ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Penicillium solitum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016187	TAT	4	200	212	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016187	AT	6	262	273	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016187	ATA	6	462	478	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	35719663
4	NC_016187	GTA	4	528	538	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	35719663
5	NC_016187	AT	9	1093	1109	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_016187	TA	6	1111	1122	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016187	TAT	4	1130	1141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016187	AT	7	1224	1238	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016187	TAA	5	1300	1313	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016187	TAT	4	1547	1557	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016187	AGT	4	1571	1582	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016187	TTAT	3	2493	2504	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016187	TA	6	2942	2952	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016187	AT	6	3005	3018	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016187	ATT	4	3138	3150	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016187	TATTT	4	3422	3441	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	35719664
17	NC_016187	AT	6	3607	3617	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35719664
18	NC_016187	AAC	4	3973	3984	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	35719664
19	NC_016187	TCT	4	4170	4181	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35719664
20	NC_016187	TAT	5	4300	4313	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35719664
21	NC_016187	TA	7	5172	5187	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016187	A	14	5428	5441	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016187	TA	7	5590	5602	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016187	GAATTA	3	6376	6394	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_016187	ATTA	3	6843	6854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016187	AGT	4	7203	7215	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016187	ATA	4	7626	7638	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_016187	TAT	4	7713	7724	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016187	TAAAA	3	7765	7778	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016187	CAAG	3	7817	7828	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016187	TA	6	8495	8506	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016187	ATT	5	8528	8542	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016187	TTA	4	9059	9071	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016187	ATT	4	9101	9112	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016187	AT	8	9187	9202	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016187	AATA	3	9637	9647	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016187	A	14	9970	9983	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016187	TAA	4	11308	11318	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016187	CTTAAG	3	11570	11586	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016187	TTAA	3	11717	11727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016187	TAA	5	12344	12358	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_016187	TTTATT	3	12931	12948	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	35719664
43	NC_016187	TTA	6	13187	13204	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	35719664
44	NC_016187	TGG	4	13276	13287	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	35719664
45	NC_016187	TA	7	14196	14210	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016187	TTA	4	14225	14235	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016187	TA	8	14294	14309	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016187	ATA	4	14643	14654	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016187	ATA	4	15314	15325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35719664
50	NC_016187	ATGAAA	3	15419	15436	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	35719664
51	NC_016187	ATA	5	15437	15451	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35719664
52	NC_016187	TA	6	16233	16243	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35719664
53	NC_016187	TA	6	16767	16777	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016187	TA	6	16788	16799	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016187	ACA	4	16905	16916	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016187	GTTA	3	16956	16966	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35719664
57	NC_016187	TTA	4	17330	17342	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016187	ATAAAA	3	17494	17512	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_016187	ATA	4	17625	17636	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35719664
60	NC_016187	ATT	4	17818	17828	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35719664
61	NC_016187	TTA	4	18245	18256	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35719664
62	NC_016187	AAT	4	18536	18547	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35719664
63	NC_016187	TA	6	18569	18579	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35719664
64	NC_016187	TAA	4	18614	18625	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35719664
65	NC_016187	ATAA	3	19192	19204	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35719664
66	NC_016187	A	13	19285	19297	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016187	ATT	4	20785	20796	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35719664
68	NC_016187	TAA	4	21771	21781	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016187	T	13	21834	21846	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016187	TATT	3	21900	21911	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016187	TTAT	3	22468	22478	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35719665
72	NC_016187	TTA	4	22500	22510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35719665
73	NC_016187	TTA	4	22628	22639	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35719665
74	NC_016187	AT	7	22794	22806	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35719665
75	NC_016187	AT	9	23705	23722	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_016187	AT	8	23815	23830	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016187	TATT	4	23838	23853	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_016187	AAATAT	3	23897	23915	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	35719665
79	NC_016187	TAT	4	25083	25094	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016187	TA	6	25098	25108	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016187	TA	6	25126	25136	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016187	AT	14	25321	25347	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016187	ATAA	6	25473	25494	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016187	TAAT	3	25958	25970	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35719665
85	NC_016187	GTAT	5	26648	26666	19	25 %	50 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_016187	ATA	4	26673	26683	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016187	TA	7	26776	26788	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016187	TTA	4	26805	26819	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35719665
89	NC_016187	TTA	4	27237	27248	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35719665
90	NC_016187	ATT	4	27416	27427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35719665
91	NC_016187	TAT	5	28156	28170	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35719665
92	NC_016187	TAT	8	28420	28443	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Penicillium solitum mitochondrion