ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sylvicola fenestralis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016176	AT	7	129	142	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016176	AAT	4	536	547	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701786
3	NC_016176	TAT	5	710	723	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35701786
4	NC_016176	TTAATT	3	885	903	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	35701786
5	NC_016176	CATTA	3	1099	1112	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	35701786
6	NC_016176	CTT	4	2054	2065	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	35701786
7	NC_016176	GAG	4	2143	2153	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35701786
8	NC_016176	TTAATT	3	3173	3190	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35701787
9	NC_016176	ATT	4	3334	3344	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701787
10	NC_016176	TTTA	3	3974	3984	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701787
11	NC_016176	TTAA	3	4140	4151	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35701787
12	NC_016176	ACTT	3	4590	4600	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	35701787
13	NC_016176	TATTTT	3	5894	5912	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	35701787
14	NC_016176	ATT	4	6534	6544	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701787
15	NC_016176	TTA	5	6821	6835	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701787
16	NC_016176	TTA	4	7340	7351	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701787
17	NC_016176	AAG	4	7589	7600	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35701787
18	NC_016176	ATT	4	7648	7659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701787
19	NC_016176	AAAT	3	7684	7694	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701787
20	NC_016176	AACCC	3	7843	7857	15	40 %	0 %	0 %	60 %	6 %	35701787
21	NC_016176	TAA	4	7883	7895	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701787
22	NC_016176	ATA	4	8330	8342	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701787
23	NC_016176	AGA	4	8358	8369	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	35701787
24	NC_016176	TCTAAT	3	8847	8864	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	35701787
25	NC_016176	ATAA	4	9050	9065	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	35701787
26	NC_016176	AAAT	3	9091	9101	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701787
27	NC_016176	AAAT	3	9171	9181	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701787
28	NC_016176	AAAAT	3	9260	9273	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701787
29	NC_016176	TAT	4	9384	9395	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701787
30	NC_016176	TAAAAA	4	9746	9769	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	35701787
31	NC_016176	AATA	3	9877	9888	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	35701787
32	NC_016176	AAG	4	9965	9977	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016176	TTAT	3	10072	10082	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701787
34	NC_016176	TTTA	3	10221	10232	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	35701787
35	NC_016176	ATT	4	10340	10350	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701787
36	NC_016176	T	14	10823	10836	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701787
37	NC_016176	TAT	4	10909	10920	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	35701787
38	NC_016176	ATTT	3	11146	11156	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701787
39	NC_016176	TAT	4	11255	11265	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701787
40	NC_016176	TAT	4	11640	11650	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701787
41	NC_016176	GAA	4	12145	12155	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	35701788
42	NC_016176	ATA	4	12181	12191	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701788
43	NC_016176	TAAA	3	12243	12254	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701788
44	NC_016176	TAAAA	3	12393	12406	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701788
45	NC_016176	TAA	4	12431	12441	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701788
46	NC_016176	AAT	4	12451	12462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701788
47	NC_016176	TAA	4	12680	12692	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701788
48	NC_016176	TCAT	3	13087	13098	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016176	TAAA	3	13259	13269	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016176	AATATT	3	13548	13565	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016176	TTAAA	3	13578	13593	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016176	TA	6	14429	14439	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016176	TA	13	14684	14708	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016176	AAATTA	3	14746	14763	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016176	TTAA	3	14877	14887	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016176	TAT	4	14908	14918	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016176	TA	12	15836	15858	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016176	TA	13	16055	16080	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016176	ATA	4	16174	16184	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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