ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Kallima inachus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016196	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016196	ATTA	3	917	928	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35701809
3	NC_016196	ATT	4	1038	1050	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701809
4	NC_016196	GAAA	3	2232	2243	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	35701809
5	NC_016196	ATTT	4	2473	2488	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35701809
6	NC_016196	ATAATT	4	2837	2860	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35701809
7	NC_016196	AATT	3	3262	3274	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35701809
8	NC_016196	CATTA	3	3330	3343	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	35701809
9	NC_016196	AATT	3	3694	3704	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35701809
10	NC_016196	AATT	3	3715	3725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35701809
11	NC_016196	TTTATT	3	3893	3910	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	35701809
12	NC_016196	ATAA	3	3961	3973	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35701809
13	NC_016196	ATT	4	4102	4114	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701809
14	NC_016196	TCATTA	4	4325	4348	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	35701809
15	NC_016196	TCAA	3	4699	4710	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	35701809
16	NC_016196	ATTA	4	5530	5545	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016196	TAA	4	5580	5591	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701809
18	NC_016196	ATTT	3	5620	5630	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701809
19	NC_016196	ATT	5	5843	5856	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701809
20	NC_016196	ATTT	3	6159	6170	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016196	ATA	5	6299	6314	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35701809
22	NC_016196	TAAA	3	6341	6352	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35701809
23	NC_016196	AATT	3	6359	6369	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35701809
24	NC_016196	TAAA	3	6483	6493	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701809
25	NC_016196	TTA	4	7166	7177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701809
26	NC_016196	ATA	4	7271	7282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701809
27	NC_016196	TGAA	3	7359	7369	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	35701809
28	NC_016196	AAATTA	3	7553	7570	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35701809
29	NC_016196	TAA	4	7709	7721	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701809
30	NC_016196	AGA	4	7812	7822	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35701809
31	NC_016196	TAT	4	7917	7928	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701809
32	NC_016196	TAA	4	7968	7978	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701809
33	NC_016196	AAAAAT	3	7981	7998	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	35701809
34	NC_016196	TAA	4	8155	8169	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35701809
35	NC_016196	ATA	5	8886	8899	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701809
36	NC_016196	ATT	4	8925	8935	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701809
37	NC_016196	AAAAT	3	9090	9103	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701809
38	NC_016196	TAA	5	9145	9158	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701809
39	NC_016196	TAT	10	9334	9362	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701809
40	NC_016196	AT	7	9551	9565	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35701810
41	NC_016196	A	15	9592	9606	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	35701810
42	NC_016196	ATT	4	9829	9840	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016196	ATT	5	10041	10055	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701810
44	NC_016196	TAA	4	10298	10309	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701810
45	NC_016196	TTTA	4	10306	10321	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35701810
46	NC_016196	GTA	4	10330	10341	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35701810
47	NC_016196	TTA	4	10760	10771	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701810
48	NC_016196	ATTT	3	10950	10960	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701810
49	NC_016196	ATTTTA	3	11105	11122	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35701810
50	NC_016196	TTTATT	3	11374	11392	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	35701810
51	NC_016196	TAAT	3	11539	11550	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	35701810
52	NC_016196	ATAA	3	11699	11710	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701810
53	NC_016196	TAA	4	12153	12165	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701810
54	NC_016196	TAAAA	3	12225	12238	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701810
55	NC_016196	AT	7	12581	12595	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016196	AT	6	12628	12638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016196	T	13	12704	12716	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016196	TTTA	3	12947	12957	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016196	TAAT	3	13001	13012	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016196	TTAAAT	3	13436	13454	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_016196	AATT	3	13949	13959	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016196	ATTA	3	13972	13983	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016196	TTAA	4	14138	14153	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016196	TAT	4	14287	14298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016196	ATTAA	3	14523	14542	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_016196	TTAA	3	14571	14581	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016196	TAATT	3	14602	14616	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016196	ATT	4	14716	14728	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016196	T	22	14833	14854	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016196	TA	13	15039	15063	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016196	AT	6	15073	15084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Kallima inachus mitochondrion