ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ptychoptera sp. ATB-2011 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016201	TAA	4	444	456	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701815
2	NC_016201	TAT	7	666	686	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701815
3	NC_016201	ATTT	3	808	819	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35701815
4	NC_016201	TTAA	3	1248	1260	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016201	TATT	3	2809	2821	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	35701815
6	NC_016201	TTTA	3	3172	3182	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701815
7	NC_016201	CTT	4	3281	3292	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35701815
8	NC_016201	TTA	4	3840	3851	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016201	A	23	3974	3996	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35701816
10	NC_016201	AAT	4	5779	5790	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701816
11	NC_016201	TTAA	3	6247	6258	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016201	ATT	4	6392	6402	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701816
13	NC_016201	A	14	6614	6627	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	35701816
14	NC_016201	A	19	6901	6919	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	35701816
15	NC_016201	AAT	4	7308	7318	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701816
16	NC_016201	AAG	4	7447	7458	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35701816
17	NC_016201	ATT	4	7506	7517	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701816
18	NC_016201	AGA	4	8220	8231	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35701816
19	NC_016201	AAAATT	4	8919	8942	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701816
20	NC_016201	AAAT	4	9030	9044	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	35701816
21	NC_016201	AAAAT	3	9119	9132	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701816
22	NC_016201	TAAAA	3	9350	9363	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701816
23	NC_016201	ATA	5	9437	9451	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35701816
24	NC_016201	AAATAA	3	9713	9730	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	35701816
25	NC_016201	AGAA	3	9825	9836	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016201	TAA	5	10146	10160	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35701816
27	NC_016201	ATTT	3	11003	11013	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701816
28	NC_016201	TTA	4	11131	11142	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701816
29	NC_016201	AATAA	3	11669	11683	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	35701816
30	NC_016201	TAA	4	12031	12042	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	35701816
31	NC_016201	TAAA	3	12095	12106	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701816
32	NC_016201	TAA	4	12283	12293	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701816
33	NC_016201	TAA	4	12532	12544	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701816
34	NC_016201	TTA	4	13387	13398	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016201	ATA	4	13403	13414	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016201	ATT	4	13481	13492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016201	TAAA	3	13596	13607	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016201	AAAT	3	13619	13630	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016201	ATT	4	13927	13938	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016201	TAAA	4	13938	13953	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016201	TTAA	3	14029	14040	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016201	AATT	5	14195	14214	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_016201	ATT	4	14589	14600	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016201	TTAA	3	14719	14729	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016201	AATT	3	14770	14780	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016201	TAAAA	4	14802	14822	21	80 %	20 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
47	NC_016201	T	13	15002	15014	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016201	AT	15	15065	15092	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ptychoptera sp. ATB-2011 mitochondrion