ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Paracladura trichoptera mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016173	ATA	4	64	74	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016173	TATAA	3	432	445	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	35701782
3	NC_016173	TAT	5	725	739	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35701782
4	NC_016173	TATTT	4	1543	1561	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	35701782
5	NC_016173	AAAT	3	1680	1691	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35701782
6	NC_016173	TTTC	3	2103	2114	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35701782
7	NC_016173	CAT	4	2513	2523	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35701782
8	NC_016173	TTTA	3	2952	2963	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35701782
9	NC_016173	TTTC	3	3166	3176	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	35701782
10	NC_016173	ATA	4	3195	3205	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701782
11	NC_016173	TA	9	3393	3410	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016173	TAAA	3	3483	3493	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016173	TAA	4	3538	3549	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016173	ATTAAT	3	4362	4379	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_016173	TTAA	3	4789	4800	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016173	AAAT	3	4983	4994	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016173	TAA	4	4998	5009	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016173	TAA	4	5516	5526	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016173	TTAA	3	5687	5697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016173	TAA	4	6021	6033	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701782
21	NC_016173	ATT	4	6347	6358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701782
22	NC_016173	TAATT	3	6525	6539	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	35701782
23	NC_016173	TTA	4	6707	6718	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35701782
24	NC_016173	ATA	4	6719	6730	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701782
25	NC_016173	ATTT	3	6748	6759	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35701782
26	NC_016173	TTAA	3	6940	6952	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016173	TAA	4	7062	7073	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701783
28	NC_016173	TTAA	3	7446	7457	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35701783
29	NC_016173	TAT	4	7895	7905	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701783
30	NC_016173	AAT	4	8187	8198	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35701783
31	NC_016173	ATTT	3	8968	8978	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701783
32	NC_016173	AAT	4	9448	9458	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701783
33	NC_016173	AGAAAA	3	9899	9917	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	35701783
34	NC_016173	TAA	4	10741	10753	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701783
35	NC_016173	AAAAT	3	12135	12148	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35701783
36	NC_016173	TAAA	3	12175	12187	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	35701783
37	NC_016173	CAAAA	4	12199	12217	19	80 %	0 %	0 %	20 %	5 %	35701783
38	NC_016173	T	14	13200	13213	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35701783
39	NC_016173	ATCT	3	13379	13389	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	35701783
40	NC_016173	ATTT	3	13523	13533	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35701783
41	NC_016173	CAAT	3	13892	13903	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	35701783
42	NC_016173	TAT	4	14017	14027	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35701783
43	NC_016173	TAA	4	14063	14073	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	35701783
44	NC_016173	AAAT	3	14103	14113	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35701783
45	NC_016173	ATA	4	14288	14300	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35701783
46	NC_016173	TCC	4	14353	14364	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	35701783
47	NC_016173	ACAAA	3	14691	14704	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	35701783
48	NC_016173	TAA	4	15554	15566	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016173	TTTAAA	3	15589	15606	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_016173	TAAAA	3	15766	15781	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016173	ATTA	3	15843	15854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Paracladura trichoptera mitochondrion