA	3	5730	5745	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016204	ATT	4	5931	5942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
31	NC_016204	TAT	4	5984	5995	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
32	NC_016204	TAT	4	6041	6052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
33	NC_016204	TAA	4	6287	6298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016204	AT	12	6399	6421	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016204	A	14	6590	6603	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35701820
36	NC_016204	ATT	4	7029	7040	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
37	NC_016204	A	24	7153	7176	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35701820
38	NC_016204	ATT	5	7449	7463	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701820
39	NC_016204	TAA	4	7559	7570	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35701820
40	NC_016204	ATT	4	7758	7769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701820
41	NC_016204	TAA	4	7993	8005	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701820
42	NC_016204	AATTA	4	8201	8219	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	35701820
43	NC_016204	AAAT	3	8222	8232	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701820
44	NC_016204	AAT	4	8271	8282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701820
45	NC_016204	AAAT	3	8403	8414	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701820
46	NC_016204	ATA	4	8436	8448	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701820
47	NC_016204	TTA	4	8711	8723	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701820
48	NC_016204	CTT	4	8726	8737	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35701820
49	NC_016204	AAAT	3	9274	9284	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701820
50	NC_016204	AAAAT	3	9363	9376	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701820
51	NC_016204	TAAA	3	9462	9472	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701820
52	NC_016204	ATAA	3	9569	9580	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35701820
53	NC_016204	AT	6	9646	9656	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35701820
54	NC_016204	ATA	4	9707	9717	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701820
55	NC_016204	ATT	4	10080	10090	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016204	TAT	6	10154	10174	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701820
57	NC_016204	TTTA	3	10326	10337	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	35701820
58	NC_016204	ATTT	4	10575	10590	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35701820
59	NC_016204	T	14	10936	10949	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701821
60	NC_016204	AT	8	10990	11004	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35701821
61	NC_016204	ATT	5	11021	11034	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701821
62	NC_016204	TAT	4	11230	11241	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701821
63	NC_016204	TTA	4	11367	11377	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701821
64	NC_016204	ATTA	3	11794	11805	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	35701821
65	NC_016204	TAA	4	11905	11915	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701821
66	NC_016204	TAAA	3	12105	12115	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701821
67	NC_016204	TAAA	3	12352	12363	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701821
68	NC_016204	TAA	4	12540	12550	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701821
69	NC_016204	TAA	4	12850	12860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016204	TAT	4	12914	12925	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016204	TAA	4	13223	13233	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016204	TTA	4	13824	13834	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016204	ATTT	3	13873	13885	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016204	TAT	4	13979	13991	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016204	TTTCA	3	14094	14108	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
76	NC_016204	ATT	6	14132	14149	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_016204	TAATT	3	14236	14249	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016204	CTAATA	3	14712	14728	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016204	TTTA	3	14861	14872	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016204	AAT	4	15042	15053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016204	TTAA	3	15209	15219	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016204	TAA	4	15259	15269	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016204	TTAA	3	15428	15438	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016204	TAA	4	15478	15488	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016204	TTAA	3	15647	15657	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016204	TAA	4	15697	15707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016204	TTAA	3	15866	15876	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016204	TAA	4	15916	15926	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016204	T	24	16082	16105	24	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
90	NC_016204	AAAATA	3	16106	16124	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
91	NC_016204	AT	14	16219	16245	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016204	AT	8	16256	16270	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016204	AT	11	16511	16533	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016204	ATA	4	16566	16578	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016204	TA	9	16614	16631	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_016204	TG	14	16628	16655	28	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016204	ATT	4	16743	16755	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016204	TTA	4	16756	16766	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016204	T	12	16767	16778	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016204	AT	11	16775	16796	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016204	TAA	4	16817	16827	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016204	ATT	4	16874	16886	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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