ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Protoplasa fitchii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016202	ATA	4	489	501	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701817
2	NC_016202	TAT	4	680	691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701817
3	NC_016202	ATT	5	858	871	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701817
4	NC_016202	CTTTA	3	955	968	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	35701817
5	NC_016202	TAAT	3	1373	1383	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016202	GGA	4	2112	2122	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35701817
7	NC_016202	GAAA	3	2230	2241	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35701817
8	NC_016202	TTAATT	3	3134	3151	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35701817
9	NC_016202	TTTA	3	3931	3943	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	35701817
10	NC_016202	TTAAT	3	4269	4283	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	35701817
11	NC_016202	TTA	4	4623	4634	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701817
12	NC_016202	TATTT	3	4983	4997	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	35701817
13	NC_016202	TAT	5	5592	5606	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701817
14	NC_016202	CTTT	3	6180	6190	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016202	ATTTAT	3	6205	6223	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_016202	AAAT	3	6395	6405	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701817
17	NC_016202	TTA	4	7244	7255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701817
18	NC_016202	AAG	4	7493	7504	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35701817
19	NC_016202	TAA	4	7787	7799	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701817
20	NC_016202	TAAAAA	3	8058	8075	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	35701817
21	NC_016202	CAAAA	3	8176	8189	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	35701817
22	NC_016202	AATATT	3	8230	8248	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	35701817
23	NC_016202	TCT	4	8523	8534	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35701817
24	NC_016202	TAAA	3	8715	8726	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701817
25	NC_016202	AATT	3	8745	8757	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35701817
26	NC_016202	AAT	4	8969	8980	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701817
27	NC_016202	AAAAT	3	9164	9177	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701817
28	NC_016202	TAA	5	9216	9230	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35701817
29	NC_016202	TAA	4	9401	9412	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701817
30	NC_016202	ATAA	3	9635	9646	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701818
31	NC_016202	TAAA	5	9662	9682	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701818
32	NC_016202	AATA	3	9781	9792	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701818
33	NC_016202	AGAA	3	9870	9881	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016202	ATTTT	3	10216	10229	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	35701818
35	NC_016202	T	14	10724	10737	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701818
36	NC_016202	AT	7	10778	10790	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35701818
37	NC_016202	TAG	4	10801	10812	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35701818
38	NC_016202	ATTT	3	11047	11057	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701818
39	NC_016202	TAT	5	11156	11170	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701818
40	NC_016202	ATT	4	11674	11684	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701818
41	NC_016202	TAAA	3	11685	11696	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35701818
42	NC_016202	AATT	3	11717	11728	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35701818
43	NC_016202	TAAA	3	12134	12145	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701818
44	NC_016202	TAAAA	3	12284	12297	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701818
45	NC_016202	TAA	4	12571	12583	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701818
46	NC_016202	TTTTA	3	13071	13086	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016202	A	12	13100	13111	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016202	TAAA	3	13170	13180	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016202	TTCA	3	13219	13230	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016202	TAA	4	13514	13524	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016202	TAAA	3	13968	13979	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016202	ATTT	3	14249	14260	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016202	ATA	4	14341	14351	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016202	ATT	4	14938	14948	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016202	TAAAT	4	15000	15018	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016202	ATAA	4	15022	15037	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_016202	ATT	4	15135	15145	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016202	TAAAT	4	15197	15215	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_016202	ATAA	4	15219	15234	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016202	ATT	4	15332	15342	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016202	TAAAT	4	15394	15412	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016202	ATAA	4	15416	15431	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016202	ATT	4	15529	15539	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016202	TAAAT	4	15591	15609	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_016202	ATAA	4	15613	15628	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016202	ATT	4	15726	15736	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016202	TAAAT	4	15788	15806	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_016202	TA	13	15832	15855	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016202	AT	12	15860	15884	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016202	TA	7	15891	15904	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016202	TTTC	3	15910	15921	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016202	TA	9	15987	16003	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_016202	TATAAT	3	16102	16119	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Protoplasa fitchii mitochondrion