ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 87

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016177	CTTT	3	777	787	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016177	TAG	4	877	887	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016177	TGA	4	1284	1295	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016177	TCT	5	1640	1653	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016177	AT	8	2277	2291	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016177	AAAG	3	2292	2302	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016177	GA	7	3003	3015	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016177	TA	6	4508	4519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016177	GAAAA	3	5022	5036	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016177	TC	6	5466	5476	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016177	AGT	4	5842	5852	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016177	CATT	3	6898	6910	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016177	CG	6	7304	7314	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016177	GT	6	8292	8302	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016177	GAT	4	9421	9432	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016177	TA	7	11101	11114	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016177	AAAT	3	11668	11678	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016177	TTGC	3	12254	12264	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016177	AGAA	3	12886	12897	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016177	GCAA	3	12973	12983	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016177	CAA	4	13337	13348	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016177	AG	6	13527	13537	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016177	TTCT	3	13668	13679	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016177	GTAT	3	15293	15304	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016177	TCTTT	3	15406	15420	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016177	CTATA	3	15980	15993	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016177	TTCATA	3	16874	16891	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
28	NC_016177	TCCAG	3	17281	17294	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
29	NC_016177	TGC	4	17911	17923	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016177	CT	6	18434	18444	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016177	TTC	4	18930	18940	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016177	AAGGA	4	19071	19091	21	60 %	0 %	40 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016177	GAA	4	19518	19528	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016177	CTT	4	19824	19834	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016177	TGC	4	19906	19917	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016177	TA	7	20900	20912	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016177	TCTT	4	21737	21752	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
38	NC_016177	AAAG	3	21834	21846	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016177	CTT	4	23179	23189	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016177	GA	8	23395	23409	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_016177	AAGT	3	23650	23660	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016177	TCTT	3	24181	24192	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016177	AAAAGA	3	24342	24359	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016177	AG	6	24865	24875	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016177	AGA	4	25214	25224	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016177	AATT	3	25440	25452	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016177	TA	6	26230	26240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016177	TTCT	3	27795	27805	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016177	TCT	4	28132	28143	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016177	AGAA	3	28248	28259	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016177	ATTA	3	29570	29581	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016177	AAGA	3	29772	29783	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016177	TCCC	3	29809	29819	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016177	AAGA	3	30373	30384	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016177	CTG	4	31911	31921	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016177	TACA	3	32108	32118	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016177	GAAA	3	32444	32454	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016177	CGC	4	33444	33455	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016177	GCA	5	33496	33510	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016177	AACT	3	35446	35456	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016177	AAG	4	35898	35909	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016177	TAGC	3	36418	36428	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016177	CT	6	37063	37073	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016177	CCCT	3	38515	38525	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016177	GAA	5	38928	38942	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016177	TC	6	39079	39089	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016177	GAA	4	39630	39641	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016177	AAG	4	39891	39902	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016177	CT	6	40417	40427	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016177	AGA	5	40893	40907	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016177	TA	6	42420	42431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016177	TC	6	42681	42691	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016177	CTTT	4	42797	42812	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016177	AAAG	3	42858	42869	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016177	CAAG	3	43114	43124	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016177	GA	6	43840	43850	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016177	AG	6	43901	43911	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016177	TTATGA	3	45459	45476	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016177	CTAT	3	45903	45914	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016177	GAAAG	3	47068	47082	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016177	CTT	5	48150	48163	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016177	GCCTT	3	48333	48347	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
83	NC_016177	GCCT	3	49259	49269	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016177	GTTG	3	49387	49399	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016177	ATGG	3	50627	50638	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016177	GCG	4	53252	53263	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016177	CTT	4	53379	53389	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016177	CGGG	3	53747	53757	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016177	AATT	3	54408	54420	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016177	ATA	4	54926	54937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016177	GA	7	55026	55038	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016177	TAAA	3	55496	55507	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016177	CTA	4	55797	55808	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016177	TGC	4	56080	56091	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016177	TCTT	4	56107	56121	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016177	TCT	4	57081	57093	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016177	TAT	4	59276	59286	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016177	TC	7	61978	61990	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016177	TCTT	3	62116	62127	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016177	AGG	4	63516	63527	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016177	AT	7	65207	65222	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016177	AAAG	3	65371	65382	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016177	TAC	5	66619	66634	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
104	NC_016177	CTT	4	66720	66730	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016177	CAAT	3	67597	67608	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016177	CTA	4	68036	68047	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016177	GAG	4	68599	68609	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016177	TCTA	3	68886	68896	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016177	TA	6	69037	69048	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016177	TC	7	69130	69142	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016177	AGA	4	69249	69259	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016177	GAAA	3	71144	71155	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016177	CTTC	3	71323	71334	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016177	GA	7	72286	72298	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016177	CTTT	3	72668	72680	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding

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